目的基于分子对接技术探究天花粉活性成分与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)靶点的相互作用。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,T...目的基于分子对接技术探究天花粉活性成分与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)靶点的相互作用。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库获得天花粉活性成分及作用靶点,在GeneCards和DisGeNET数据库中获得T2DM靶点。将天花粉活性成分靶点与T2DM靶点取交集,获取药物-疾病共有靶点,导入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。构建共有靶点的蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),分析得出关键靶点。最后,利用Sybyl软件进行分子对接,验证活性成分与关键靶点相互作用。结果天花粉活性成分为仙人掌甾醇(schottenol)和菠菜甾醇(spinasterol),获得药物-疾病共有靶点21个。PPI、GO和KEGG富集分析表明,天花粉可能作用于过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPARs),进而通过PPAR信号通路和胰岛素抵抗信号通路调节糖脂代谢。分子对接表明,天花粉活性成分仙人掌甾醇和菠菜甾醇均与关键靶点过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)有较强的结合作用。结论天花粉活性成分仙人掌甾醇和菠菜甾醇,可能通过作用于T2DM靶点PPARγ改善胰岛素抵抗。展开更多
文摘目的基于分子对接技术探究天花粉活性成分与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)靶点的相互作用。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)和SwissTargetPrediction数据库获得天花粉活性成分及作用靶点,在GeneCards和DisGeNET数据库中获得T2DM靶点。将天花粉活性成分靶点与T2DM靶点取交集,获取药物-疾病共有靶点,导入DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。构建共有靶点的蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),分析得出关键靶点。最后,利用Sybyl软件进行分子对接,验证活性成分与关键靶点相互作用。结果天花粉活性成分为仙人掌甾醇(schottenol)和菠菜甾醇(spinasterol),获得药物-疾病共有靶点21个。PPI、GO和KEGG富集分析表明,天花粉可能作用于过氧化物酶体增殖物激活受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPARs),进而通过PPAR信号通路和胰岛素抵抗信号通路调节糖脂代谢。分子对接表明,天花粉活性成分仙人掌甾醇和菠菜甾醇均与关键靶点过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)有较强的结合作用。结论天花粉活性成分仙人掌甾醇和菠菜甾醇,可能通过作用于T2DM靶点PPARγ改善胰岛素抵抗。