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CRISPR/AsCpf1双切刻系统构建初探
被引量:
3
1
作者
辛京京
李和刚
+2 位作者
秦怀远
张宁
赵金山
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020年第12期174-180,共7页
为了在CRISPR/AsCpf1系统的基础上构建双切刻系统,提高基因编辑特异性,本研究设计并构建Cpf1n(R1226A)、Cpf1-RRA(S542R/K607R/K949A)、Cpf1-RRAA(S542R/K607R/K949A/R1226A)3个突变体以及相应的crRNA表达载体,通过特定质粒组合与SSA-D...
为了在CRISPR/AsCpf1系统的基础上构建双切刻系统,提高基因编辑特异性,本研究设计并构建Cpf1n(R1226A)、Cpf1-RRA(S542R/K607R/K949A)、Cpf1-RRAA(S542R/K607R/K949A/R1226A)3个突变体以及相应的crRNA表达载体,通过特定质粒组合与SSA-DKK2报告质粒共转染绵羊成纤维细胞,通过双荧光素酶检测的方式来验证DNA切割效率。结果显示:针对TTTV PAM的CRISPR/AsCpf1双切刻系统有DNA双链切割活性,但是单个的AsCpf1切口酶的DNA双链切割活性并未完全丧失;AsCpf1-RRA突变体针对TYCV PAM靶标具有一定的DNA双链切割活性;AsCpf1-RRAA突变体没有检测到针对TYCV PAM靶标的DNA双链和单链切割活性,但可能保留了DNA结合能力。本研究结果为后续高效CRISPR/Cpf1双切刻系统的开发与改进提供了重要参考。
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关键词
CRISPR/AsCpf1
双切刻系统
特异性
突变体
TYCV
PAM
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职称材料
指向核心素养培养的小学数学项目式学习——以“一亿有多大”为例
被引量:
7
2
作者
辛京京
马由然
郝连杰
《中小学数字化教学》
2023年第2期20-23,共4页
随着义教新课标的颁布,项目式学习作为一种促进培养核心素养的有效学习方式,受到一线教师的广泛关注。对于小学四年级数学中“一亿有多大”这一主题,教师基于EPBL系统开展证据导向的项目式学习,并通过“创设情境,明确问题”“提出猜想,...
随着义教新课标的颁布,项目式学习作为一种促进培养核心素养的有效学习方式,受到一线教师的广泛关注。对于小学四年级数学中“一亿有多大”这一主题,教师基于EPBL系统开展证据导向的项目式学习,并通过“创设情境,明确问题”“提出猜想,设计方案”“调查实验,协作探究”“建立模型,形成方案”“创作作品,汇报交流”“评价修改,总结反思”等环节,有效落实了对学生核心素养的培养。
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关键词
小学数学
项目式学习
一亿有多大
数感
信息技术
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职称材料
无PAM限制的CRISPR/Cas9系统构建及效率验证
3
作者
秦怀远
李和刚
+2 位作者
张宁
辛京京
赵金山
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第4期189-194,199,共7页
CRISPR/Cas9系统在进行靶向基因敲除、转录激活以及抑制时,需要通过识别Cas9靶位点上的一个原间隔子相邻基序(PAM)序列进行特异性靶向基因编辑。现阶段,被广泛认可的化脓性链球菌SpCas9仅识别比较短的PAM为NGG(N为任意碱基,G为鸟嘌呤)...
CRISPR/Cas9系统在进行靶向基因敲除、转录激活以及抑制时,需要通过识别Cas9靶位点上的一个原间隔子相邻基序(PAM)序列进行特异性靶向基因编辑。现阶段,被广泛认可的化脓性链球菌SpCas9仅识别比较短的PAM为NGG(N为任意碱基,G为鸟嘌呤)。本实验在野生型SpCas9、PAM为NG的xCas9和SpCas9-NG的基础上,构建预期PAM为NNG的突变体SpCas9NNG、预期PAM为NNN的突变体xCas9NNN和ngCas9NNN,通过双荧光素酶报告基因检测评价其切割活性。结果显示:本次实验构建的ngCas9NNN突变体对PAM为NNN的靶标DNA具有显著的切割活性,为后续拓宽CRISPR/Cas9系统的靶向范围提供重要参考。
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关键词
CRISPR/Cas9
无PAM限制
突变体
基因编辑
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职称材料
题名
CRISPR/AsCpf1双切刻系统构建初探
被引量:
3
1
作者
辛京京
李和刚
秦怀远
张宁
赵金山
机构
青岛农业大学动物科技学院
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020年第12期174-180,共7页
基金
国家自然科学基金面上项目(31572383)
青岛市民生科技计划项目(19-6-1-63-nsh)
山东省草学一流学科建设资助项目(2019-08)。
文摘
为了在CRISPR/AsCpf1系统的基础上构建双切刻系统,提高基因编辑特异性,本研究设计并构建Cpf1n(R1226A)、Cpf1-RRA(S542R/K607R/K949A)、Cpf1-RRAA(S542R/K607R/K949A/R1226A)3个突变体以及相应的crRNA表达载体,通过特定质粒组合与SSA-DKK2报告质粒共转染绵羊成纤维细胞,通过双荧光素酶检测的方式来验证DNA切割效率。结果显示:针对TTTV PAM的CRISPR/AsCpf1双切刻系统有DNA双链切割活性,但是单个的AsCpf1切口酶的DNA双链切割活性并未完全丧失;AsCpf1-RRA突变体针对TYCV PAM靶标具有一定的DNA双链切割活性;AsCpf1-RRAA突变体没有检测到针对TYCV PAM靶标的DNA双链和单链切割活性,但可能保留了DNA结合能力。本研究结果为后续高效CRISPR/Cpf1双切刻系统的开发与改进提供了重要参考。
关键词
CRISPR/AsCpf1
双切刻系统
特异性
突变体
TYCV
PAM
Keywords
CRISPR/AsCpf1
Double-nicking System
Specificity
Mutant
TYCV PAM
分类号
Q812 [生物学—生物工程]
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职称材料
题名
指向核心素养培养的小学数学项目式学习——以“一亿有多大”为例
被引量:
7
2
作者
辛京京
马由然
郝连杰
机构
天津市东丽区英华学校
出处
《中小学数字化教学》
2023年第2期20-23,共4页
基金
北京师范大学未来教育高精尖创新中心与天津英华实验学校“技术革新未来教学的探索研究”项目阶段性研究成果
文摘
随着义教新课标的颁布,项目式学习作为一种促进培养核心素养的有效学习方式,受到一线教师的广泛关注。对于小学四年级数学中“一亿有多大”这一主题,教师基于EPBL系统开展证据导向的项目式学习,并通过“创设情境,明确问题”“提出猜想,设计方案”“调查实验,协作探究”“建立模型,形成方案”“创作作品,汇报交流”“评价修改,总结反思”等环节,有效落实了对学生核心素养的培养。
关键词
小学数学
项目式学习
一亿有多大
数感
信息技术
分类号
G623.5 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
无PAM限制的CRISPR/Cas9系统构建及效率验证
3
作者
秦怀远
李和刚
张宁
辛京京
赵金山
机构
青岛农业大学动物科技学院
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021年第4期189-194,199,共7页
基金
国家自然科学基金(31572383、31301936)
青岛市民生科技计划(19-6-1-68-nsh、19-6-1-63-nsh)
山东省草学一流学科建设经费。
文摘
CRISPR/Cas9系统在进行靶向基因敲除、转录激活以及抑制时,需要通过识别Cas9靶位点上的一个原间隔子相邻基序(PAM)序列进行特异性靶向基因编辑。现阶段,被广泛认可的化脓性链球菌SpCas9仅识别比较短的PAM为NGG(N为任意碱基,G为鸟嘌呤)。本实验在野生型SpCas9、PAM为NG的xCas9和SpCas9-NG的基础上,构建预期PAM为NNG的突变体SpCas9NNG、预期PAM为NNN的突变体xCas9NNN和ngCas9NNN,通过双荧光素酶报告基因检测评价其切割活性。结果显示:本次实验构建的ngCas9NNN突变体对PAM为NNN的靶标DNA具有显著的切割活性,为后续拓宽CRISPR/Cas9系统的靶向范围提供重要参考。
关键词
CRISPR/Cas9
无PAM限制
突变体
基因编辑
Keywords
CRISPR/Cas9
No PAM restrictions
Variants
Gene editing
分类号
S813.3 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CRISPR/AsCpf1双切刻系统构建初探
辛京京
李和刚
秦怀远
张宁
赵金山
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
2
指向核心素养培养的小学数学项目式学习——以“一亿有多大”为例
辛京京
马由然
郝连杰
《中小学数字化教学》
2023
7
下载PDF
职称材料
3
无PAM限制的CRISPR/Cas9系统构建及效率验证
秦怀远
李和刚
张宁
辛京京
赵金山
《中国畜牧杂志》
CAS
北大核心
2021
0
下载PDF
职称材料
已选择
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