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乙肝疫苗免疫应答反应与错义突变关联性
1
作者
赵强
潘焯仪
+3 位作者
吴欣新
张妙莲
邓丽漫
钟良英
《中国误诊学杂志》
CAS
2021年第5期385-389,共5页
目的探讨乙肝疫苗免疫应答与个体错义突变间的关联性。方法本研究基于极端性状筛选遗传变异策略,对既往研究的49例"HBV强免疫应答"个体的全外显子组测序数据进行重新分析,从中筛选出与5个候选研究错义突变。本研究新纳入乙肝...
目的探讨乙肝疫苗免疫应答与个体错义突变间的关联性。方法本研究基于极端性状筛选遗传变异策略,对既往研究的49例"HBV强免疫应答"个体的全外显子组测序数据进行重新分析,从中筛选出与5个候选研究错义突变。本研究新纳入乙肝疫苗无(低)应答469例,乙肝疫苗高应答个体226例,对这5个候选突变行关联性分析,最后对关联阳性突变进行相关生物功能分析。结果两组TMEM176Ac.364A>G次要等位基因差异有统计学意义(P<0.05),变异c.364A>G可造成TMEM176A蛋白122氨基酸的理化性质发生较大改变,UniProtKB/Swiss-Prot数据库注释122位氨基酸正好位于TMEM176蛋白的跨膜区,而多物种蛋白质序列保守性分析也显示122位氨基酸处于个相当保守位置。结论TMEM176Ac.364A>G变异与个体接种乙肝疫苗后免疫应答反应存在关联性。通过相关生物信息学分析预测该变异可能对TMEM176A蛋白功能存在影响。
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关键词
乙型肝炎病毒
疫苗
错义突变
关联研究
生物信息分析
原文传递
题名
乙肝疫苗免疫应答反应与错义突变关联性
1
作者
赵强
潘焯仪
吴欣新
张妙莲
邓丽漫
钟良英
机构
江门市中心医院
出处
《中国误诊学杂志》
CAS
2021年第5期385-389,共5页
基金
广东省自然科学基金资助项目(2018A030310050)
江门市科技计划项目(2018020100680004241和2018020300640004528)
文摘
目的探讨乙肝疫苗免疫应答与个体错义突变间的关联性。方法本研究基于极端性状筛选遗传变异策略,对既往研究的49例"HBV强免疫应答"个体的全外显子组测序数据进行重新分析,从中筛选出与5个候选研究错义突变。本研究新纳入乙肝疫苗无(低)应答469例,乙肝疫苗高应答个体226例,对这5个候选突变行关联性分析,最后对关联阳性突变进行相关生物功能分析。结果两组TMEM176Ac.364A>G次要等位基因差异有统计学意义(P<0.05),变异c.364A>G可造成TMEM176A蛋白122氨基酸的理化性质发生较大改变,UniProtKB/Swiss-Prot数据库注释122位氨基酸正好位于TMEM176蛋白的跨膜区,而多物种蛋白质序列保守性分析也显示122位氨基酸处于个相当保守位置。结论TMEM176Ac.364A>G变异与个体接种乙肝疫苗后免疫应答反应存在关联性。通过相关生物信息学分析预测该变异可能对TMEM176A蛋白功能存在影响。
关键词
乙型肝炎病毒
疫苗
错义突变
关联研究
生物信息分析
Keywords
Hepatitis B virus
vaccine
missense mutations
aassociated study
bioinfromatic analysis
分类号
R392 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
乙肝疫苗免疫应答反应与错义突变关联性
赵强
潘焯仪
吴欣新
张妙莲
邓丽漫
钟良英
《中国误诊学杂志》
CAS
2021
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