目的绝经后骨质疏松症(PMOP)是绝经后妇女的常见疾病,但目前尚无有效的治疗方法。本研究旨在识别绝经后骨质疏松症形成过程中基因表达的重要变化,并提供相应的临床参考。方法从GEO下载的数据集GSE56116、京都基因和基因组百科全书(Kyoto...目的绝经后骨质疏松症(PMOP)是绝经后妇女的常见疾病,但目前尚无有效的治疗方法。本研究旨在识别绝经后骨质疏松症形成过程中基因表达的重要变化,并提供相应的临床参考。方法从GEO下载的数据集GSE56116、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes KEGG)扩增途径、基因本体学(GO)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选其差异表达基因(DEG),并进一步分析得到了六个关键基因,分别是FOS、SYK、HCK、SELL、CCR1、NLRP3,然后我们分析了免疫细胞浸润。结果发现在骨关节炎和正常对照之间差异很大,与正常组织相比,PMOP组织含有较低比例的活性CD4T记忆细胞(P<0.05),最后从GSE7429数据集验证了关键基因NLRP3的表达水平。结论有助于我们进一步了解PMOP形成的分子机制,并为疾病的治疗提供新的思路。展开更多
[目的]探讨长链非编码RNA 02126(lncRNA02126)对尤文氏肉瘤患者预后的影响及其潜在的作用机制。[方法]从国际癌症基因组联合体(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库中获取了56例尤文氏肉瘤患者的基因表达数据。Kaplan-M...[目的]探讨长链非编码RNA 02126(lncRNA02126)对尤文氏肉瘤患者预后的影响及其潜在的作用机制。[方法]从国际癌症基因组联合体(International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库中获取了56例尤文氏肉瘤患者的基因表达数据。Kaplan-Meier生存分析和单多因素分析探究lnc02126与尤文氏肉瘤患者预后之间的关系,RT-qPCR检测lnc02126在尤文肉瘤细胞中的表达水平。通过GO和KEGG分析了解lnc02126在尤文氏肉瘤的生物学进展中可能参与的信号通路,通过CMap数据库(Connectivity Map)预测对尤文氏肉瘤具有潜在治疗作用的药物。[结果]lnc02126高表达组的尤文氏肉瘤患者预后明显较差(P=0.025)。lnc02126可作为一个独立的预后风险因素(P<0.001)。RT-qPCR实验结果表明lnc02126在尤文氏肉瘤细胞中显著高表达(P=0.0043)。GO和KEGG分析发现细胞外的结构组织构建、细胞黏附、血管生成等相关信号通路是lnc02126引起尤文氏肉瘤恶性进程的分子机制。CMap分析显示石蒜碱、伊洛前列素、毒胡萝卜素对尤文氏肉瘤具有潜在治疗作用。[结论]lnc02126是尤文氏肉瘤的独立预后分子标志物,有望成为尤文氏肉瘤的治疗靶点。展开更多
[目的]本研究旨在揭示富含亮氨酸重复序列的蛋白质59(leucine-rich repeat-containing protein 59,LRRC59)在尤文肉瘤中的表达以及对患者预后的影响。[方法]基于从国际癌症基因组联合体(International Cancer Genome Consortium,IC⁃GC)...[目的]本研究旨在揭示富含亮氨酸重复序列的蛋白质59(leucine-rich repeat-containing protein 59,LRRC59)在尤文肉瘤中的表达以及对患者预后的影响。[方法]基于从国际癌症基因组联合体(International Cancer Genome Consortium,IC⁃GC)数据库获取的56例尤文肉瘤样本的基因表达数据和临床信息,采用Kaplan-Meier曲线和单多因素Cox回归分析探索LR⁃RC59表达与患者预后之间的关系。通过基因本体(gene ontology,GO)分析进一步评估LRRC59的生物学功能。Connectivity Map(CMap)分析筛选可能逆转LRRC59生物学效应的药物。实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(real-time quantitative poly⁃merase chain reaction,RT-qPCR)检测尤文肉瘤细胞中LRRC59 mRNA的表达水平。[结果]LRRC59高表达组患者生存时间更短(P=0.010)。LRRC59高表达作为独立风险因素预示着尤文肉瘤患者的不良预后(P<0.05)。GO分析显示LRRC59可能参与调控了肿瘤细胞黏着斑和细胞外基质的形成过程。CMap分析发现芹菜素、喹诺他汀等药物对尤文肉瘤具有潜在治疗效应。RT-qPCR进一步验证了LRRC59在尤文肉瘤细胞中的表达量高于正常细胞(P<0.001)。[结论]LRRC59是尤文肉瘤的独立预后生物标志物,有望为尤文肉瘤提供一个新型治疗靶点。展开更多
文摘目的绝经后骨质疏松症(PMOP)是绝经后妇女的常见疾病,但目前尚无有效的治疗方法。本研究旨在识别绝经后骨质疏松症形成过程中基因表达的重要变化,并提供相应的临床参考。方法从GEO下载的数据集GSE56116、京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes KEGG)扩增途径、基因本体学(GO)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选其差异表达基因(DEG),并进一步分析得到了六个关键基因,分别是FOS、SYK、HCK、SELL、CCR1、NLRP3,然后我们分析了免疫细胞浸润。结果发现在骨关节炎和正常对照之间差异很大,与正常组织相比,PMOP组织含有较低比例的活性CD4T记忆细胞(P<0.05),最后从GSE7429数据集验证了关键基因NLRP3的表达水平。结论有助于我们进一步了解PMOP形成的分子机制,并为疾病的治疗提供新的思路。
