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欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒GD2022株的分离鉴定及遗传进化分析
1
作者
邓可辉
王修武
+3 位作者
郭智轩
韩淑杰
孙守湖
贺东生
《动物医学进展》
北大核心
2024年第3期34-41,共8页
为了解广东省欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV-1)流行情况,将RT-PCR检测PRRSV-1阳性的病料(肺脏和淋巴结)接种猪肺泡巨噬细胞(PAMs)进行病原分离鉴定,以分离毒株核酸作为模板,对分离的PRRSV-1进行全基因克隆和测序,并与国内外PRRSV-...
为了解广东省欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV-1)流行情况,将RT-PCR检测PRRSV-1阳性的病料(肺脏和淋巴结)接种猪肺泡巨噬细胞(PAMs)进行病原分离鉴定,以分离毒株核酸作为模板,对分离的PRRSV-1进行全基因克隆和测序,并与国内外PRRSV-1和PRRSV-2参考毒株序列进行同源性及遗传进化分析。结果显示,成功分离1株PRRSV-1,命名为GD2022株,其接种PAMs可引起典型的细胞病变,从出现病变的F5细胞中提取核酸,用PCR分段扩增出PRRSV-1 GD2022株10个基因组片段,分别连接到pCE2 TA/Blunt-Zero载体进行测序,拼接后获得PRRSV-1 GD2022株全基因组长15058个核苷酸(不包含polyA尾)。同源性分析显示,该分离株全基因组序列与PRRSV-1参考毒株(LV株)和PRRSV-2参考毒株(VR2333株)核苷酸序列同源性分别为87%和59.7%。遗传进化树分析显示,全基因序列和ORF5基因与国内外PRRSV-1毒株为同一进化分支,且与疫苗毒分支较远,推断分离株为1株PRRSV-1,属于基因亚型1。氨基酸序列比对分析显示,ORF3和ORF4重叠区域缺失3个核苷酸,导致GP3蛋白和GP4蛋白分别在第245和第65氨基酸位点缺失了1个氨基酸,且与LV株比对,GD2022毒株GP5的氨基酸序列在中和抗原表位第33氨基酸位点(D→A)出现点突变,在高变区第56氨基酸位点(D→A)和第63氨基酸位点(G→D)出现两处突变。重组分析显示,GD2022毒株未发生重组事件。成功分离鉴定1株PRRSV-1毒株,为国内PRRSV-1生物学特性研究提供了材料,也为了解广东省内PRRSV-1流行情况及变异特点提供参考依据。
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关键词
欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离鉴定
全基因组测序
遗传进化分析
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职称材料
猪丁型冠状病毒感染麻黄鸡的研究
被引量:
2
2
作者
王修武
陈志飞
+6 位作者
邓可辉
俞婷
刘文华
郭智轩
魏文康
陈瑞爱
贺东生
《动物医学进展》
北大核心
2023年第8期17-21,共5页
为研究猪丁型冠状病毒(PDCoV)跨物种传播宿主谱及其致病性,将PDCoV(HN-17毒株)接种至6日龄SPF麻黄鸡并采集感染鸡的组织器官,通过临床症状、RT-PCR、病理组织切片分析等对其组织嗜性、组织病理学变化进行系统研究。结果表明,口服接种PD...
为研究猪丁型冠状病毒(PDCoV)跨物种传播宿主谱及其致病性,将PDCoV(HN-17毒株)接种至6日龄SPF麻黄鸡并采集感染鸡的组织器官,通过临床症状、RT-PCR、病理组织切片分析等对其组织嗜性、组织病理学变化进行系统研究。结果表明,口服接种PDCoV的麻黄鸡出现腹泻等临床症状,在感染鸡的肺脏、空肠、直肠、肾脏中均检测到PDCoV的RNA,感染鸡的肺脏、空肠产生以出血、炎性细胞浸润为主要特征的组织病理学变化,证明PDCoV可以感染麻黄鸡并致病。证实猪丁型冠状病毒可感染麻黄鸡,为PDCoV的跨物种传播及该病防控提供参考。
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关键词
猪丁型冠状病毒
致病性
麻黄鸡
跨物种传播
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职称材料
题名
欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒GD2022株的分离鉴定及遗传进化分析
1
作者
邓可辉
王修武
郭智轩
韩淑杰
孙守湖
贺东生
机构
岭南现代农业科学与技术广东省实验室肇庆分中心
华南农业大学兽医学院/广东省动物源性人兽共患病预防与控制重点实验室
出处
《动物医学进展》
北大核心
2024年第3期34-41,共8页
基金
广东省科技计划项目(P20211154-0302)。
文摘
为了解广东省欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV-1)流行情况,将RT-PCR检测PRRSV-1阳性的病料(肺脏和淋巴结)接种猪肺泡巨噬细胞(PAMs)进行病原分离鉴定,以分离毒株核酸作为模板,对分离的PRRSV-1进行全基因克隆和测序,并与国内外PRRSV-1和PRRSV-2参考毒株序列进行同源性及遗传进化分析。结果显示,成功分离1株PRRSV-1,命名为GD2022株,其接种PAMs可引起典型的细胞病变,从出现病变的F5细胞中提取核酸,用PCR分段扩增出PRRSV-1 GD2022株10个基因组片段,分别连接到pCE2 TA/Blunt-Zero载体进行测序,拼接后获得PRRSV-1 GD2022株全基因组长15058个核苷酸(不包含polyA尾)。同源性分析显示,该分离株全基因组序列与PRRSV-1参考毒株(LV株)和PRRSV-2参考毒株(VR2333株)核苷酸序列同源性分别为87%和59.7%。遗传进化树分析显示,全基因序列和ORF5基因与国内外PRRSV-1毒株为同一进化分支,且与疫苗毒分支较远,推断分离株为1株PRRSV-1,属于基因亚型1。氨基酸序列比对分析显示,ORF3和ORF4重叠区域缺失3个核苷酸,导致GP3蛋白和GP4蛋白分别在第245和第65氨基酸位点缺失了1个氨基酸,且与LV株比对,GD2022毒株GP5的氨基酸序列在中和抗原表位第33氨基酸位点(D→A)出现点突变,在高变区第56氨基酸位点(D→A)和第63氨基酸位点(G→D)出现两处突变。重组分析显示,GD2022毒株未发生重组事件。成功分离鉴定1株PRRSV-1毒株,为国内PRRSV-1生物学特性研究提供了材料,也为了解广东省内PRRSV-1流行情况及变异特点提供参考依据。
关键词
欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒
分离鉴定
全基因组测序
遗传进化分析
Keywords
PRRSV-1
isolation and identification
complete genome sequencing
genetic evolution analysis
分类号
S852.659.6 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
猪丁型冠状病毒感染麻黄鸡的研究
被引量:
2
2
作者
王修武
陈志飞
邓可辉
俞婷
刘文华
郭智轩
魏文康
陈瑞爱
贺东生
机构
华南农业大学兽医学院广东省动物源性人畜共患病预防与控制重点实验室
广东省农业科学院农业生物基因研究中心
岭南现代农业科学与技术广东省实验室茂名分中心
岭南现代农业科学与技术广东省实验室肇庆分中心
出处
《动物医学进展》
北大核心
2023年第8期17-21,共5页
基金
广东省农业科学院农业优势产业学科团队建设项目(202131TD)
广东省自然科学基金面上项目(2021A1515011072)
广东省科技计划项目(P20211154-0302)。
文摘
为研究猪丁型冠状病毒(PDCoV)跨物种传播宿主谱及其致病性,将PDCoV(HN-17毒株)接种至6日龄SPF麻黄鸡并采集感染鸡的组织器官,通过临床症状、RT-PCR、病理组织切片分析等对其组织嗜性、组织病理学变化进行系统研究。结果表明,口服接种PDCoV的麻黄鸡出现腹泻等临床症状,在感染鸡的肺脏、空肠、直肠、肾脏中均检测到PDCoV的RNA,感染鸡的肺脏、空肠产生以出血、炎性细胞浸润为主要特征的组织病理学变化,证明PDCoV可以感染麻黄鸡并致病。证实猪丁型冠状病毒可感染麻黄鸡,为PDCoV的跨物种传播及该病防控提供参考。
关键词
猪丁型冠状病毒
致病性
麻黄鸡
跨物种传播
Keywords
Porcine deltacoronavirus
pathogenicity
Mahuang chicken
cross-species transmission
分类号
S852.65 [农业科学—基础兽医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒GD2022株的分离鉴定及遗传进化分析
邓可辉
王修武
郭智轩
韩淑杰
孙守湖
贺东生
《动物医学进展》
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
猪丁型冠状病毒感染麻黄鸡的研究
王修武
陈志飞
邓可辉
俞婷
刘文华
郭智轩
魏文康
陈瑞爱
贺东生
《动物医学进展》
北大核心
2023
2
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职称材料
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