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基于生物信息学分析跨膜蛋白132A在肝癌中的表达及其临床意义
1
作者
赵航祺
马小雯
+1 位作者
张天爱
李柏峰
《肝癌电子杂志》
2024年第3期33-41,共9页
目的:基于公共数据库探究跨膜蛋白132A(TMEM132A)在肝癌中的表达模式及临床意义。方法:利用肿瘤基因组图谱并基于基因表达数据库优选其中的GSE14520、GSE60502数据集分析TMEM132A在肝癌与癌旁组织中的m RNA表达水平,及与临床因素的相关...
目的:基于公共数据库探究跨膜蛋白132A(TMEM132A)在肝癌中的表达模式及临床意义。方法:利用肿瘤基因组图谱并基于基因表达数据库优选其中的GSE14520、GSE60502数据集分析TMEM132A在肝癌与癌旁组织中的m RNA表达水平,及与临床因素的相关性。通过HPA数据库获取TMEM132A在组织中的免疫组织化学结果。利用Kaplan-Meier法探讨TMEM132A与患者预后的相关性。运用受试者操作特征曲线探究TMEM132A是否可以作为诊断指标。通过癌症药物敏感基因组学预测TMEM132A对化疗药物的药物敏感性。通过单样本GSEA、TIMER、STORMAL SCORE和免疫检查点热图,对TEME132A进行免疫分析。linkedomics网站用于对TMEM132A差异基因进行基因集富集分析。利用STRING数据库预测TMEM132A的互作蛋白。结果:TMEM132A在肝癌组织表达显著高于癌旁组织(P<0.05),定位于胞浆、胞膜。TMEM132A高表达与肿瘤分期、分级、甲胎蛋白水平和体重显著正相关。TMEM132A高表达提示患者预后不良,可作为准确的诊断指标。TMEM132A对多种化疗药物敏感,且被多种免疫细胞浸润,可以作为药物治疗及免疫治疗的研究靶点。癌组织中TMEM132的启动子甲基化水平显著降低。TMEM132A影响细胞黏附,脂肪酸代谢等信号通路。结论:TMEM132A在肝癌中高表达,与患者预后不良正相关。
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关键词
肝癌
跨膜蛋白132A
肿瘤基因组图谱
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题名
基于生物信息学分析跨膜蛋白132A在肝癌中的表达及其临床意义
1
作者
赵航祺
马小雯
张天爱
李柏峰
机构
中国医科大学附属第一医院浑南院区普通外科肝胆胰外科
中国医科大学第一临床学院
北部战区总医院重症医学科
出处
《肝癌电子杂志》
2024年第3期33-41,共9页
基金
辽宁省教育厅科学研究经费项目(JCZR2020006)。
文摘
目的:基于公共数据库探究跨膜蛋白132A(TMEM132A)在肝癌中的表达模式及临床意义。方法:利用肿瘤基因组图谱并基于基因表达数据库优选其中的GSE14520、GSE60502数据集分析TMEM132A在肝癌与癌旁组织中的m RNA表达水平,及与临床因素的相关性。通过HPA数据库获取TMEM132A在组织中的免疫组织化学结果。利用Kaplan-Meier法探讨TMEM132A与患者预后的相关性。运用受试者操作特征曲线探究TMEM132A是否可以作为诊断指标。通过癌症药物敏感基因组学预测TMEM132A对化疗药物的药物敏感性。通过单样本GSEA、TIMER、STORMAL SCORE和免疫检查点热图,对TEME132A进行免疫分析。linkedomics网站用于对TMEM132A差异基因进行基因集富集分析。利用STRING数据库预测TMEM132A的互作蛋白。结果:TMEM132A在肝癌组织表达显著高于癌旁组织(P<0.05),定位于胞浆、胞膜。TMEM132A高表达与肿瘤分期、分级、甲胎蛋白水平和体重显著正相关。TMEM132A高表达提示患者预后不良,可作为准确的诊断指标。TMEM132A对多种化疗药物敏感,且被多种免疫细胞浸润,可以作为药物治疗及免疫治疗的研究靶点。癌组织中TMEM132的启动子甲基化水平显著降低。TMEM132A影响细胞黏附,脂肪酸代谢等信号通路。结论:TMEM132A在肝癌中高表达,与患者预后不良正相关。
关键词
肝癌
跨膜蛋白132A
肿瘤基因组图谱
Keywords
Liver cancer
Transmembrane protein 132A
The cancer genome atlas
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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基于生物信息学分析跨膜蛋白132A在肝癌中的表达及其临床意义
赵航祺
马小雯
张天爱
李柏峰
《肝癌电子杂志》
2024
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