基于网络药理学探究当归芍药散入血成分治疗原发性痛经的有效性及机制

目的以当归芍药散入血成分为研究对象,基于网络药理学和动物实验探究当归芍药散治疗原发性痛经的有效性及作用机制。方法运用Gene Cards、OMIM数据库筛选与当归芍药散入血成分对接的原发性痛经靶点,利用R语言获得关键靶标,进行蛋白互作网络构建,针对筛选出的靶点进行GO和KEGG通路富集;利用AutoDock Vina 1.2.3版软件进行分子对接;通过当归芍药散给药干预原发性痛经模型大鼠,从行为学和组织病理学角度验证当归芍药散的有效性。结果共筛选出当归芍药散入血成分12个,作用于肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6、VEGFA、PTGS2等核心靶点,主要参与IL-17、TNF、花生四烯酸代谢等信号通路。分子对接显示Z-丁烯基酞内酯、洋川芎内酯I、芍药内酯苷3个活性成分与靶标蛋白结合能力较强。动物实验表明,原发性痛经模型大鼠扭体反应明显增加(P<0.05),子宫内膜剥脱及水肿严重;当归芍药散能有效减少大鼠扭体次数(P<0.05),减轻子宫内膜剥脱及水肿。结论当归芍药散主要通过中枢镇痛、调控激素效应、抑制子宫炎症反应等药理作用发挥治疗原发性痛经的效果,为后续研究提供参考。

基于UPLC-Q-TOF-MS和网络药理学辨识白芍治疗原发性痛经的质量标志物

目的借助UPLC-Q-TOF-MS技术和网络药理学探究白芍治疗原发性痛经的机制,辨识其质量标志物。方法利用UPLC-Q-TOF-MS技术对白芍进行成分分析,借助网络药理学方法收集白芍活性成分和原发性痛经靶点,归纳两者交集靶点,借助DAVID平台对靶点进行GO与KEGG通路富集分析;并将核心成分与核心靶点进行分子对接,依据五原则结合文献预测白芍治疗原发性痛经的质量标志物。结果白芍提取物中鉴定出63个化合物,经筛选得到4个关键活性成分,包括芍药内酯苷、牡丹皮苷I、柚皮素和芍药内酯C,作用于6个核心靶点BCL2L1、HSP90AA1、MMP9、PPARG、VEGFA、STAT3,涉及IL-17、TNF、PI3K/Akt等信号通路。分子对接显示发现这6个核心靶点与4个活性成分有良好的亲和力,基于五原则预测出白芍治疗原发性痛经的候选质量标志物为2个。结论预测出芍药内酯苷和芍药内酯C可作为白芍治疗原发性痛经的候选质量标志物,为进一步提升白芍质量控制奠定依据。

基于非靶向尿液代谢组学技术的原发性痛经不同进展阶段的生物学基础研究

目的 通过非靶向尿液代谢组学技术研究原发性痛经形成过程中大鼠的内源性代谢特征,探讨其潜在的生物学实质。方法 将20只SD大鼠随机分成空白组和模型组。模型组大鼠采用苯甲酸雌二醇联合缩宫素方法复制原发性痛经模型,空白组正常饮食饮水。采用超高效液相色谱-四极杆-飞行时间质谱联合多变量模式识别方法寻找差异性代谢物及核心代谢通路,使用MetaboAnalyst 5.0平台绘制受试者工作特征(receiver operating characteristic curve, ROC)曲线来评估核心代谢物临床诊断效能。结果 共筛选出马尿酸、苯乙醛、前列腺素G2、6-羟基-5-甲氧基吲哚葡萄糖醛酸等46种差异显著的小分子代谢物,涉及苯丙氨酸代谢,戊糖和葡萄糖醛酸酯的相互转化,花生四烯酸代谢3条核心代谢通路。ROC曲线进一步分析出4种核心生物标志物曲线下面积均大于0.7。结论 原发性痛经不同进展阶段呈现不同的代谢图谱,主要涉及脂肪酸代谢、糖类代谢和氨基酸代谢的紊乱,同时提取出的特征性生物标志物对于评估原发性痛经具有较高的诊断价值。

基于网络药理学和分子对接技术探讨四逆散治疗非酒精性脂肪性肝炎的潜在作用机制

目的基于网络药理学与分子对接技术探讨四逆散治疗非酒精性脂肪性肝炎作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选四逆散的活性成分及作用靶点。采用GeneCards数据库及OMIM数据库检索非酒精性脂肪性肝炎疾病相关靶点。利用R语言获得药物成分与疾病的交集基因,通过Cytoscape 3.7.1构建“药物-活性成分-靶点-疾病”关系网络图,将交集基因通过Bisogenet数据分析平台进行蛋白互作网络分析,并进行基因本体GO和KEGG通路富集分析。利用AutoDockTools 1.5.6和AutoDockVina 1.1.2软件中完成分子对接。结果四逆散的主要活性成分241个、对应靶点318个,药物疾病共同靶点57个;GO富集分析得1307个条目(P<0.05),KEGG通路富集分析筛选出122条信号通路(P<0.05),主要涉及非酒精性脂肪性肝病、脂质和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子等信号通路。分子对接结果显示山柰酚、槲皮素、异鼠李素与MAPK8有较强的结合能力。结论四逆散干预NASH具有多途径、多靶点作用特点,四逆散中的有效成分主要通过RELA、AKT1、MAPK8、IL-6、JUN等靶点调节多条信号通路发挥对NASH的治疗作用,为后续研究提供参考和依据。

北苍术根腐病植株根际土壤真菌群落多样性分析

【目的】分析根腐病北苍术植株根际土壤真菌群落的多样性,为探索北苍术根腐病的发病机理和防治工作提供参考。【方法】利用Illumina HiSeq高通量测序技术,分析北苍术根腐病植株与健康植株根际土壤真菌群落结构特征,并对植株根际土壤理化性质与酶活性进行分析。【结果】患根腐病北苍术植株根际土壤真菌较健康植株总量和多样性显著降低。患根腐病北苍术植株根际土壤中真菌菌群在门水平的丰度相对健康土壤增高的是子囊菌门(Ascomycota),减少的是担子菌门(Basidiomycota)、壶菌门(Chytridiomycota);在目水平增多的是肉座菌目(Hypocreales)、假球壳目(Pleosporales)、小丛壳目(Glomerellales)等,减少的是被孢霉目(Mortierellales)、粪壳菌目(Sordariales)、散囊菌目(Eurotiales)、刺盾炱目(Chaetothyriales)等;在属水平上增多的是镰刀菌属(Fusarium),赤霉属(Gibberella)等,减少的是被孢霉属(Mortierella)、亚隔孢壳属(Didymella)、毛壳属(Cheatomium)及木霉属(Trichoderma)等。统计学分析表明,患根腐病北苍术植株根际土壤的pH显著低于健康北苍术植株根际土壤,速效N、速效P、速效K含量显著增高。且不同处理的北苍术植株根际土壤的酶活性检测显示根腐病北苍术植株根际土壤的土壤脲酶、土壤蔗糖酶及土壤碱性磷酸酶的酶活性显著高于健康植株的根际土壤。【结论】常见生防菌毛壳属(Cheatomium)在根腐病北苍术植株根际土壤中占比较少,Schizotheciumj菌在健康北苍术植株根际土壤中占比丰度更高。致病菌镰刀菌(Fusarium)在根腐病北苍术植株根际土壤中占比多。北苍术根腐病的成因可能与其根际真菌丰度降低、土壤的理化性质及酶活显著变化有关,但差异菌群的功能多样性及与北苍术植株根腐病病原菌的互作关系尚待验证。

基于网络药理学和实验验证探讨陈皮藿香汤治疗腹泻的作用机制

目的:基于网络药理学和实验验证探讨陈皮藿香汤治疗腹泻的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出陈皮藿香汤的活性成分及作用靶点。采用GeneCards及在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索腹泻疾病相关靶点,聚焦共同靶标,借助Cytoscape 3.7.1及STRING数据库构建成分-靶点-疾病及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,采用Bioconductor平台和R语言对核心靶标进行基因本体(GO)富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。利用AutoDockTools 1.5.6和AutoDockVina 1.1.2软件中进行分子对接。最后通过动物试验进一步验证实验结果。结果:陈皮藿香汤的主要活性成分51个、对应靶点226个,药物疾病共同靶点37个;GO富集分析得1 249个条目(P<0.05)、KEGG通路富集分析筛选出110条信号通路(P<0.05),主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、Janus激酶/信号转导子与转录激活因子(JAK/STAT)、缺氧诱导因子-1(HIF-1)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路。分子对接结果表明橙皮苷与Akt1结合能力最强。动物实验结果显示大鼠陈皮藿香汤给药后可以显著缓解大鼠的腹泻症状,给药第1天腹泻指数降为0.92,与模型组腹泻指数(1.24)差异有明显统计学意义(P<0.05),小肠墨汁推进率70.36%,经统计学分析与模型组(58.20%)差异有显著统计学意义(P<0.01),给药后可改善大鼠的肠蠕动功能。酶联免疫吸附测定法(ELISA)检测结果显示白细胞介素-6(IL-6)、白细胞介素-1β(IL-1β)水平表达明显降低(P<0.05),Akt1、表皮细胞生长因子(EGF)、表皮生长因子受体(EGFR)水平表达明显升高(P<0.05)。结论:陈皮藿香汤中的有效成分主要通过Akt1、IL-6、IL-1β、EGF、EGFR等核心靶点调节PI3K/Akt、MAPK等信号通路发挥对腹泻的治疗作用,为后续研究陈皮-藿香药对药理机制,两者间配伍的科学内涵提供了实验依据。