银屑病和黑色素瘤共表达的核心基因筛选及潜在合并症机制分析

本研究应用生物信息学方法筛选银屑病和黑色素瘤共同表达的核心基因和分子机制,为后续研究提供新思路。从基因表达综合数据库下载黑色素瘤基因表达数据集(GSE7553、GSE15605)和银屑病基因表达数据集(GSE14905、GSE30999),鉴定出共同差异表达基因后进行GO和KEGG富集分析,使用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并筛选核心基因。随后,构建核心基因共表达网络以及进行GO、KEGG富集分析。使用GSE15605数据集和GSE30999数据集对筛选出的核心基因进行验证。最后,通过核心基因构建转录因子调控网络。本研究共筛选出10个核心基因:MMP9、COKN1A、ADIPOQ、FEN1、KRT19、DTL、TPX2、TYMS、PCK1和PIP。GO富集分析显示,核心基因功能主要与紫外线反应、DNA生物合成、光刺激等有关;KEGG富集分析显示,核心基因主要参与膀胱癌、脂肪因子信号通路、PPAR信号通路等代谢通路。RELA和NFKB1为调控核心基因的关键转录因子。本研究初步揭示了银屑病和黑色素瘤的合并发病分子机制,为银屑病和黑色素瘤“两病同治”的思路提供理论依据。

m^(6)A RNA甲基化调节因子与前列腺癌预后的关系

目的探索N6-甲基腺嘌呤(m^(6)A)RNA甲基化调节因子(以下简称m^(6)A调节因子)与前列腺癌预后的关系。方法从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载416例前列腺癌样本和80例癌旁样本的临床病理数据及其mRNA相关数据,获取METTL3、METTL14、WTAP、RBM15、ZC3H13、YTHDC1、YTHDC2、YTHDF1、YTHDF2、HNRNPC、FTO和ALKBH5共12种m^(6)A调节因子。筛选出前列腺癌样本差异表达的m^(6)A调节因子。对前列腺癌组织样本进行无监督聚类分组,并比较其总体生存率的差异。进行多因素Cox回归分析,根据风险评分分为高风险组和低风险组,比较2组生存率。对临床病理因素进行风险评分,构建多因素Cox回归模型,评估预后预测价值。采用免疫组织化学染色方法检测前列腺癌组织中METTL14和FTO的表达。结果从12个m^(6)A调节因子中筛选出8个差异表达的调节因子。通过无监督聚类分析将前列腺癌样本分成3组,分别为Cluster 1、Cluster 2和Cluster 3,3组的生存时间存在显著差异。多因素Cox回归分析发现,METTL14和FTO与前列腺癌患者的预后密切相关。构建Cox回归模型,对前列腺癌患者进行风险评分,发现高、低风险组总生存率有统计学差异,且风险评分可作为独立预后指标。前列腺癌组织中METTL14和FTO蛋白阳性表达率明显高于癌旁组织(P<0.05)。结论本研究构建了基于m^(6)A调节因子的前列腺癌预后预测模型,其中风险评分可作为独立的预后指标,METTL14和FTO可作为诊断前列腺癌的分子标志物和治疗的潜在靶点。