中华按蚊CYP6Y亚家族基因的鉴定和生物信息学分析

【目的】鉴定中华按蚊Anopheles sinensis CYP6Y亚家族基因,分析它们的结构和特征,推测其可能的功能。【方法】以冈比亚按蚊An.gambiae CYP6Y1作为询问序列,通过双向Blast方法检索中华按蚊转录组中CYP6Y亚家族基因,并通过生物信息学方法分析基因结构、特征及可能的功能。【结果】从中华按蚊转录组测序数据中鉴定出2条CYP6Y亚家族基因,分别命名为AsCYP6Y1(GenBank登录号:KF709397)和AsCYP6Y2(GenBank登录号:KF709398)。序列分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2全长分别为1 713 bp和1 815 bp,分别编码502和526个氨基酸。基因结构分析显示,该亚家族基因仅含有1个相位1型内含子并与其他P450基因形成保守的共线性分布。蛋白结构分析显示,这2个基因编码的蛋白含P450特有的5个特征序列和6个底物结合位点,且均不存在信号肽,其亚细胞定位为细胞质。3D结构分析显示,AsCYP6Y1有18条α螺旋和13股反向平行的β折叠,AsCYP6Y2有19条α螺旋和11股反向平行的β折叠。通过同样的方法,在达林按蚊An.darlingi中也鉴定出2个CYP6Y亚家族基因。系统进化分析显示,AsCYP6Y1和AsCYP6Y2分别与其他3种按蚊的CYP6Y1和CYP6Y2聚成一支,Bootstrap值均大于90%。替换率分析显示,中华按蚊AsCYP6Y1和AsCYP6Y2与其他3种按蚊同源基因的Ka/Ks均小于1。相对进化速率分析显示,中华按蚊CYP6Y和CYP6M亚家族的相对进化速率均显著快于CYP6P亚家族,而CYP6Y和CYP6M亚家族之间没有显著差异。【结论】在中华按蚊和达林按蚊中存在2个CYP6Y亚家族基因,之前在冈比亚按蚊和不吉按蚊An.funestus中也发现2个CYP6Y亚家族基因,表明CYP6Y亚家族基因可能在按蚊属广泛存在,且可能为按蚊属昆虫所特有。

葱蝇过氧化氢酶基因的克隆及生物信息学分析

过氧化氢酶(catalase,CAT)对昆虫的生长发育和代谢活动具有重要意义,是昆虫清除H2O2的关键酶.昆虫在滞育期间代谢速率很低,而CAT的活力与代谢强度有关,因此滞育期的昆虫是研究该酶的良好材料.本研究基于葱蝇转录组unigene序列信息,设计特异性引物并首次通过PCR技术克隆了葱蝇过氧化氢酶基因全长cDNA,命名为DaCAT,其全长为2 073bp,开放阅读框1 518bp,编码505个氨基酸,推测其相对分子质量为5.68×104,等电点为7.72.该研究对其进行了生物信息学分析并建立了系统发育树,分析表明该基因编码的氨基酸序列具有2个保守结构域及多个酶活性位点,与其他物种CAT具有较高的同源性,其中和拟果蝇Drosophila simulans亲缘关系最近,相似率为89.3%,采用SWISS-MODEL对其进行了蛋白质同源建模及3D结构预测分析,为进一步研究DaCAT基因在葱蝇滞育期间的代谢表达、酶活力测定以及具体功能奠定了基础.

煤矿高预应力强力锚杆锚索组合支护参数及应用

针对受采动影响的复杂困难巷道,提出采用高预应力强力锚杆锚索组合支护系统控制巷道围岩变形,并在潞安五阳煤矿7609运输巷成功应用。详细叙述了7609运输巷的支护参数,分析高预应力强力锚杆锚索组合支护原理。该支护系统提高了围岩承载能力,控制围岩变形,解决了7609运输巷受采动影响变形大的支护难题。

充分运用电化教学 优化语文课堂导入

一个精彩的导入环节可为整堂语文课教学奠定良好的基础。随着信息技术时代的迅速发展,随着新课改的不断深入,作为语文老师,应该充分地运用电化教学的手段,使语文课堂导入环节的设计能够体现其启发性、目的性和趣味性原则。遵循了这些原则的导入自然是优化了的课堂导入环节,在优化了导入的基础上,达到实现提高语文教学效益的目的。

炮掘巷道临时支护的开发策略探究

本文从炮掘巷道临时支护问题入手,预测炮掘巷道临时支护的发展趋势,构建炮掘巷道临时支护的开发对策,以期为炮掘巷道临时支护的后续研究提供借鉴。

中华按蚊CYP6P5基因的生物信息学鉴定及特征分析

目的鉴定中华按蚊CYP6P5基因并分析其序列特征，为研究中华按蚊CYP6P5基因杀虫剂抗性机制提供理论依据。方法以催命按蚊基因CYP6P5为询问基因，基于中华按蚊转录组测序数据，采用双向Blast方法搜寻中华按蚊CYP6P5cDNA序列。利用生物信息学相关软件对该基因编码蛋白序列的一级结构、疏水区、跨膜区、结构域、3D结构等进行预测分析，并采用最大似然法（maximumlikelihood，ML）建立代表性蚊种的系统发育关系。结果搜索获得1条中华按蚊CYP6P5全长cDNA序列。该cDNA序列具备P450超家族和CYP6家族特征性的保守序列，命名为CYP6P5（GenBank登录号：KF358704）。该cDNA全长为1583bp，开放阅读框为1527bp，编码508个氨基酸，推测其相对分子质量为58．32×10-3，等电点为7．17。分析表明该基因编码的蛋白序列第5～21位氨基酸是疏水区，第5～22位氨基酸是跨膜区，第36～505位氨基酸是P450保守结构域，并具有多个酶活性位点。系统发育关系和相似性分析表明，中华按蚊CYP6P5与催命按蚊CYP6P5和冈比亚按蚊CYP6P5亲缘关系最近，形成一个单系，相似率分别为89．4％和89．0％。结论为进一步研究中华按蚊CYP6P5基因溴氰菊酯抗性的分子机制奠定了基础。

二次内共生质体蛋白质转运

目前有关质体蛋白质转运的认识主要集中在具有典型叶绿体结构的生物中,在具有二次内共生质体的低等的单细胞真核生物中尚缺乏认识。二次内共生质体具有特殊的质体结构,其质体蛋白质转运系统也相对复杂。本文将对二次内共生质体蛋白质转运系统的研究进行概述。