2016—2021年河南省MTB/HIV双重感染流行特征分析

目的:分析河南省结核分枝杆菌(MTB)/HIV双重感染流行特征,为河南省乃至全国相关疫情防控提供依据。方法:从河南省“MTB/HIV双重感染防治管理工作年度报表”中收集2016—2021年MTB/HIV双重感染者相关资料,采用描述性统计方法和线性趋势卡方检验分析河南省2016—2021年MTB/HIV双重感染双向筛查率、登记率、三间分布及变化趋势。结果:2016—2021年河南省常住总人口为591960000名,共登记可随访结核病(TB)患者290450例、HIV/AIDS患者387785例,其中,MTB/HIV双重感染者1756例,年均登记率为0.30/10万,占TB患者的0.60%,占HIV/AIDS患者的0.45%。HIV/AIDS患者中TB的检出率从2016年的0.46%(263/57116)下降至2021年的0.28%(199/69862);TB患者中HIV抗体阳性的检出率从2016年的0.17%(47/27955)下降至2021年的0.10%(21/21914),MTB/HIV双重感染登记率从2016年的0.32/10万(310/97780000)下降至2021年的0.22/10万(220/98830000),均呈波动下降趋势(χ^(2)_(趋势)值分别为49.965、44.786、38.841,P值均<0.001)。2016—2021年男性MTB/HIV双重感染者比例[78.72%(1365/1734)]明显高于女性[21.28%(369/1734)],但5年间男女性别构成比的差异无统计学意义(χ^(2)_(趋势)=5.137,P=0.399)。同时,郑州市和周口市MTB/HIV双重感染年均登记率分别由2016年的0.38/10万(43/11190000)和0.15/10万(14/9220000)上升至2021年的0.46/10万(58/127420000)和0.26/10万(23/88530000),各年份均呈波动上升趋势(χ^(2)_(趋势)=26.088,P<0.001;χ^(2)_(趋势)=15.536,P=0.008)。结论:2016—2021年河南省MTB/HIV双重感染患者数呈逐年下降趋势,MTB/HIV双重感染疫情控制有效,但应关注男性、郑州市和周口市的感染情况。

2022年河南省公众结核病核心信息知晓情况及影响因素分析

目的分析河南省公众结核病防治核心信息知晓情况及影响因素,为结核病健康教育工作提供科学依据。方法采用分层系统随机抽样方法抽取12个调查点的1199名常住居民为调查对象,采用统一问卷进行面对面调查。使用SPSS 27.0统计软件进行描述性分析、χ^(2)检验和复杂抽样多因素logistic回归分析。结果2022年河南省结核病核心信息,包括肺结核的传染性、传播途径、症状、预防和预后的知晓率分别为79.48%、88.24%、91.08%、87.74%、70.81%,总知晓率和全部知晓率分别为83.47%和52.96%。对全部知晓率进行复杂抽样logistic回归分析,低年龄组高于高年龄组(OR=1.969);厂矿企业人群的全部知晓率较高(OR=1.721),在校学生的全部知晓率较低(OR=0.490);接受过宣传教育的人群高于未接受教育人群(OR=2.156);不同调查点OR值波动范围为0.152~10.053(P<0.05)。调查对象希望获取结核病防治知识的途径为广播、电视、电影、音像材料等(732/1199,61.05%)。结论河南公众对结核病防治核心信息的总知晓率接近但尚未达到目标(85%)要求,需继续开展有针对性的、公众需求的结核病宣传教育,重点提高老年人和学生等重点人群的结核病防治知识知晓水平。

二氧化硅致A549细胞损伤差异基因的生物信息学分析

目的分析二氧化硅(SiO2)刺激的人肺上皮细胞株A549细胞微阵列芯片差异表达基因(DEGs),筛选与A549细胞损伤相关的潜在关键基因和信号通路。方法从美国国立生物技术信息中心开发的公共基因芯片数据库下载芯片数据集GSE30215,采用GEO2R筛选SiO2刺激致A549细胞损伤的DEGs。将筛选出的DEGs导入生物学信息注释数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,同时采用相互作用基因库检索工具数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR)法对A549细胞进行关键DEGs的表达验证。结果共筛选出52个DEGs,其中上调的基因45个,下调的基因7个。GO富集分析结果显示,DEGs主要富集在胞外区,主要参与趋化因子、转录因子活性等细胞功能;KEGG信号通路分析结果显示,有关DEGs主要参与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、核苷酸寡聚化结构域样受体信号通路等。PPI网络筛选出的节点度值最高的前10个关键DEGs分别为CC趋化因子配体(CCL)2、环氧合酶2、白细胞介素-6、CXC趋化因子配体(CXCL)8、CXCL2、jun原癌基因、集落刺激因子2(CSF2)、CCL20、TNF-α诱导蛋白3(TNFAIP3)和CXCL5。实时荧光定量PCR结果显示,除CCL2外,其余9个关键基因表达变化情况与筛选结果一致。结论采用生物信息学的方法筛选出SiO2刺激A549细胞损伤的10个关键DEGs,其中CSF2、CCL20和TNFAIP3可能为包括尘肺病在内的多种肺纤维化疾病发生发展过程中的机制研究提供新的研究方向。

2013-2019年河南省某县结核病4次抽样调查结果

目的 了解河南省尉氏县居民结核病疫情特征及变化趋势,探讨降低结核病患病率和发病率,提高结核病患者发现率,及有效控制结核病疫情的措施。方法 选择河南省尉氏县有地区代表性的社区作为调查现场,在2013-2015年及2019年每年开展1次抽样调查,每次抽样人口不少于3.5万人,对其中结核病发病重点人群(可疑症状者、结核患者密切接触者、既往结核患者、糖尿病患者、HIV感染者及65岁以上老年人)进行体检,发现结核病患者,分析结核病疫情特征和变化趋势。结果 4次调查共做问卷和访谈120 419人次,4次应检人口接受调查和健康教育的比例均>90%。2013年、2014年、2015年和2019年活动性肺结核患病率分别为216.8/10万、142.6/10万、89.4/10万和51.3/10万,发病率分别为166.8/10万、109.4/10万、61.9/10万和28.9/10万;涂阳患病率分别为23.4/10万、16.6/10万、13.7/10万和6.4/10万,菌阳患病率分别为40.0/10万、29.8/10万、24.1/10万和19.2/.10万。肺结核患者中,无症状者占44.7%,无症状者中老年患者比例82.1%;按患者来源分类:可疑症状者中检出率为7.8%,65岁以上老年人中检出率为1.3%,其他人群检出率为0.7%,不同人群患者检出率差异有统计学意义(P<0.05)。结论 通过对社区人口的健康教育和对结核病发病重点人群的主动干预,肺结核患病率及发病率呈明显下降趋势;65岁以上老年人是结核病发病的高危人群;建立对结核病重点人群的主动干预模式是提高结核病患者发现率、降低结核病疫情的重要措施。

转化生长因子-β1致肺成纤维细胞转分化过程中差异表达基因的筛选和验证

[背景]肺成纤维细胞向肌成纤维细胞转分化是矽肺由炎症期进入纤维化期的标志性细胞事件,转化生长因子-β1(TGF-β1)是此环节中最重要的细胞因子。近年来,随着高通量测序和芯片技术的发展,越来越多TGF-β1刺激成纤维细胞转分化的数据被人们所关注。[目的]利用生物信息学相关方法探索TGF-β1刺激的人肺成纤维细胞转分化过程中差异共表达基因,筛选与肺成纤维细胞转分化密切相关的转录因子。[方法]从基因表达综合数据库GEO检索并下载TGF-β1与肺成纤维细胞相关的高通量数据集GSE17518、GSE97829和GSE119007,对数据集进行差异分析,筛选三组数据集共同上调和共同下调的差异表达基因;对筛选出的差异基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析;通过HumanTFDB数据库,下载所有人转录因子基因名称和序列,并与上述获得的共表达差异基因进行比对,得到共表达差异转录因子;随后用TGF-β1刺激人胚肺成纤维细胞MRC-5构建转分化模型,对筛选出的差异转录因子进行初步验证。[结果]基于这三个数据集,共得到145个上调差异表达基因,88个下调差异表达基因。GO分析结果显示:上述共表达差异基因主要参与细胞外基质、肌动蛋白细胞骨架、内质网腔等组分的构成;并且与肌动蛋白结合、生长因子活性、细胞外基质结构性成分、胶原结合、TGF-β1受体结合等生物学过程相关;此外还与细胞外基质组织、细胞迁移和凋亡,以及丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路活化、MAPK激活、肽基酪氨酸磷酸化的正调节等有关。通过KEGG信号通路富集分析,筛选出的主要相关信号通路包括TGF-β1信号通路、细胞外基质-受体相互作用、黏着斑和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路等。将上述得到的差异基因与人转录因子序列进行比对,得到了7个上调的转录因子和11个下调的转录因子,从中挑选的上调转录因子早期生长应答因子2(EGR2)、SNAIL家族转录抑制因子1(SNAIL1)和下调转录因子胸腺选择相关高迁移转录因子(TOX)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)在TGF-β1刺激MRC-5细胞中的qRT-PCR验证结果显示,EGR2和SNAIL1均高表达,而TOX和PPARG均低表达。[结论]筛选出18个与肺成纤维细胞转分化相关的转录因子基因,其中在TGF-β1刺激MRC-5细胞中EGR2和SNAIL1表达升高,TOX和PPARG表达降低。

TGF-β1致MRC-5细胞转分化的差异microRNAs表达分析

目的探讨转化生长因子-β1(TGF-β1)刺激的人胚肺成纤维细胞株MRC-5细胞基因表达微阵列芯片的差异表达微小RNA(miRNA),筛选成纤维细胞转分化的关键基因和信号通路。方法从美国国立信息中心的高通量基因表达数据库下载TGF-β1刺激MRC-5细胞的miRNA表达芯片数据集GSE43992,采用R语言Limma包进行差异表达miRNAs的筛选,通过miRWalk数据库预测其对应的靶基因,对差异表达的miRNAs和靶基因进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析,构建蛋白质相互作用(PPI)网络。结果共筛选出5条差异表达的miRNAs,包括4个上调的miRNAs和1个下调的miRNA,并预测出42个对应的差异表达靶基因。GO富集分析结果显示,靶基因主要参与胶原蛋白分解代谢、胞外基质组织、膜组织、胶原纤维组织和细胞对氨基酸刺激的反应等生物学过程;KEGG信号通路分析结果显示,miRNAs和相应靶基因所对应的信号通路主要集中在18条信号通路上,主要与miRNAs在肿瘤方面、糖尿病并发症中的年龄-种族信号通路和蛋白质消化与吸收有关。PPI网络筛选出的3个成纤维细胞向肌成纤维细胞转分化核心基因分别为苏氨酸激酶1、雌激素受体1和β-连环蛋白。结论共筛选出与TGF-β1致MRC-5细胞转分化相关的5个差异表达的miRNAs、42个靶基因、18条信号通路和3个核心基因,可为包括尘肺病及肺纤维化在内的多种疾病的治疗和研究提供新的参考。

从猪肉中分离的两株携带mcr-1肺炎克雷伯菌分子特征研究

目的 对2株食源性mcr-1阳性的肺炎克雷伯菌的耐药分子特征进行研究,为畜禽动物养殖过程中抗生素的合理使用及耐药菌株防控提供依据。方法 采用微量肉汤稀释法对2016年从猪肉样品中分离的2株肺炎克雷伯菌进行药敏试验,并通过聚合酶链式反应(PCR)对2株多黏菌素B耐药的肺炎克雷伯菌(编号为CP143和SJP177)进行mcr耐药基因检测,运用全基因组测序对2株肺炎克雷伯菌进行耐药基因、质粒复制子类型识别。结果 两株菌均为mcr-1阳性肺炎克雷伯菌,CP143对多黏菌素B、复方磺胺、氯霉素、四环素抗生素耐药,SJP177对多黏菌素B、氨苄西林、头孢噻肟、头孢他啶、庆大霉素、氯霉素、阿奇霉素、四环素、环丙沙星和萘啶酸抗生素耐药;脉冲场电泳(Pulse Field Gel Electrophoresis,PFGE)显示菌株之间的亲缘关系较远;全基因组序列分析结果显示CP143菌株含有IncFIB,IncFII,IncHI1B和IncX4 4个不相容群质粒,SJP177菌株含有Col,Col156,Col RNAI,IncFI,IncHI2,IncHI2A,IncR和pENTAS02 8个不相容群质粒。此外,CP143菌株携带mcr-1、sul1、flo R、tet(A)耐药相关基因,SJP177菌株携带mcr-1、bla、bla、armA、floR、mph(A/E)、msr(E)、tet(A)、qnrS1耐药相关基因。结论 2株mcr-1阳性肺炎克雷伯菌都为多重耐药菌株,并携带相关的耐药基因,研究结果提示应加强对食用畜禽养殖过程中抗生素合理使用的指导和监控。

2018—2021年河南省周口市肺结核患者就诊和诊断延迟及影响因素分析

目的探讨河南省周口市肺结核患者就诊和诊断延迟情况及其影响因素,为制定肺结核防控措施提供数据支持。方法从结核病管理信息系统导出2018—2021年周口市肺结核患者数据,采用单因素和多因素logistic回归分析延迟的影响因素。结果2018—2021年周口市肺结核患者14288例,就诊延迟6119例,诊断延迟5447例,就诊和诊断时间中位数分别为10(1,28)d和7(1,30)d;就诊延迟和诊断延迟率分别为42.83%和38.12%,且随时间呈上升趋势(χ^(2)_(趋势)值分别为25.248、30.865,P均<0.05)。女性[OR值(95%CI):1.091(1.001~1.190)]、少数民族[OR值(95%CI):2.243(1.212~4.152)]、外地户籍[OR值(95%CI):2.669(2.387~2.985)]、工人/农民/民工职业患者[OR值(95%CI):1.427(1.144~1.780)]、因症就诊[OR值(95%CI):4.365(3.177~5.998)]、复治[OR值(95%CI):1.419(1.177~1.711)]、病原学阳性[以病原学阳性为参照,病原学阴性OR值(95%CI):0.921(0.850~0.999)]是就诊延迟的危险因素。2020—2021年(OR值均>1)、≥60岁(以≥60岁为参照,其他组OR值均<1)、外地户籍[OR值(95%CI):3.935(3.479~4.451)]、因症就诊[OR值(95%CI):1.964(1.455~2.651)]是诊断延迟的危险因素。结论周口市肺结核患者就诊和诊断延迟现象成上升态势,各地应加大肺结核相关知识宣教力度,提高主动发现率,同时加强医务人员对肺结核的鉴别诊断,降低发现延迟发生。