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基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
1
作者
梁一豪
赖颖君
+4 位作者
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期605-616,共12页
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和...
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。
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关键词
胃癌
基因芯片
生物信息学分析
差异表达基因
分子标志物
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职称材料
内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对CA199、CEA和CA125水平的影响
被引量:
10
2
作者
李伊敏
张镕宇
+3 位作者
柳娟
张志坚
卢艳娴
赖颖君
《中国老年学杂志》
CAS
北大核心
2022年第15期3663-3665,共3页
目的探讨内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对糖类抗原(CA)199、癌胚抗原(CEA)和CA125水平的影响。方法选择老年早期胃癌患者86例,依据手术方法分为观察组与对照组各43例。观察组行内镜黏膜下剥离术治疗,对照组行内镜黏膜下...
目的探讨内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对糖类抗原(CA)199、癌胚抗原(CEA)和CA125水平的影响。方法选择老年早期胃癌患者86例,依据手术方法分为观察组与对照组各43例。观察组行内镜黏膜下剥离术治疗,对照组行内镜黏膜下切除术治疗。比较两组手术指标、术后并发症变化、完全切除率和治愈性切除率,术前和术后1个月血清CA199、CEA和CA125水平变化,术前和术后6个月卡氏功能状态(KPS)评分及术后6个月复发情况。结果观察组术中出血量显著少于对照组,且手术时间和住院时间显著短于对照组(P<0.05)。观察组术后并发症显著少于对照组(P<0.05)。观察组完全切除率和治愈性切除率显著高于对照组(P<0.05)。两组术后1个月血清CA199、CEA和CA125水平显著低于术前(P<0.05);且观察组显著低于对照组(P<0.05)。两组术后6个月KPS评分显著高于术前(P<0.05);且观察组显著高于对照组(P<0.05)。两组术后6个月复发率无明显差异(P>0.05)。结论内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌患者疗效良好,术后并发症少,可降低血清CA199、CEA和CA125水平,提高患者生存质量,并降低复发。
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关键词
内镜黏膜下剥离术
早期胃癌
糖类抗原199
癌胚抗原
糖类抗原125
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职称材料
企业经济责任审计工作的实践与探索——基于A公司资金占用费特殊处理案例分析
3
作者
郑再杰
赖颖君
苏新龙
《现代商业》
2016年第21期153-155,共3页
伴随着企业所有权与经营权分离逐步加深、受托责任不断深化,企业内部经济责任审计对加强企业管理和干部监督发挥的作用日益扩大。相较于外部审计,内部审计更加知晓企业自身情况,所作出的会计建议及管理要求往往成为外部审计进行风险评...
伴随着企业所有权与经营权分离逐步加深、受托责任不断深化,企业内部经济责任审计对加强企业管理和干部监督发挥的作用日益扩大。相较于外部审计,内部审计更加知晓企业自身情况,所作出的会计建议及管理要求往往成为外部审计进行风险评估、控制的重要依托,同时也是影响注册会计师职业判断的一大因素。内部经济责任审计与注册会计师审计相互协调,相互制约,为企业财务信息的真实、客观架上双保险。本文结合A公司内部经济责任审计部门对于收取资金占用补偿会计处理方法的若干建议,进一步阐述内外部审计之间的互进关系。
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关键词
内部经济责任审计
注册会计师审计
资金占用补偿
会计职业判断
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职称材料
题名
基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
1
作者
梁一豪
赖颖君
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
机构
南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)检验科
南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)消化内科
南方医科大学第十附属医院(东莞市人民医院)病理科
出处
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第3期605-616,共12页
基金
广东省医学科学技术研究基金项目(A2021239)
东莞市人民医院科研培育项目(K202028)。
文摘
目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。
关键词
胃癌
基因芯片
生物信息学分析
差异表达基因
分子标志物
Keywords
gastric cancer
microarray
bioinformatics analysis
differentially expressed genes
molecular markers
分类号
R735.2 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对CA199、CEA和CA125水平的影响
被引量:
10
2
作者
李伊敏
张镕宇
柳娟
张志坚
卢艳娴
赖颖君
机构
东莞市人民医院消化内科
出处
《中国老年学杂志》
CAS
北大核心
2022年第15期3663-3665,共3页
基金
东莞市社会科技发展(一般)项目(201750715001287)。
文摘
目的探讨内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对糖类抗原(CA)199、癌胚抗原(CEA)和CA125水平的影响。方法选择老年早期胃癌患者86例,依据手术方法分为观察组与对照组各43例。观察组行内镜黏膜下剥离术治疗,对照组行内镜黏膜下切除术治疗。比较两组手术指标、术后并发症变化、完全切除率和治愈性切除率,术前和术后1个月血清CA199、CEA和CA125水平变化,术前和术后6个月卡氏功能状态(KPS)评分及术后6个月复发情况。结果观察组术中出血量显著少于对照组,且手术时间和住院时间显著短于对照组(P<0.05)。观察组术后并发症显著少于对照组(P<0.05)。观察组完全切除率和治愈性切除率显著高于对照组(P<0.05)。两组术后1个月血清CA199、CEA和CA125水平显著低于术前(P<0.05);且观察组显著低于对照组(P<0.05)。两组术后6个月KPS评分显著高于术前(P<0.05);且观察组显著高于对照组(P<0.05)。两组术后6个月复发率无明显差异(P>0.05)。结论内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌患者疗效良好,术后并发症少,可降低血清CA199、CEA和CA125水平,提高患者生存质量,并降低复发。
关键词
内镜黏膜下剥离术
早期胃癌
糖类抗原199
癌胚抗原
糖类抗原125
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
企业经济责任审计工作的实践与探索——基于A公司资金占用费特殊处理案例分析
3
作者
郑再杰
赖颖君
苏新龙
机构
上海创兴资源开发股份有限公司
厦门大学管理学院
出处
《现代商业》
2016年第21期153-155,共3页
文摘
伴随着企业所有权与经营权分离逐步加深、受托责任不断深化,企业内部经济责任审计对加强企业管理和干部监督发挥的作用日益扩大。相较于外部审计,内部审计更加知晓企业自身情况,所作出的会计建议及管理要求往往成为外部审计进行风险评估、控制的重要依托,同时也是影响注册会计师职业判断的一大因素。内部经济责任审计与注册会计师审计相互协调,相互制约,为企业财务信息的真实、客观架上双保险。本文结合A公司内部经济责任审计部门对于收取资金占用补偿会计处理方法的若干建议,进一步阐述内外部审计之间的互进关系。
关键词
内部经济责任审计
注册会计师审计
资金占用补偿
会计职业判断
分类号
F271 [经济管理—企业管理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析
梁一豪
赖颖君
袁燕文
袁炜
张锡波
张拔山
卢志锋
《南方医科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
内镜黏膜下剥离术对老年早期胃癌的治疗效果及对CA199、CEA和CA125水平的影响
李伊敏
张镕宇
柳娟
张志坚
卢艳娴
赖颖君
《中国老年学杂志》
CAS
北大核心
2022
10
下载PDF
职称材料
3
企业经济责任审计工作的实践与探索——基于A公司资金占用费特殊处理案例分析
郑再杰
赖颖君
苏新龙
《现代商业》
2016
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职称材料
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