-
题名茄子斑驳皱缩病毒病病原物的鉴定及分子进化分析
- 1
-
-
作者
邵宇纯
仲健新
路云爽
宋美娜
陈雅寒
-
机构
甘肃农业大学植物保护学院
-
出处
《江苏农业学报》
CSCD
北大核心
2023年第3期674-682,共9页
-
基金
甘肃农业大学省级大学生创新创业训练计划项目(S202210733027)
国家自然科学基金项目(32160628)
+2 种基金
甘肃省自然科学基金项目(21JR7RA820)
甘肃省高等学校创新基金项目(2021B-117)
甘肃农业大学人才启动资金项目(GAU-KYQD-2019-22)。
-
文摘
为了鉴定引起茄子斑驳皱缩病毒病的病原物,利用siRNA高通量测序技术(Small interfering RNA,siRNA),结合生物信息学的方法发现2个表现斑驳和皱缩的茄子样品中存在蚕豆萎蔫病毒2号(Broad bean wilt virus,BBWV2)、葡萄A病毒(Grapevine virus A,GVA)和烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)。采用RT-PCR技术对该结果进行验证,2个样品中均检测到BBWV2和TMV,未检测到GVA。通过对BBWV2外壳蛋白(Large coat protein,LCP)大亚基基因进行测序和分子进化分析,获得了2条1126 bp的BBWV2 LCP基因片段,2条BBWV2 LCP基因的核苷酸序列及其编码的氨基酸序列一致性分别为99.6%和99.3%;与NCBI中已发表的23个BBWV2 LCP基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列一致性分别为79.9%~95.2%和80.5%~97.2%。基于LCP基因核苷酸序列进行种群结构和遗传多样性分析,结果表明在系统发育进化树中,BBWV2可分为两大支。不同寄主BBWV2 LCP基因的遗传距离在0.049~0.332。
-
关键词
茄子
斑驳皱缩病毒病
蚕豆萎蔫病毒2号
烟草花叶病毒
LCP基因
-
Keywords
eggplant
mottle crinkle disease
broad bean wilt virus 2
tobacco mosaic virus
LCP gene
-
分类号
S641.1
[农业科学—蔬菜学]
-