白木香离体根响应铜胁迫的转录组分析

为探究铜胁迫下白木香离体根分子响应机制,本研究对胁迫前和胁迫后的白木香离体根材料进行转录组测序(RNA-Seq)比较分析。结果表明,两组间共获得56467条Unigenes,与四大公共数据库(Nr、Swissprot、KOG、KEGG)作同源比对,注释到29037条Unigenes,其中在Nr数据库中获得注释的Unigene数量最多。以FDR<0.05且|log_(2)(FC)|>1为条件,共筛选得到18704个DEGs,其中7794个DEGs上调表达,10910个DEGs下调表达。KEGG通路分析表明,这些DEGs主要通过调节糖酵解/糖异生、脯氨酸代谢、苯丙烷生物合成、类黄酮生物合成等途径来响应铜胁迫。