基于分子对接和分子动力学模拟技术筛选SARS-CoV-23CL蛋白酶抑制剂

目的 以分子对接和分子动力学模拟技术相结合的方法筛选得到严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2 (severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2) 3CL蛋白酶的小分子抑制剂。方法 基于SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的晶体结构(PDB ID:7K3T和7SI9),从PubChem数据库中筛选得到SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的特异性抑制剂nirmatrelvir的结构类似物,使用Autodock进行非共价分子对接,使用AutoDockFR进行共价分子对接,采用Pymol和Ligplot软件对SARS-CoV-2 3CL蛋白酶和小分子进行相互作用模式分析,最后使用AMBER18进行小分子化合物与SARS-CoV-2 3CL蛋白酶复合物的分子动力学模拟,进一步验证分子对接结果,使用SwissADME对化合物进行成药性分析。结果 将78个nirmatrelvir结构类似物与SARS-CoV-2 3CL蛋白酶进行虚拟筛选和分子对接,得到了2个与nirmatrelvir作用相当的小分子化合物(PubChem ID:57842182和156619968),共价对接发现化合物57842182和化合物156619968与SARS-CoV-2 3CL蛋白酶间不存在共价结合。分子动力学模拟结果表明化合物57842182、化合物156619968与SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的结合自由能(ΔE_(total))分别为-23.96 kcal·mol^(-1)和-27.11 kcal·mol^(-1),二者主要通过与MET165、GLU166、ASN142、CYS145、LEU50、MET49等氨基酸残基的相互作用占据SARS-CoV-2 3CL蛋白酶亚活性位点,具有潜在抑制SARS-CoV-2 3CL蛋白酶活性的功能。化合物57842182和化合物156619968的成药性略差于nirmatrelvir。结论 筛选得到的nirmatrelvir结构类似物57842182和156619968具有作为新型冠状病毒SARS-CoV-2 3CL蛋白酶小分子抑制剂的潜力,其与SARS-CoV-2 3CL蛋白酶的结合特点可为SARS-CoV-2 3CL蛋白酶抑制剂的药物设计提供线索。

抗金黄色葡萄球菌佐剂潜在靶点及化合物研究进展

目的对抗金黄色葡萄球菌佐剂潜在靶点及化合物的研究进展进行综述。方法查阅最近几年针对金黄色葡萄球菌的佐剂潜在靶点及化合物相关文献,总结不同佐剂靶点的应用及特点。结果目前有抑制外排泵、抑制酶及蛋白和干扰膜结构等几种主要佐剂靶点类型,其中,抑制外排泵和干扰膜结构研究的比较充分,抑制酶及蛋白的研究较少,部分靶点类型未知。结论抑制酶及蛋白可能具有一定的新型佐剂靶点潜力,可作为佐剂研究的主要方向,部分未知类型的佐剂也需要进一步探究,可能会为佐剂开发提供新的思路。

人类丝氨酸消旋酶的同源模建及其与多肽类抑制剂的分子对接

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类丝氨酸消旋酶(hSR)的三维结构,并利用profile-3D和procheck方法评估了模型的可靠性.在此基础上用分子对接程序(affinity)将多肽类抑制剂A和B分别与hSR进行对接,获得了其复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了此类抑制剂与hSR的具体结合方式,明确了hSR与此类抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基,为基于人类丝氨酸消旋酶三维结构的药物设计提供重要的参考信息.

论物权行为

我国物权立法日益迫近，而倍受各国学者称赞的被誉为物权法重要支柱之一的物权行为理论，却受到国内一些学者的责难。他们认为，物权行为及其无因性理论纯属“捏造”，“严重歪曲了现实法律生活过程”①，“承认错误的、甚至违法的交付也为有效”，“损害民法的公平和诚信...

中国抗生素产业的现状与科技体系创新

我国感染性疾病对人民的身体健康造成严重威胁,抗生素类药物是治疗和控制感染性疾病首选,中国抗生素产业的发展迅速,但仍然存在很多问题,需要加强抗生素产业的科技创新强度,加快换代速度,不断提高其总体水平。

GSH对两种谷胱甘肽过氧化物酶模拟物活性影响的研究

设计并合成了谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)模拟物6A,6A′-二苯胺-6B,6B′-二硒桥联-β-环糊精(6-AnSeCD).采用双酶偶联法测定GPX的活力结果显示,6A,6A′-二环己胺-6B,6B′-二硒桥联-β-环糊精(6-CySeCD)催化谷胱甘肽还原H2O2和枯烯H2O2的活力均比6-AnSeCD的高.为了进一步考察6-CySeCD和6-AnSeCD与GSH之间的相互作用,进行了分子动力学(MD)模拟和分子对接研究.结果表明,与GSH的结合使GPX模拟物的构象发生变化,这种改变可能是影响桥连GPX模拟物催化活性的关键因素.

人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(ACMSD)与底物及抑制剂作用模型的理论研究

利用同源模建和分子动力学模拟方法构建了人类2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛脱羧酶(hACMSD)的三维结构,并利用Profile-3D和Procheck等方法评估了模型的可靠性.在此基础上,用分子对接程序(Affinity),将其底物2-氨基3-羧基粘康酸6-半醛(ACMS)和抑制剂喹啉酸(QA)分别与hACMSD进行对接,获得了复合物结构的理论模型.通过配体与受体之间相互作用能和结构分析给出了底物和抑制剂的具体结合方式,明确了hACMSD与底物和抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基.

房地产市场立法中的两个问题

项目抵押与商品房预售 现在,凡进入房地产项目开发,发展商都会尽可能地以正在建造中的商品房大厦(项目)作抵押,向银行贷款;同时又按《城市房地产管理法》(以下简称“房地产法”)第44条的规定,向公众预售商品房。于是造成绝大多数预购人在不知情的情况下,预购了已被作了抵押的商品房。他们苦心积蓄下来的钱,

响应面法优化金霉素发酵培养基

目的采用响应面法对金色链霉菌发酵产金霉素培养基进行优化。方法首先采用Plackett-Burman实验筛选出影响金色链霉菌发酵产生金霉素的主要影响因素,然后通过最速上升实验逼近最大值响应区域,最后采用Box-Behnken设计响应面方法确定主要影响因素的浓度,得到金霉素优化发酵培养基组成。结果玉米淀粉、酵母粉、(NH4)2SO4为对金霉素产量有显著影响的主要因素,最佳水平为:玉米淀粉125.10 g.L-1、酵母粉4.03 g.L-1、(NH4)2SO44.87 g.L-1。在优化发酵培养基条件下,金霉素发酵单位为22.813 g.L-1,与预测值接近,较优化前发酵单位19.476 g.L-1提高了17%。结论响应面实验设计和分析方法能够有效地对金霉素发酵培养基进行优化。

高校生物化学实验教学革新性探索

高校生物化学实验教学作为生物化学教学的组成部分是在生物技术人才培养中必不可少环节,而传统实验教学内容和模式很难适应素质教育的要求,在实验教学中开设学生自主设计性实验,引导学生自己完成整个实验过程,调动了学生的兴趣和积极性,发挥了学生的主动性和创造性,提高了教学效果,培养了学生的创新能力十分重要。

高校实验教学体制改革和科技创新体制建设的思考

实验教学是高校教学的重要组成部分,我国高校的传统实验教学体制已不能适应新世纪高校发展和国家对创新人才培养的要求,本文阐述了实验教学重要性和高校实验教学存在问题和弊端以及改革实验教学体制的对策,为高校培养学生科技与创新能力,实验教学体制高效运行提供依据。

两种皮肤损害性卟啉病患者酶活性的研究

目的 :研究和比较先天性红细胞生成性卟啉病 (CEP)患者、迟发性皮肤卟啉病 (PCT)患者和正常健康者的红细胞酶活性。方法 :荧光分光光度法和反相高效液相色谱法。结果 :CEP患者的红细胞尿卟啉原Ⅲ同合成酶 (URO -COS)的活性仅为正常健康者的 17% ,而PCT患者的尿卟啉原脱羧酶 (UROD)活性仅为正常健康者的4 9%。结论 :URO

互有继承权的数人同时死亡应怎样继承?

退休工人李根生,年逾古稀,其妻早故。女儿李发云出嫁多年。儿子李发福,是某机床厂工人,1973年和某纺织厂女工孙忠芳再婚,翌年生一男孩,名叫李春。孙子李俊,系李发福前妻所生,某汽车修理厂工人,1972年与同厂女工林秀英结婚。

论干涉合同履行行为及其法律责任

干涉合同履行行为,这里是指合同当事人以外的第三人违反法律规定,故意阻止、妨碍合同履行的行为。合同是当事人之间为了追求某种经济利益的意思表示一致的协议。法律要求当事人履行合同义务,是为了保证实现权利人的某种经济利益,达到订立合同的目的。而干涉合同履行的行为却阻止、妨碍合同经济利益的实现,势必造成合同当事人的经济损失。这种损害合同当事人经济利益的行为,其实质属于侵权行为之一种。但是,它与一般的侵权行为相比,又有其特殊性。第一,侵害的对象不同。干涉合同履行行为侵害的是合同关系。

不同酿酒酵母菌株来源异麦芽糖酶IMA1的克隆、表达及表征（英文）

【目的】异麦芽糖酶IMA1在充分利用含有α-1,6-O-糖苷键的低聚糖中起着关键作用。【方法】在本研究中,对来自4株酿酒酵母菌株(包括3株嗜酸性菌株)来源的异麦芽糖酶IMA1进行克隆、表达、纯化和表征。【结果】研究发现,4种异麦芽糖酶IMA1表现出类似的pH和温度依赖性,但表现出不同的动力学参数和热稳定性。IMA1-A对α-MG(α-甲基葡糖苷)表现出最高的结合亲和力、转换数、催化效率和热稳定性。结构和序列分析表明,2个远离活性位点和底物结合位点的氨基酸的差异对异麦芽糖酶IMA1的动力学参数和热稳定性有重要影响。【结论】本研究结果对进一步研究异麦芽糖酶IMA1的结构-功能关系奠定了基础。

专业户法律地位探讨

农村实行家庭联产承包责任制以来,涌现了一大批专业户。专业户以其突出的经济效益,引起了人们的普遍关注和一致赞赏。专业户有没有民事权利主体资格?认识上莫衷一是。我认为,这是一个非常重要的问题,进行研究和讨论,很有必要。专业户不是法人,也不是公民,而是一个类似合伙的经济实体。所谓合伙的经济实体,就是数个主体合伙经营的经济组织。具体说,它是若干公民或法人。

国家财产权与委托经营权

在社会主义全民所有制基础上产生的国家所有权,其基本内容,应当是国家对全民所有财产的占有、使用、处分、受益和委托经营等项权能。这都是国家所为的占有、使用、处分、受益和委托经营。如果这五项权能同时分离了,国家所有权就完全丧失,不存在全部暂时分离的问题。我们的国家,是全民财产的体现者、所有者,但是在通常情况下,国家并不直接从事生产、经营,而是根据国家政策、法令、计划等等,也就是按照自己的意志把财产分别交给社会主义组织(如企业)去经营管理。