DELLA基因家族参与植物激素信号转导通路的调控,其中GAI(GA insensitive)mRNA还是植物体内长距离运输的信号分子。在全基因组范围内鉴定甘蓝(Brassica oleracea var. capitata) DELLA基因家族成员并分析mRNA运输特性,可为甘蓝DELLA基因...DELLA基因家族参与植物激素信号转导通路的调控,其中GAI(GA insensitive)mRNA还是植物体内长距离运输的信号分子。在全基因组范围内鉴定甘蓝(Brassica oleracea var. capitata) DELLA基因家族成员并分析mRNA运输特性,可为甘蓝DELLA基因家族的开发应用提供基础数据。本研究利用甘蓝基因组数据和转录组数据,在甘蓝中鉴定了5个DELLA基因家族成员(BoRGA1、BoRGA2、BoRGL1、BoRGL2和BoRGL3),但甘蓝基因组缺失了GAI基因。采用劈接法将甘蓝(自交系G27)接穗和菜心(Brassica campestris L. ssp. chinensis var.utilis Tsen et Lee)(四九菜心)砧木嫁接在一起,构建异源嫁接体。对砧木菜心花序轴和对应位置的实生苗菜心花序轴(对照)取样进行转录组测序。在甘蓝/菜心异源嫁接体的砧木菜心花序轴的转录组测序文库中分别鉴定到8、9、3、5、1个来自甘蓝BoRGA1、BoRGA2、BoRGL1、BoRGL2和BoRGL3的外源read。甘蓝DELLA家族基因mRNA运输并没有提高砧木菜心中DELLA家族基因的转录表达水平。相关性分析显示,甘蓝DELLA家族基因mRNA运输效率与其自身的序列和接穗甘蓝中的DELLA家族基因的转录表达水平相关。本研究为深入探究甘蓝DELLA家族基因mRNA运输的分子机制奠定了基础。展开更多
文摘DELLA基因家族参与植物激素信号转导通路的调控,其中GAI(GA insensitive)mRNA还是植物体内长距离运输的信号分子。在全基因组范围内鉴定甘蓝(Brassica oleracea var. capitata) DELLA基因家族成员并分析mRNA运输特性,可为甘蓝DELLA基因家族的开发应用提供基础数据。本研究利用甘蓝基因组数据和转录组数据,在甘蓝中鉴定了5个DELLA基因家族成员(BoRGA1、BoRGA2、BoRGL1、BoRGL2和BoRGL3),但甘蓝基因组缺失了GAI基因。采用劈接法将甘蓝(自交系G27)接穗和菜心(Brassica campestris L. ssp. chinensis var.utilis Tsen et Lee)(四九菜心)砧木嫁接在一起,构建异源嫁接体。对砧木菜心花序轴和对应位置的实生苗菜心花序轴(对照)取样进行转录组测序。在甘蓝/菜心异源嫁接体的砧木菜心花序轴的转录组测序文库中分别鉴定到8、9、3、5、1个来自甘蓝BoRGA1、BoRGA2、BoRGL1、BoRGL2和BoRGL3的外源read。甘蓝DELLA家族基因mRNA运输并没有提高砧木菜心中DELLA家族基因的转录表达水平。相关性分析显示,甘蓝DELLA家族基因mRNA运输效率与其自身的序列和接穗甘蓝中的DELLA家族基因的转录表达水平相关。本研究为深入探究甘蓝DELLA家族基因mRNA运输的分子机制奠定了基础。