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生物含磷大分子与铀酰相互作用模拟计算研究
1
作者
聂小琴
董发勤
+4 位作者
刘明学
李小安
黄文波
王成林
逯小静
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期2198-2211,共14页
【目的】针对UO_(2)^(2+)主要在生物细胞表面生成微纳米片状磷酸氢铀酰矿化体这一前期研究基础。【方法】本文采用模拟计算的方法,探究了磷脂(生物共有)、脂多糖(革兰氏阴性菌特有)、磷壁酸(革兰氏阳性菌特有)、植酸(植物特有)4种生物...
【目的】针对UO_(2)^(2+)主要在生物细胞表面生成微纳米片状磷酸氢铀酰矿化体这一前期研究基础。【方法】本文采用模拟计算的方法,探究了磷脂(生物共有)、脂多糖(革兰氏阴性菌特有)、磷壁酸(革兰氏阳性菌特有)、植酸(植物特有)4种生物壁膜及胞外含磷大分子(biological macromolecules with phosphorous,BCP)与UO_(2)^(2+)之间的相互作用力、作用能和间距等。【结果】蒙特卡罗分析结果表明:在弱酸性(UO_(2)^(2+))、中性至弱碱性(UO_(2)^(2+)与CO32–共存)两种体系下,BCP对UO_(2)^(2+)的吸附均容易发生,吸附能分布在–109 kcal/mol至–114 kcal/mol之间。分子动力学结果显示,UO_(2)^(2+)与BCP接触时,U原子主要与BCP的含P基团作用。在UO_(2)^(2+)体系下,U-P距离较短的是脂多糖和植酸(6.662A和6.539A);而UO_(2)^(2+)与CO32–体系中,U-P距离较短的是磷壁酸和磷脂(5.225A和12.472A),这与BCP结构及其对UO_(2)^(2+)的作用力有关。两种体系下,脂多糖对UO_(2)^(2+)作用占主导的是静电力;磷壁酸和植酸对UO_(2)^(2+)作用起主导的是范德华力;磷脂与UO_(2)^(2+)作用时,范德华力与静电力相当。【结论】BCP与UO_(2)^(2+)作用过程中,主要是磷酸基团对UO_(2)^(2+)存在较强的亲和力和作用力,其在铀-磷的生物矿化过程中扮演成核位点的重要角色。
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关键词
铀酰
生物含磷大分子
相互作用
模拟计算
原文传递
题名
生物含磷大分子与铀酰相互作用模拟计算研究
1
作者
聂小琴
董发勤
刘明学
李小安
黄文波
王成林
逯小静
机构
西南科技大学核废物与环境安全国防重点学科实验室
西南科技大学固体废物处理与资源化教育部重点实验室
西南科技大学生命科学与工程学院
绵阳市中心医院国家卫健委核技术医学转化重点实验室
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期2198-2211,共14页
基金
国家自然科学基金(41877323)
国家卫健委核技术医学转化重点实验室开放课题(2021HYX004)。
文摘
【目的】针对UO_(2)^(2+)主要在生物细胞表面生成微纳米片状磷酸氢铀酰矿化体这一前期研究基础。【方法】本文采用模拟计算的方法,探究了磷脂(生物共有)、脂多糖(革兰氏阴性菌特有)、磷壁酸(革兰氏阳性菌特有)、植酸(植物特有)4种生物壁膜及胞外含磷大分子(biological macromolecules with phosphorous,BCP)与UO_(2)^(2+)之间的相互作用力、作用能和间距等。【结果】蒙特卡罗分析结果表明:在弱酸性(UO_(2)^(2+))、中性至弱碱性(UO_(2)^(2+)与CO32–共存)两种体系下,BCP对UO_(2)^(2+)的吸附均容易发生,吸附能分布在–109 kcal/mol至–114 kcal/mol之间。分子动力学结果显示,UO_(2)^(2+)与BCP接触时,U原子主要与BCP的含P基团作用。在UO_(2)^(2+)体系下,U-P距离较短的是脂多糖和植酸(6.662A和6.539A);而UO_(2)^(2+)与CO32–体系中,U-P距离较短的是磷壁酸和磷脂(5.225A和12.472A),这与BCP结构及其对UO_(2)^(2+)的作用力有关。两种体系下,脂多糖对UO_(2)^(2+)作用占主导的是静电力;磷壁酸和植酸对UO_(2)^(2+)作用起主导的是范德华力;磷脂与UO_(2)^(2+)作用时,范德华力与静电力相当。【结论】BCP与UO_(2)^(2+)作用过程中,主要是磷酸基团对UO_(2)^(2+)存在较强的亲和力和作用力,其在铀-磷的生物矿化过程中扮演成核位点的重要角色。
关键词
铀酰
生物含磷大分子
相互作用
模拟计算
Keywords
uranyl
biological macromolecule containing phosphorus
interaction
simulated calculation
分类号
Q71 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生物含磷大分子与铀酰相互作用模拟计算研究
聂小琴
董发勤
刘明学
李小安
黄文波
王成林
逯小静
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
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