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m6A甲基化基因风险评估模型在卵巢癌预后的临床意义
被引量:
2
1
作者
古嘉基
连泳欣
丘福满
《广州医药》
2021年第3期1-8,17,共9页
目的探究m6A甲基化基因与卵巢癌生存预后的关系,为卵巢癌的靶向治疗、预后评估提供科学依据。方法从TCGA及GTEx数据库中下载卵巢癌组织与正常组织mRNA表达数据进行组间差异分析,通过LASSO回归筛选与卵巢癌生存相关基因,进一步使用逐步Co...
目的探究m6A甲基化基因与卵巢癌生存预后的关系,为卵巢癌的靶向治疗、预后评估提供科学依据。方法从TCGA及GTEx数据库中下载卵巢癌组织与正常组织mRNA表达数据进行组间差异分析,通过LASSO回归筛选与卵巢癌生存相关基因,进一步使用逐步Cox回归分析构建风险评分预测模型,根据风险评分中位数将患者分为高风险组和低风险组并使用ROC曲线下面积评价模型的预测能力。相关性分析构建与m6A基因的共表达调控网络,GO功能富集和KEGG通路分析初步探讨潜在的生物作用机制。结果在癌组织与正常组织中发现20个m6A甲基化基因差异表达,逐步Cox回归分析筛选出3个基因(HNRNPA2B1,ZC3H13,WTAP)用于构建风险评分模型,高风险组患者的生存期较低风险组患者明显缩短(P=0.0019),死亡风险显著增加(HR=2.643,P<0.01),风险评分模型结合患者年龄、临床分级和分期后,1、3、5年的AUC为0.74、0.64、0.64。生物信息学分析结果提示m6A相关基因参与RNA的剪接、定位、转运、代谢调控、蛋白水解、细胞周期、核糖体合成等生物学过程。结论成功构建卵巢癌m6A甲基化基因预后风险评估模型且该模型具备一定的预测效能。
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关键词
m6A
卵巢癌
风险预测模型
预后
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职称材料
题名
m6A甲基化基因风险评估模型在卵巢癌预后的临床意义
被引量:
2
1
作者
古嘉基
连泳欣
丘福满
机构
广州医科大学公共卫生学院
出处
《广州医药》
2021年第3期1-8,17,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(81872127)。
文摘
目的探究m6A甲基化基因与卵巢癌生存预后的关系,为卵巢癌的靶向治疗、预后评估提供科学依据。方法从TCGA及GTEx数据库中下载卵巢癌组织与正常组织mRNA表达数据进行组间差异分析,通过LASSO回归筛选与卵巢癌生存相关基因,进一步使用逐步Cox回归分析构建风险评分预测模型,根据风险评分中位数将患者分为高风险组和低风险组并使用ROC曲线下面积评价模型的预测能力。相关性分析构建与m6A基因的共表达调控网络,GO功能富集和KEGG通路分析初步探讨潜在的生物作用机制。结果在癌组织与正常组织中发现20个m6A甲基化基因差异表达,逐步Cox回归分析筛选出3个基因(HNRNPA2B1,ZC3H13,WTAP)用于构建风险评分模型,高风险组患者的生存期较低风险组患者明显缩短(P=0.0019),死亡风险显著增加(HR=2.643,P<0.01),风险评分模型结合患者年龄、临床分级和分期后,1、3、5年的AUC为0.74、0.64、0.64。生物信息学分析结果提示m6A相关基因参与RNA的剪接、定位、转运、代谢调控、蛋白水解、细胞周期、核糖体合成等生物学过程。结论成功构建卵巢癌m6A甲基化基因预后风险评估模型且该模型具备一定的预测效能。
关键词
m6A
卵巢癌
风险预测模型
预后
Keywords
m6A
Ovarian cancer
Risk score prediction model
Prognosis
分类号
R737.31 [医药卫生—肿瘤]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
m6A甲基化基因风险评估模型在卵巢癌预后的临床意义
古嘉基
连泳欣
丘福满
《广州医药》
2021
2
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