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部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
被引量:
3
1
作者
路洁霏
伍碧华
+1 位作者
郑雯
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2006年第1期7-12,共6页
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整...
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整个LMW-GS二级结构中,无规则卷曲最多,达69.51%,α-螺旋(28.97%)较β-折叠(1.36%)占有绝对优势,因而归属于α结构型蛋白。其中,信号肽由大量α-螺旋和微量无规则卷曲组成,N-端和重复区均由无规则卷曲占据,而C-末端除富含α-螺旋和无规则卷曲外,还是β-折叠的唯一分布区。同时,两个分子间二硫键存在于无规则卷曲中,而另有6个分子内二硫键分布于α-螺旋内或其附近,由此推导出小麦LMW-GS二级结构的平面模式图。这种特异的LMW-GS二级结构不仅进一步证明了“蛋白质一级结构决定高级结构”,以及信号肽引导新合成的LMW-GS顺利进入相应细胞器等经典理论,而且从空间结构的水平上阐释了LMW-GS多肽链致密化及其互聚体形成、富集,并与HMW-GS一起影响面粉加工品质的结构基础。
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关键词
小麦
低分子量谷蛋白亚基
二级结构
结构型蛋白
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职称材料
野生二粒小麦籽粒蛋白质含量和库容性状的遗传多样性与可利用性研究
被引量:
7
2
作者
伍碧华
路洁霏
+2 位作者
李平
胡喜贵
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2008年第3期221-225,共5页
为了从近缘物种中寻找高蛋白质含量和大库容特性的遗传种质,为高产、优质,以及二者并重型小麦新品种培育提供基因资源,本研究对110份引自以色列的野生二粒小麦籽粒蛋白质含量、千粒重、库容等性状进行了分析。结果表明,野生二粒小...
为了从近缘物种中寻找高蛋白质含量和大库容特性的遗传种质,为高产、优质,以及二者并重型小麦新品种培育提供基因资源,本研究对110份引自以色列的野生二粒小麦籽粒蛋白质含量、千粒重、库容等性状进行了分析。结果表明,野生二粒小麦的蛋白质含量、千粒重、籽粒长度、宽度、厚度及粒积均具有较丰富的遗传多样性。其中,蛋白质含量变幅为13.17%~27.20%,平均19.89%;千粒重变幅为7.95~33.02g,平均20.20g;籽粒长度变幅为6.59~10.16mm,平均8.60mm;籽粒宽度变幅为1.21~2.77mm,平均2.11mm;籽粒厚度变幅为1.67~2.83mm,平均2.33mm;籽粒粒积变幅为16.16~71.21mm^3,平均43.78mm^3。相关分析表明,110份野生二粒小麦的蛋白质含量与千粒重整体上呈显著负相关性(r=-0.254,P〈0.01),而粒长、粒宽、粒厚、粒积各库容性状之间,以及各库容性状与千粒重之间均在0.001水平上显著正相关。但蛋白质含量与千粒重之间相关性的具体表现因材料而存在差异。比较分析发现,一些材料具有蛋白含量、千粒重和粒积均高的特性。与普通小麦相比,野生二粒小麦中蕴藏着丰富的高蛋白质含量和大库容性的特异基因资源。
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关键词
野生二粒小麦
蛋白质含量
千粒重
库容
遗传多样性
可利用性
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职称材料
野生二粒小麦低分子量谷蛋白基因序列分析
3
作者
伍碧华
路洁霏
+4 位作者
胡喜贵
李平
颜泽洪
刘登才
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2008年第4期385-392,共8页
根据低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因编码区保守序列设计引物,用PCR方法从蛋白质含量低至13.17%的D81和高达27.20%的D42 2份野生二粒小麦(Triticumdicoccoides)中克隆得到2个LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank上的序列号分别为FJ4...
根据低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因编码区保守序列设计引物,用PCR方法从蛋白质含量低至13.17%的D81和高达27.20%的D42 2份野生二粒小麦(Triticumdicoccoides)中克隆得到2个LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank上的序列号分别为FJ461691和FJ461690)。它们具有小麦低分子量谷蛋白基因的典型结构特征,其长度分别为1053bp和1011bp,并分别编码350和336个氨基酸残基的成熟蛋白。LMW-D42和LMW-D81的氨基酸序列估算分子量分别为38kDa和39kDa,说明二者均为C型亚基编码基因。LMW-D42和LMW-D81的N-末端序列都为METSHIP-,表明这2个C型亚基编码基因归属LMW-m型。同源性比对和聚类分析揭示,LMW-D81和LMW-D42均属于Glu-B3位点编码基因。LMW-D42和LMW-D81的核苷酸序列和推导的氨基酸序列一致性分别为93.94%和92.57%。与LMW-D81相比,LMW-D42除发生了22处间断性的碱基替换外,还存在一段42个碱基的缺失。对推导氨基酸序列进行的二级结构预测显示,LMW-D81和LMW-D42的蛋白质二级结构高度一致。其α-螺旋主要位于信号肽和C-末端,少量的α-螺旋和不规则卷曲构成了N-末端。大多数不规则卷曲位于重复区,仅有的一段β-折叠则出现在C-末端。同时,它们的编码区均具有分布一致的8个半胱氨酸残基,且第一和第七个半胱氨酸残基均位于无规则卷曲中。这些结构特点对小麦加工品质改良具有一定意义。
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关键词
野生二粒小麦
低分子量谷蛋白
基因克隆
序列分析
二级结构
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职称材料
题名
部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
被引量:
3
1
作者
路洁霏
伍碧华
郑雯
郑有良
机构
四川农业大学小麦研究所
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2006年第1期7-12,共6页
基金
国家自然科学基金(30571139)
'教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0453)
+1 种基金
四川省教育厅重点项目
四川省学术和技术带头人培养基金。
文摘
为了从蛋白质高级结构的水平上研究小麦低分子量谷蛋白结构与功能的关系,利用互联网上开放的预测软件和蛋白质序列分析软件对已获得全序列,并明确其染色体定位的19个LMW-GS基因的推导氨基酸序列进行二级结构的预测和分析。结果表明,在整个LMW-GS二级结构中,无规则卷曲最多,达69.51%,α-螺旋(28.97%)较β-折叠(1.36%)占有绝对优势,因而归属于α结构型蛋白。其中,信号肽由大量α-螺旋和微量无规则卷曲组成,N-端和重复区均由无规则卷曲占据,而C-末端除富含α-螺旋和无规则卷曲外,还是β-折叠的唯一分布区。同时,两个分子间二硫键存在于无规则卷曲中,而另有6个分子内二硫键分布于α-螺旋内或其附近,由此推导出小麦LMW-GS二级结构的平面模式图。这种特异的LMW-GS二级结构不仅进一步证明了“蛋白质一级结构决定高级结构”,以及信号肽引导新合成的LMW-GS顺利进入相应细胞器等经典理论,而且从空间结构的水平上阐释了LMW-GS多肽链致密化及其互聚体形成、富集,并与HMW-GS一起影响面粉加工品质的结构基础。
关键词
小麦
低分子量谷蛋白亚基
二级结构
结构型蛋白
Keywords
wheat
low molecular weight glutenin
secondary structure
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
野生二粒小麦籽粒蛋白质含量和库容性状的遗传多样性与可利用性研究
被引量:
7
2
作者
伍碧华
路洁霏
李平
胡喜贵
郑有良
机构
四川农业大学小麦研究所四川温江
四川农业大学教育部作物基因资源与遗传改良重点实验室
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2008年第3期221-225,共5页
基金
国家自然科学基金(30571139)
教育部长江学者和创新团队发展计划(IRT0453)
+1 种基金
四川省教育厅重点项目
四川省学术和技术带头人培养基金。
文摘
为了从近缘物种中寻找高蛋白质含量和大库容特性的遗传种质,为高产、优质,以及二者并重型小麦新品种培育提供基因资源,本研究对110份引自以色列的野生二粒小麦籽粒蛋白质含量、千粒重、库容等性状进行了分析。结果表明,野生二粒小麦的蛋白质含量、千粒重、籽粒长度、宽度、厚度及粒积均具有较丰富的遗传多样性。其中,蛋白质含量变幅为13.17%~27.20%,平均19.89%;千粒重变幅为7.95~33.02g,平均20.20g;籽粒长度变幅为6.59~10.16mm,平均8.60mm;籽粒宽度变幅为1.21~2.77mm,平均2.11mm;籽粒厚度变幅为1.67~2.83mm,平均2.33mm;籽粒粒积变幅为16.16~71.21mm^3,平均43.78mm^3。相关分析表明,110份野生二粒小麦的蛋白质含量与千粒重整体上呈显著负相关性(r=-0.254,P〈0.01),而粒长、粒宽、粒厚、粒积各库容性状之间,以及各库容性状与千粒重之间均在0.001水平上显著正相关。但蛋白质含量与千粒重之间相关性的具体表现因材料而存在差异。比较分析发现,一些材料具有蛋白含量、千粒重和粒积均高的特性。与普通小麦相比,野生二粒小麦中蕴藏着丰富的高蛋白质含量和大库容性的特异基因资源。
关键词
野生二粒小麦
蛋白质含量
千粒重
库容
遗传多样性
可利用性
Keywords
Triticum dicoccoides
protein content
1000-grain weight
grain sink
genetic diversity
potential utilization
分类号
S512 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
野生二粒小麦低分子量谷蛋白基因序列分析
3
作者
伍碧华
路洁霏
胡喜贵
李平
颜泽洪
刘登才
郑有良
机构
四川农业大学小麦研究所
教育部作物基因资源与遗传改良重点实验室
出处
《四川农业大学学报》
CSCD
2008年第4期385-392,共8页
基金
国家自然科学基金(30571139)
四川省教育厅重点项目
四川省学术和技术带头人培养基金
文摘
根据低分子量谷蛋白亚基(LMW-GS)基因编码区保守序列设计引物,用PCR方法从蛋白质含量低至13.17%的D81和高达27.20%的D42 2份野生二粒小麦(Triticumdicoccoides)中克隆得到2个LMW-GS基因序列LMW-D81和LMW-D42(GenBank上的序列号分别为FJ461691和FJ461690)。它们具有小麦低分子量谷蛋白基因的典型结构特征,其长度分别为1053bp和1011bp,并分别编码350和336个氨基酸残基的成熟蛋白。LMW-D42和LMW-D81的氨基酸序列估算分子量分别为38kDa和39kDa,说明二者均为C型亚基编码基因。LMW-D42和LMW-D81的N-末端序列都为METSHIP-,表明这2个C型亚基编码基因归属LMW-m型。同源性比对和聚类分析揭示,LMW-D81和LMW-D42均属于Glu-B3位点编码基因。LMW-D42和LMW-D81的核苷酸序列和推导的氨基酸序列一致性分别为93.94%和92.57%。与LMW-D81相比,LMW-D42除发生了22处间断性的碱基替换外,还存在一段42个碱基的缺失。对推导氨基酸序列进行的二级结构预测显示,LMW-D81和LMW-D42的蛋白质二级结构高度一致。其α-螺旋主要位于信号肽和C-末端,少量的α-螺旋和不规则卷曲构成了N-末端。大多数不规则卷曲位于重复区,仅有的一段β-折叠则出现在C-末端。同时,它们的编码区均具有分布一致的8个半胱氨酸残基,且第一和第七个半胱氨酸残基均位于无规则卷曲中。这些结构特点对小麦加工品质改良具有一定意义。
关键词
野生二粒小麦
低分子量谷蛋白
基因克隆
序列分析
二级结构
Keywords
Triticum dicoccoides
low molecular weight glutenin
gene cloning
sequence analy-sis
secondary structure
分类号
S512.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
部分小麦低分子量谷蛋白亚基二级结构的预测与分析
路洁霏
伍碧华
郑雯
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2006
3
下载PDF
职称材料
2
野生二粒小麦籽粒蛋白质含量和库容性状的遗传多样性与可利用性研究
伍碧华
路洁霏
李平
胡喜贵
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2008
7
下载PDF
职称材料
3
野生二粒小麦低分子量谷蛋白基因序列分析
伍碧华
路洁霏
胡喜贵
李平
颜泽洪
刘登才
郑有良
《四川农业大学学报》
CSCD
2008
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职称材料
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