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基于代谢分析的SARS-CoV-2药物靶点预测方法
1
作者
赵言龙
郑浩然
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第11期1433-1440,共8页
提出一种基于代谢分析的抑制SARS-CoV-2复制的药物靶点预测方法。使用5组基因表达综合数据库(GEO)的人类肺部组织细胞的转录组学数据,提取出SARS-CoV-2入侵宿主细胞后显著高表达的基因,进而重构出病毒入侵肺部组织细胞后的代谢网络模型...
提出一种基于代谢分析的抑制SARS-CoV-2复制的药物靶点预测方法。使用5组基因表达综合数据库(GEO)的人类肺部组织细胞的转录组学数据,提取出SARS-CoV-2入侵宿主细胞后显著高表达的基因,进而重构出病毒入侵肺部组织细胞后的代谢网络模型;之后采用基因敲除、毒性测试等系统生物学分析方法来预测药物靶点。对GEO中5个数据集的样本进行分析,结果显示各数据集预测的靶点基因具有一定的一致性。其中,PLPBP是5个数据集中预测的共有靶点基因,说明它对于SARS-CoV-2代谢活动具有重要作用,可作为治疗该疾病的潜在药物靶点;另外,BCAT1、BCAT2、ADI1也具有一定的研究价值。提出的方法为预测SARS-CoV-2的药物靶点提供一种新的思路,预测的药物靶点也具有进一步临床研究的潜力。
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关键词
SARS-CoV-2
药物靶点
代谢网络模型
显著高表达基因
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职称材料
一种通过代谢差异分析抑制SARS-CoV-2复制的靶点预测方法
2
作者
齐瑜鹏
赵言龙
郑浩然
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第12期1577-1584,共8页
提出一种通过代谢差异分析抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)复制进程的靶点预测方法。该方法基于肺宿主细胞的基因表达数据,重建病毒入侵后宿主细胞代谢系统发生变化的部分网络模型,并通过单基因敲除和细胞毒性测试识别候选靶点。此外,分...
提出一种通过代谢差异分析抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)复制进程的靶点预测方法。该方法基于肺宿主细胞的基因表达数据,重建病毒入侵后宿主细胞代谢系统发生变化的部分网络模型,并通过单基因敲除和细胞毒性测试识别候选靶点。此外,分析抗病毒靶点对目前已知的多种SARS-CoV-2变体的稳健性。结果表明,D-丙氨酸是影响SARS-CoV-2复制的关键代谢物,且适用于当前所有的SARS-CoV-2变体。调控D-丙氨酸的基因PLPBP是主要的基因靶点。本文方法具有通用性,适用于现有病毒及宿主细胞,为应对病毒性疾病提供新思路。
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关键词
COVID-19
SARS-CoV-2
代谢差异分析
靶点预测
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职称材料
关于西安事变的几点认识
3
作者
赵言龙
《中学政史地(教学指导)》
2011年第10期53-54,共2页
一、西安事变爆发的背景 1.九一八事变的爆发。1931年9月18日,驻中国东北的日本关东军炮击中国东北军的北大营并向沈阳进攻,制造了震惊中外的九一八事变。19日,日军侵占沈阳,短时间内又占领长春、吉林等地。九一八事变是日本帝国...
一、西安事变爆发的背景 1.九一八事变的爆发。1931年9月18日,驻中国东北的日本关东军炮击中国东北军的北大营并向沈阳进攻,制造了震惊中外的九一八事变。19日,日军侵占沈阳,短时间内又占领长春、吉林等地。九一八事变是日本帝国主义企图以武力征服中国的开端。数十万东北军执行蒋介石不抵抗命令,不战自退。不到半年,东北三省全部落入日军之手。
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关键词
西安
东北三省
中国
蒋介石
爆发
沈阳
日本
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职称材料
题名
基于代谢分析的SARS-CoV-2药物靶点预测方法
1
作者
赵言龙
郑浩然
机构
中国科学技术大学计算机科学与技术学院
出处
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第11期1433-1440,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(2017YFA0505502)
中国科学院战略性先导科技专项(XDB38000000)。
文摘
提出一种基于代谢分析的抑制SARS-CoV-2复制的药物靶点预测方法。使用5组基因表达综合数据库(GEO)的人类肺部组织细胞的转录组学数据,提取出SARS-CoV-2入侵宿主细胞后显著高表达的基因,进而重构出病毒入侵肺部组织细胞后的代谢网络模型;之后采用基因敲除、毒性测试等系统生物学分析方法来预测药物靶点。对GEO中5个数据集的样本进行分析,结果显示各数据集预测的靶点基因具有一定的一致性。其中,PLPBP是5个数据集中预测的共有靶点基因,说明它对于SARS-CoV-2代谢活动具有重要作用,可作为治疗该疾病的潜在药物靶点;另外,BCAT1、BCAT2、ADI1也具有一定的研究价值。提出的方法为预测SARS-CoV-2的药物靶点提供一种新的思路,预测的药物靶点也具有进一步临床研究的潜力。
关键词
SARS-CoV-2
药物靶点
代谢网络模型
显著高表达基因
Keywords
SARS-CoV-2
drug target
metabolic network model
highly expressed gene
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
一种通过代谢差异分析抑制SARS-CoV-2复制的靶点预测方法
2
作者
齐瑜鹏
赵言龙
郑浩然
机构
中国科学技术大学计算机科学与技术学院
出处
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023年第12期1577-1584,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划(2017YFA0505502)
中国科学院战略性先导科技专项(XDB38000000)。
文摘
提出一种通过代谢差异分析抑制新型冠状病毒(SARS-CoV-2)复制进程的靶点预测方法。该方法基于肺宿主细胞的基因表达数据,重建病毒入侵后宿主细胞代谢系统发生变化的部分网络模型,并通过单基因敲除和细胞毒性测试识别候选靶点。此外,分析抗病毒靶点对目前已知的多种SARS-CoV-2变体的稳健性。结果表明,D-丙氨酸是影响SARS-CoV-2复制的关键代谢物,且适用于当前所有的SARS-CoV-2变体。调控D-丙氨酸的基因PLPBP是主要的基因靶点。本文方法具有通用性,适用于现有病毒及宿主细胞,为应对病毒性疾病提供新思路。
关键词
COVID-19
SARS-CoV-2
代谢差异分析
靶点预测
Keywords
COVID-19
SARS-CoV-2
metabolic difference analysis
target prediction
分类号
R318 [医药卫生—生物医学工程]
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职称材料
题名
关于西安事变的几点认识
3
作者
赵言龙
机构
山东省苍山县第二中学
出处
《中学政史地(教学指导)》
2011年第10期53-54,共2页
文摘
一、西安事变爆发的背景 1.九一八事变的爆发。1931年9月18日,驻中国东北的日本关东军炮击中国东北军的北大营并向沈阳进攻,制造了震惊中外的九一八事变。19日,日军侵占沈阳,短时间内又占领长春、吉林等地。九一八事变是日本帝国主义企图以武力征服中国的开端。数十万东北军执行蒋介石不抵抗命令,不战自退。不到半年,东北三省全部落入日军之手。
关键词
西安
东北三省
中国
蒋介石
爆发
沈阳
日本
分类号
P145.3 [天文地球—天体物理]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于代谢分析的SARS-CoV-2药物靶点预测方法
赵言龙
郑浩然
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023
0
下载PDF
职称材料
2
一种通过代谢差异分析抑制SARS-CoV-2复制的靶点预测方法
齐瑜鹏
赵言龙
郑浩然
《中国医学物理学杂志》
CSCD
2023
0
下载PDF
职称材料
3
关于西安事变的几点认识
赵言龙
《中学政史地(教学指导)》
2011
0
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