蒙古马和纯血马免疫相关基因差异表达分析

为了评价蒙古马(Equus mongolian horse)和纯血马(E.thoroughbred)免疫生理机能在适应特殊生存环境和人工选择压力过程中相关基因的表达多样性。本研究对健康成年蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)的颈静脉血液进行RNA-Seq和品种间表达谱比较分析。对2岁左右健康蒙古马(n=3)和纯血马(n=3)采集肝脏、脾脏、肺脏和血液样品,利用qRT-PCR方法,分析NF-κB信号通路7个基因在两个品种中的表达情况。利用Western blot方法,分析蒙古马和纯血马肺脏中核因子κB亚基p65(RELA proto-oncogene NF-kB subunit,NF-κB p65)蛋白和白细胞介素1β(interleukin 1 beta,IL-1β)蛋白的表达情况。结果表明,RNA-Seq共获得19.69~23.95 Gb的高质量数据和1199个差异表达基因,许多差异表达基因直接参与机体的免疫过程。NF-κB信号通路7个基因在蒙古马和纯血马4个免疫组织中均表达,基因表达的品种间差异存在组织多样性;7个基因在蒙古马肺脏的表达量均高于纯血马,除肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF-α)基因差异不显著外(P≥0.05),其余基因均具有生物学统计意义(P<0.05)。NF-κB p65蛋白和IL-1β蛋白在蒙古马肺脏的表达量高于纯血马(P<0.05)。许多免疫相关基因在蒙古马和纯血马免疫组织之间差异表达,可能和蒙古马适应特定环境以及纯血马的运动性能定向选育有关。本研究结果为进一步研究蒙古马免疫功能适应特定环境的分子机制提供数据支持。

患子宫内膜炎母驴与健康母驴的阴道菌群差异分析

为探究患子宫内膜炎母驴阴道病原,本试验从规模化养殖场采集5份患子宫内膜炎母驴病料作为患病组,以6份健康母驴样本作为健康组,采用16S rDNA扩增子测序技术对2个组阴道分泌物样本中的菌群进行比较分析。结果显示,患病组母驴阴道菌群的多样性和丰富度均高于健康组;与健康组相比,患病组母驴阴道变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度显著增加,而梭杆菌门(Fusobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)和未分类菌门(Unidentified bacteria)显著降低(P<0.05);在属的分类水平上,患病组母驴阴道中链球菌属(Streptococcus)丰度显著高于健康组母驴(P<0.05),链球菌属可能是母驴子宫内膜炎的主要致病菌;在主成分分析上,患病组样本间的微生物群落差异较大,而健康组样品间的微生物组成相似;功能预测上,患病组阴道内微生物的免疫系统(Immune system)和传染性疾病(Infectious diseases)2个功能的相对丰度显著高于健康组,说明阴道内含有大量相关功能的微生物发挥着作用。本试验为母驴子宫内膜炎的后续预防和治疗提供参考依据。

马Toll样受体表达水平SYBR Green Ⅰ荧光定量RT-PCR检测方法的建立

旨在建立一种检测马Toll样受体(TLRs)mRNA表达水平的SYBR GreenⅠ荧光定量RT-PCR(Rverse Transcription-Polymerase Chain Reaction)方法。参照GenBank中马TLRs的基因序列保守区设计特异性引物,以马β肌动蛋白(β-actin)mRNA为内参,建立荧光定量RT-PCR方法。结果,扩增曲线在1×102～1×108copies.μL-1范围内有很好的线性关系,扩增相关系数在0.990以上,扩增效率在1.0左右。熔解曲线分析表明,产物为特异单峰,无引物二聚体,具有较高的特异性和灵敏度。重复性结果表明,该方法的组内、组间变异系数均小于3.50%,重复性较好。临床样品检测结果表明,TLR1、TLR2、TLR3、TLR4、TLR6、TLR7、TLR8和TLR9在骨髓中均有表达,其中TLR4mRNA表达水平最高,TLR9mRNA表达水平最低。本研究建立的检测方法能够成功用于临床样品的检测,为研究马匹TLRs在mRNA水平的定量分析提供技术平台。

蒙古马免疫组织NF-κB信号通路相关基因的表达研究

为丰富蒙古马NF-κB信号通路的研究内容,为蒙古马机体固有免疫调控的研究奠定理论基础,本研究采用实时荧光定量PCR和Western Blot方法,分析蒙古马肝脏、脾脏、肺脏和血液组织中NF-κB信号通路上7个基因的表达情况。结果表明,7个基因在4个组织中均有表达,但存在差异。NF-κB p50、IL-1β和NFKBIA基因在肺脏中的表达显著高于在肝脏、脾脏和血液中的表达,PTGS2基因在肺脏中的表达显著高于在肝脏中的表达。NF-κB p65蛋白在脾脏中表达较高,其次在肝脏、血液、肺脏;IL-1β蛋白在4个组织中的表达量依次为肺脏、脾脏、肝脏和血液。本实验结果为进一步研究NF-κB信号通路对蒙古马免疫调控的作用提供数据支持。

蒙古马皮肤肥大细胞两种染色方法的比较

为探讨不同染色方法对蒙古马皮肤肥大细胞(MC)显示的影响,本试验采用将蒙古马皮肤用Carnoy氏液固定,然后进行常规甲苯胺蓝-藏红O复染法和改良甲苯胺蓝-藏红O不同复染时间的染色方法,光镜下进行观察。结果表明,蒙古马皮肤采用改良甲苯胺蓝-藏红O复染5s染色方法(MTB-S)对肥大细胞有很好的染色效果。

内蒙古自治区马产业的现状与发展

文章指出了内蒙古自治区马产业发展存在的问题与困境,分析了内蒙古自治区马产业开发的可行性,提出了内蒙古自治区马产业发展的优势、思路和几点具体的建议。

山西数字台网同一台址数字与模拟观测系统的震级对比研究

将同一台址同一地震不同观测系统所测的数字震级与模拟震级进行统计,作回归分析,计算两者之间的相关值,比较它们的差异性。结果表明,模拟震级与数字震级相关程度较好,数字震级完全可以替代模拟震级。

山西省数字台网与模拟台网震级的对比研究

统计分析了山西省数字地震台网考核运行 3个月以来的记录地震的震级情况 ,将两套人机交互处理系统 (泰德和港震系统 )测定的速度震级及港震系统仿真后 (DD— 1)测得的位移震级 ,与山西省模拟台网 (即大同、太原、临汾、长治 9个模拟人工值守台 )所测定的位移震级进行了对比 ,研究了它们之间的相关程度、一致性、差异性 ,得出港震系统与泰德系统测定的速度震级与模拟震级、数字系统仿真 (DD— 1)后测定的位移震级与模拟震级相关系数均在 0 .940以上 。

山西数字与模拟地震台网的资料对比研究

山西数字遥测地震台网于 2 0 0 0年 1 0月 1日投入考核运行。为使数字遥测地震台网与模拟地震台网测定的时、空、强地震参数顺利接轨 ,尽快发挥数字资料在日常工作中的效益 ,将山西数字遥测地震台网产出的资料与模拟地震台网产出的资料作了全面细致的对比分析 ,研究了它们之间的相关程度、一致性、差异性。结果表明 ,数字地震观测系统比模拟地震观测系统具有更高的拾震率。得出山西数字遥测地震台网产出的资料与模拟地震台网产出资料相关性较好、定位结果在误差范围之内、符合《数字地震及前兆观测技术规范》要求的结论。

两个品种马骨髓基因表达谱分析

为了寻找不同品种马骨髓之间的差异表达基因,本研究构建了蒙古马-骨髓和纯血马-骨髓基因表达谱文库,经Illumina Miseq高通量测序,分别获得了7 219 956和7 116 170个有效reads;两个文库映射到11、8和1号染色体的reads最多,而映射到29、30和31号染色体的reads最少;两个文库共筛出318个差异表达基因,其中与免疫相关的基因有21个。GO功能富集分析结果表明差异表达基因与转运、细胞间信号传导、生物学过程和细胞质等有关;KEGG通路富集分析结果表明,差异最大的显著富集KEGG条目为神经系统。这些结果为研究马匹抗病力的遗传和免疫机理等提供基础数据。

水产养殖专业实用遗传检测技术教学改革与探索

实用遗传检测技术是水产养殖专业不可或缺的实验课程,是学生理解和掌握遗传学基本理论和实验技术的主要途径。在分析该课程实验教学存在问题的基础上,通过增加实验对象,引入新的问题导向学习(PBL)教学方法,优化评价及考核方式,加强教师素质修养,提高教学效果和教学质量,为农业院校实用遗传检测技术教学改革提供实践经验。

马毛色遗传的分子基础与应用

毛色不仅是马品种和个体识别的重要依据,而且还可以作为某些疾病筛查的有力工具和手段。马的毛色主要由黑色素细胞产生的真黑素和褐黑素两种黑色素的分布及比例所决定,许多基因对黑色素的产生和分布的调控起着重要的作用,各基因相互间共同作用最终形成各种单毛色和复毛色,这些基因主要包括MC1R、ASIP、KIT、TYRP和EDNRB。另外STX17、MATP和PMEL17也在马毛色形成过程具有重要的作用,同时还发现个别毛色基因与黑色素瘤疾病有关。文章对近年来马主要毛色候选基因的作用机理、DNA序列多态性与毛色性状及黑色素瘤疾病的关系等研究进行了详细的阐述,为今后马匹育种工作和疾病防治提供重要理论依据。

不同发酵时期酸马奶细菌群落结构

以聚合酶链式反应扩增16S r RNA基因序列采用454焦磷酸测序方法分析酸马奶传统发酵过程中细菌群落结构演替变化。结果表明:在发酵的初期细菌多样性最高,而细菌丰度在72 h时最高;硬壁菌门(Firmicutes)和变形菌门(Proteobacteria)为酸马奶中的优势细菌门;乳杆菌属(Lactobacillus)和乳球菌属(Lactococcus)为其优势细菌属;随着发酵时间的延长,各个细菌门与属都存在上升或下降的趋势变化。本研究可为其他乳制品发酵过程中细菌群落结构研究提供借鉴。

蒙古马骨髓间充质干细胞的分离培养及多向分化潜能的研究

旨在探索一个高效分离和扩增蒙古马骨髓间充质干细胞的方法,并通过形态学和多向分化能力进行鉴定。抽取蒙古马骨髓标本,利用密度梯度离心和差异贴壁法分离MSCs,体外扩增后传代,进行相差显微镜形态学观察。在地塞米松、IBMX、胰岛素及罗格列酮的作用下向脂肪细胞诱导分化,以及在地塞米松、VitC、β-磷酸甘油等作用下向成骨细胞诱导分化。结果显示原代和传代细胞呈梭形成纤维细胞样外观,生长增殖能力良好。经定向诱导分化后,细胞分别呈现脂肪细胞、成骨细胞的表型特征。证明所纯化的细胞为尚未分化的基质细胞,而不是组织的成体细胞,它具有多向分化潜能。

Kit基因对白马被毛褪色的影响

马毛色是品种鉴定和个体识别的重要依据,也是制定育种方案时必须考虑的重要性状之一。因此,研究马被毛褪色已成为当今国际马毛色研究领域的重要内容,试图弄清导致马被毛褪色的真正机理。目前已经发现,许多马种被毛褪色表型个体中3号染色体上的kit基因存在不同的显著突变。研究结果表明马kit基因的正常表达与否与表皮中黑色素细胞及黑色素的形成密切相关,从而控制是否出现褪色表型。然而,研究证明在不同马种间褪色表型个体在该位点上出现的突变存在着较大的种间差异。具有被毛完全褪色表型的马群非常少见,只是偶尔见于有些马种,但在内蒙古锡林郭勒盟西乌珠穆沁旗生存着较大数量的被毛褪色表型个体,被称为蒙古白马。然而,造成其被毛褪色的机理还没有得到证实,有趣的是至今为止在蒙古白马kit基因的21个外显子中还没有发现任何典型突变。因此,文章对近些年国际上对马被毛褪色的分子研究进展做一比较系统的综合叙述,为蒙古白马毛色形成的机理研究奠定基础,为今后的马匹毛色研究及其育种工作提供有价值的参考依据。

不同土层土壤理化生性状与反硝化酶活性N_2O排放通量的相关性研究

采用田间试验方法研究了干旱半干旱地区小麦田不同土层土壤理、化、生等因素与土壤反硝化酶活性、N2O排放通量的相关性。结果表明,在冬小麦生育期内,0—5cm土层土壤硝酸还原酶活性与相应土层土壤亚硝酸还原酶活性呈显著正相关,0—5cm,5—10cm土层土壤的温度与相应土层土壤硝酸还原酶活性呈显著负相关,土壤硝态氮含量和pH与土壤反硝化还原酶活性的相关性因土壤的不同土层而有差异;0—5cm,5—10cm土层土壤含水量,0—5cm,10—20cm土层土壤脲酶活性,5—10cm有机碳含量,硝酸还原酶活性与土壤中N2O排放通量呈显著正相关;5—10cm土层土壤温度、pH和10—20cm土层土壤磷酸酶活性、pH与之呈显著负相关。土壤N2O的排放主要是土壤反硝化作用的结果。

马属动物进化特征概述

马属动物丰富的化石材料,记录了其5 500万年的起源、迁徙、灭绝和进化,使其成为进化生物学的教研材料。马属动物于始新世时期出现于北美,称为始马。由于气候的变化,导致白令海峡水面的上升和下降,马属祖先曾陆续经由白令桥抵达欧亚古路,但是均没有留下现存物种后代。马属动物在北美持续演化,到上新世时,现代马属的最近祖先出现,即上新马。在接下来约3百万年间,马属动物经历快速的辐射进化,在不同的环境中占领生态位,形成包括马、驴和斑马3个主要亚属。促成现存马属物种在极短的时间内分离的主要原因,是马属典型的快速核型进化。随着马基因组精细图和驴基因组草图的完成,及分子生物学的研究,马属核型多样性的识别越来越精准。马属动物剧烈的染色体重排,让科学家们越来越相信,其异种杂交能够产生后代,后代没有繁殖能力的原因是马属动物基因组之间的高度相似,使得其杂种能够存活;但是由于核型的巨大差异,其杂种后代生殖细胞在减数分裂时,不能均衡的分配两套染色体,但这个猜测仍需要大量的试验来证实。

蒙古马高负荷运动训练前后转录组差异表达分析

旨在对蒙古马高负荷运动训练前后转录组差异表达进行分析。本试验对6匹进行了4个月高负荷运动训练的蒙古马进行研究,分别在训练前后两个时期采集肌肉样品,利用二代测序技术对肌肉样品建立转录组文库,对发生显著变化的差异基因进行GO功能富集和KEGG Pathway分析,寻找训练前后发生显著变化的代谢通路及相关候选基因。结果表明,在转录组筛选到的1 102个显著差异表达基因中,有299个在训练后发生下调,803个发生上调。这些差异基因被注释到3 398条GO term上。其中与运动学相关的生物学过程有:肌肉结构发育、心血管系统发育、循环系统发育、肌肉组织发育、肌肉器官发育、肌肉收缩和肌肉细胞分化等。对差异表达基因进行KEGG pathway分析,结果表明,差异基因被富集到如扩张型心肌病、肥厚型心肌病、心肌收缩、钙信号通路、肌动蛋白骨架调节等与运动相关的193条通路中。本研究结果为探究蒙古马强耐力的基本分子机理提供理论基础,同时也为理解蒙古马运动学特性提供新的思路。

以Cytb基因探讨家马的母系起源

本研究通过对目前GenBank中登录的所有家马Cytb基因的850nt(核苷酸)的同源序列进行比较分析,应用系统发育分析方法从分子水平探讨家马的母系起源及其驯化过程,以期为家马遗传资源的评价、保护与利用提供分子生物学依据。结果发现家马在该基因区域内存在丰富的多态现象,尤以蒙古马的变异最为丰富。系统发育分析结果发现,所有家马的该基因的同源序列聚为了A～G 7个分支。蒙古马具有多重母系起源,而韩国Jeju马的母系来源较单一。另外,普氏野马与蒙古马亲缘关系较近。

酸马奶发酵过程中理化指标与细菌相的动态变化

分析了酸马奶发酵过程中（0-96 h）部分理化指标以及细菌群落的变化情况。结果显示酸马奶发酵96 h内p H为下降趋势,发酵初期迅速酸化,发酵后期下降速度缓慢趋于稳定,最低达到p H3.54;总蛋白质、脂肪含量存在一定的起伏变化,72 h达到最高值;乳糖含量减少,而乳酸含量增加;葡萄糖、半乳糖、乙酸、丙酸含量在发酵过程中处于较低的水平;细菌群落结构分析结果显示酸马奶发酵过程中存在丰富的细菌多样性,并且群落结构有明显的演替变化。乳杆菌属（Lactobacillus）为优势细菌属,在酸马奶发酵过程中12-24 h呈现出上升的趋势,而24-48 h时其含量下降。研究结果表明不同发酵时间酸马奶营养价值存有差异。