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基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
1
作者
谭菊
王永娟
+6 位作者
郭广富
赵长菁
夏爱鸿
李巨银
吴敏秋
王宇航
覃秋苹
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024年第1期312-322,共11页
【目的】设计针对雏沙门菌(Salmonella Pullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitope vaccine, MEV),为净化鸡白痢提供新的疫苗。【方法】选用IEDB预测雏沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ)类分子结合表位;用NetM...
【目的】设计针对雏沙门菌(Salmonella Pullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitope vaccine, MEV),为净化鸡白痢提供新的疫苗。【方法】选用IEDB预测雏沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ)类分子结合表位;用NetMHCIIpan 4.0 Server预测T淋巴细胞MHCⅡ类分子结合表位;用IEDB预测B淋巴细胞表位。将各个服务器预测结果筛选出的表位经过VaxiJen v 2.0评估抗原性后,将合格的表位通过柔性linker串联成多表位疫苗。对构建的多表位疫苗进行抗原性、理化性质、N-糖基化位点、二级结构和三级结构预测。使用分子对接评估多表位疫苗与免疫受体的结合能力,使用免疫模拟评估多表位疫苗的免疫效果,最后优化密码子便于克隆表达。【结果】经筛选后,选择4个MHCⅠ、4个MHCⅡ和8个B淋巴细胞表位优势表位构建的多表位疫苗MEV-IpaJ。多表位疫苗MEV-IpaJ的分子质量为28.18 ku,为稳定亲水蛋白,具有良好的抗原性,存在4个潜在的N-糖基化位点,α-螺旋、延长链、β-转角和无规则卷曲分别占20.38%、19.23%、8.08%和52.31%。三级结构Ramachandran作图显示,优势区域中含有残基数占89.9%%,进行细化后优势区域的残基数增加到94.0%,三级结构突出表位作图也证明MEV-IpaJ具有良好的免疫原性。分子对接结果显示,MEV-IpaJ与Toll样受体2(Toll-like receptor 2,TLR2)和TLR4蛋白分子可对接。免疫模拟结果显示,MEV-IpaJ具有较好的免疫应答,能提高部分细胞因子的表达,经密码子优化确保设计的MEV-IpaJ可在大肠杆菌K12表达系统中高效、稳定地表达。【结论】本研究构建的多表位疫苗MEV-IpaJ可有效表达并可能诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答。本研究为雏沙门菌多表位疫苗的设计提供了一种新的方法,为雏沙门菌多表位疫苗的研发提供了理论依据及数据支持。
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关键词
雏沙门菌
免疫信息学
表位
多表位疫苗
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职称材料
蛋鸡养殖中新城疫危害及防控措施
2
作者
赵长菁
李昕烨
+3 位作者
王永娟
夏爱鸿
韩志蕾
袁橙
《现代畜牧科技》
2023年第10期119-122,共4页
近年,蛋鸡养殖业发展迅速,疫病的发生是困扰其发展的关键因素,新城疫(Newcastle disease,ND)则是制约其健康发展的重要疫病之一。新城疫是危害家禽养殖最重要的传染病之一,在全球范围内流行,传染性强、病死率高。该文详细阐述蛋鸡养殖...
近年,蛋鸡养殖业发展迅速,疫病的发生是困扰其发展的关键因素,新城疫(Newcastle disease,ND)则是制约其健康发展的重要疫病之一。新城疫是危害家禽养殖最重要的传染病之一,在全球范围内流行,传染性强、病死率高。该文详细阐述蛋鸡养殖中新城疫的危害,并提出应对措施,以帮助蛋鸡养殖户科学防控新城疫。
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关键词
蛋鸡
新城疫
危害
防控
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职称材料
泰州地区鸡胚源沙门氏菌的分离鉴定及耐药基因和毒力基因的检测
被引量:
1
3
作者
谭菊
王永娟
+5 位作者
张雨馨
赵长菁
蔡丙严
武彩红
徐婷婷
郭广富
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2023年第12期64-71,146,共9页
为探究泰州地区某规模化孵化场鸡胚源沙门氏菌的生物学特征,试验对临床疑似沙门氏菌感染的死亡鸡胚中的沙门氏菌进行选择性增菌和分离,并对分离菌进行革兰氏染色鉴定、特异性基因扩增、毒力基因检测、药物敏感试验和耐药基因检测。结果...
为探究泰州地区某规模化孵化场鸡胚源沙门氏菌的生物学特征,试验对临床疑似沙门氏菌感染的死亡鸡胚中的沙门氏菌进行选择性增菌和分离,并对分离菌进行革兰氏染色鉴定、特异性基因扩增、毒力基因检测、药物敏感试验和耐药基因检测。结果表明:共分离到6株细菌,在沙门氏菌显色培养基上均呈现紫色小菌落,均为革兰氏阴性菌,特异性基因扩增鉴定为鸡伤寒沙门氏菌;从6株菌中共检测出15种毒力基因,除均不携带sopE基因外,sipA、sopA、sopB、ssaB、mgtC、misL、siiE、pipC、stn、fimA基因携带率为100%(6/6),sipC、sseL基因携带率为83.3%(5/6),ssaR、spvB基因携带率为66.7%(4/6);6株菌对大部分抗生素敏感,仅对多西环素(66.7%,4/6)、林可霉素(100%,6/6)、阿奇霉素(83.3%,5/6)和多黏菌素B(83.3%,5/6)的耐药率高于50.00%,3重耐药率为83.3%(5/6),4重耐药率为66.7%(4/6),5重耐药率为16.7%(1/6),6重耐药率为0(0/6);从6株菌中共检测出5种耐药基因,其中tet(A)、tet(B)和Sul2基因检出率均为100%(6/6),bla_(SHV)基因检出率为83.3%(5/6),Sul1基因检出率为66.7%(4/6),bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(CTX)、bla_(TEM)、aadA1、aadB、floR、qnrA、qnrB、qnrS、mcr-1基因均未检测出。说明分离到的6株鸡伤寒沙门氏菌表现为多重耐药且携带大量毒力基因,可能是引起该规模化孵化场鸡胚死亡的重要病原之一。
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关键词
沙门氏菌
鸡伤寒沙门氏菌
垂直传播
毒力
耐药
原文传递
题名
基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
1
作者
谭菊
王永娟
郭广富
赵长菁
夏爱鸿
李巨银
吴敏秋
王宇航
覃秋苹
机构
江苏农牧科技职业学院
出处
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024年第1期312-322,共11页
基金
江苏省第六期“333高层次人才培养工程”((2022)3-23-076)
江苏省现代农业职业教育行业指导委员会课题(nyhzwz202203)
+1 种基金
“家禽疾病监测及综合性防控”科技服务团队项目(NSF2022TF05)
江苏农牧科技职业学院校级科研项目(NSF2023CB03)。
文摘
【目的】设计针对雏沙门菌(Salmonella Pullorum)IpaJ蛋白的多表位疫苗(multi-epitope vaccine, MEV),为净化鸡白痢提供新的疫苗。【方法】选用IEDB预测雏沙门菌IpaJ蛋白的T淋巴细胞主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ)类分子结合表位;用NetMHCIIpan 4.0 Server预测T淋巴细胞MHCⅡ类分子结合表位;用IEDB预测B淋巴细胞表位。将各个服务器预测结果筛选出的表位经过VaxiJen v 2.0评估抗原性后,将合格的表位通过柔性linker串联成多表位疫苗。对构建的多表位疫苗进行抗原性、理化性质、N-糖基化位点、二级结构和三级结构预测。使用分子对接评估多表位疫苗与免疫受体的结合能力,使用免疫模拟评估多表位疫苗的免疫效果,最后优化密码子便于克隆表达。【结果】经筛选后,选择4个MHCⅠ、4个MHCⅡ和8个B淋巴细胞表位优势表位构建的多表位疫苗MEV-IpaJ。多表位疫苗MEV-IpaJ的分子质量为28.18 ku,为稳定亲水蛋白,具有良好的抗原性,存在4个潜在的N-糖基化位点,α-螺旋、延长链、β-转角和无规则卷曲分别占20.38%、19.23%、8.08%和52.31%。三级结构Ramachandran作图显示,优势区域中含有残基数占89.9%%,进行细化后优势区域的残基数增加到94.0%,三级结构突出表位作图也证明MEV-IpaJ具有良好的免疫原性。分子对接结果显示,MEV-IpaJ与Toll样受体2(Toll-like receptor 2,TLR2)和TLR4蛋白分子可对接。免疫模拟结果显示,MEV-IpaJ具有较好的免疫应答,能提高部分细胞因子的表达,经密码子优化确保设计的MEV-IpaJ可在大肠杆菌K12表达系统中高效、稳定地表达。【结论】本研究构建的多表位疫苗MEV-IpaJ可有效表达并可能诱导强烈的T细胞和B细胞免疫应答。本研究为雏沙门菌多表位疫苗的设计提供了一种新的方法,为雏沙门菌多表位疫苗的研发提供了理论依据及数据支持。
关键词
雏沙门菌
免疫信息学
表位
多表位疫苗
Keywords
Salmonella Pullorum
immunoinformatics
epitope
multi-epitope vaccine
分类号
S852.4 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
蛋鸡养殖中新城疫危害及防控措施
2
作者
赵长菁
李昕烨
王永娟
夏爱鸿
韩志蕾
袁橙
机构
江苏农牧科技职业学院
江苏省如皋市如城街道畜牧兽医站
出处
《现代畜牧科技》
2023年第10期119-122,共4页
基金
江苏省高等学校自然科学研究项目(21KJB230007)
泰州市科技支撑计划(农业)项目(TN202118)
江苏农牧科技职业学院科研项目(NSFZP202303)。
文摘
近年,蛋鸡养殖业发展迅速,疫病的发生是困扰其发展的关键因素,新城疫(Newcastle disease,ND)则是制约其健康发展的重要疫病之一。新城疫是危害家禽养殖最重要的传染病之一,在全球范围内流行,传染性强、病死率高。该文详细阐述蛋鸡养殖中新城疫的危害,并提出应对措施,以帮助蛋鸡养殖户科学防控新城疫。
关键词
蛋鸡
新城疫
危害
防控
Keywords
laying hens
newcastle disease
harm
prevention and control
分类号
S858.31 [农业科学—临床兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
泰州地区鸡胚源沙门氏菌的分离鉴定及耐药基因和毒力基因的检测
被引量:
1
3
作者
谭菊
王永娟
张雨馨
赵长菁
蔡丙严
武彩红
徐婷婷
郭广富
机构
江苏农牧科技职业学院
出处
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2023年第12期64-71,146,共9页
基金
江苏现代农业蛋鸡产业技术体系项目(JATS〔2022〕394)
“家禽疾病监测及综合性防控”科技服务团队项目(NSF2022TF05)
江苏农牧科技职业学院校级科研项目(NSF2023CB03)。
文摘
为探究泰州地区某规模化孵化场鸡胚源沙门氏菌的生物学特征,试验对临床疑似沙门氏菌感染的死亡鸡胚中的沙门氏菌进行选择性增菌和分离,并对分离菌进行革兰氏染色鉴定、特异性基因扩增、毒力基因检测、药物敏感试验和耐药基因检测。结果表明:共分离到6株细菌,在沙门氏菌显色培养基上均呈现紫色小菌落,均为革兰氏阴性菌,特异性基因扩增鉴定为鸡伤寒沙门氏菌;从6株菌中共检测出15种毒力基因,除均不携带sopE基因外,sipA、sopA、sopB、ssaB、mgtC、misL、siiE、pipC、stn、fimA基因携带率为100%(6/6),sipC、sseL基因携带率为83.3%(5/6),ssaR、spvB基因携带率为66.7%(4/6);6株菌对大部分抗生素敏感,仅对多西环素(66.7%,4/6)、林可霉素(100%,6/6)、阿奇霉素(83.3%,5/6)和多黏菌素B(83.3%,5/6)的耐药率高于50.00%,3重耐药率为83.3%(5/6),4重耐药率为66.7%(4/6),5重耐药率为16.7%(1/6),6重耐药率为0(0/6);从6株菌中共检测出5种耐药基因,其中tet(A)、tet(B)和Sul2基因检出率均为100%(6/6),bla_(SHV)基因检出率为83.3%(5/6),Sul1基因检出率为66.7%(4/6),bla_(KPC)、bla_(NDM)、bla_(CTX)、bla_(TEM)、aadA1、aadB、floR、qnrA、qnrB、qnrS、mcr-1基因均未检测出。说明分离到的6株鸡伤寒沙门氏菌表现为多重耐药且携带大量毒力基因,可能是引起该规模化孵化场鸡胚死亡的重要病原之一。
关键词
沙门氏菌
鸡伤寒沙门氏菌
垂直传播
毒力
耐药
Keywords
Salmonella
Salmonella enterica subsp.enterica serovar Typhimurium
vertical propagation
virulence
drug resistance
分类号
S831.7 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于免疫信息学技术的雏沙门菌多表位疫苗构建
谭菊
王永娟
郭广富
赵长菁
夏爱鸿
李巨银
吴敏秋
王宇航
覃秋苹
《中国畜牧兽医》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
蛋鸡养殖中新城疫危害及防控措施
赵长菁
李昕烨
王永娟
夏爱鸿
韩志蕾
袁橙
《现代畜牧科技》
2023
0
下载PDF
职称材料
3
泰州地区鸡胚源沙门氏菌的分离鉴定及耐药基因和毒力基因的检测
谭菊
王永娟
张雨馨
赵长菁
蔡丙严
武彩红
徐婷婷
郭广富
《黑龙江畜牧兽医》
北大核心
2023
1
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