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广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查
1
作者
黎聪荣
白茹
+4 位作者
邓洁莉
车荣飞
梁丹
赵卫
柯昌文
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第6期685-691,697,共8页
目的了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况。方法于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析。结...
目的了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况。方法于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析。结果成功获得7株H3N2亚型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位点序列均为PEKQTR↓GL,与典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分离株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。HA蛋白受体结合位点、神经氨酸酶耐药位点、M基因上的金刚烷胺类药物耐药位点、PB2基因上与哺乳动物适应性相关位点等均未发生突变。系统进化分析显示,7株分离株的8个基因片段均处在欧亚禽源分支中,但相互间存在差距。结论 7株分离株中存在5种组合的重配H3N2亚型禽流感病毒,其中1株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。因此应加强活禽市场及环境监测,防止产生能在人群中流行的重配H3N2病毒。
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关键词
H3N2
禽流感病毒
基因重配
原文传递
题名
广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查
1
作者
黎聪荣
白茹
邓洁莉
车荣飞
梁丹
赵卫
柯昌文
机构
南方医科大学公共卫生学院
广东省疾病预防控制中心
汕头大学医学院
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020年第6期685-691,697,共8页
基金
国家科技重大专项(No.2018ZX10714002003006)
广东省科技计划项目(No.2019B030316013)。
文摘
目的了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况。方法于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析。结果成功获得7株H3N2亚型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位点序列均为PEKQTR↓GL,与典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分离株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。HA蛋白受体结合位点、神经氨酸酶耐药位点、M基因上的金刚烷胺类药物耐药位点、PB2基因上与哺乳动物适应性相关位点等均未发生突变。系统进化分析显示,7株分离株的8个基因片段均处在欧亚禽源分支中,但相互间存在差距。结论 7株分离株中存在5种组合的重配H3N2亚型禽流感病毒,其中1株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。因此应加强活禽市场及环境监测,防止产生能在人群中流行的重配H3N2病毒。
关键词
H3N2
禽流感病毒
基因重配
Keywords
H3N2
avian influenza virus
reassortment
分类号
R37 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查
黎聪荣
白茹
邓洁莉
车荣飞
梁丹
赵卫
柯昌文
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2020
0
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