利用WGCNA鉴定玉米非生物胁迫相关基因共表达网络

加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)是一种经典的系统生物学分析方法,可用来鉴定协同表达的基因模块,探索模块与目标性状的生物学相关性,并挖掘模块网络中的核心基因。本文收集了低温胁迫、高温胁迫、干旱胁迫和盐胁迫处理下玉米(Zea mays L.)根、茎、叶等组织的58份转录组数据,利用WGCNA方法鉴定玉米非生物胁迫的基因共表达网络模块。过滤转录组数据中12,552个低表达基因后,利用余下27,204个高表达基因构建共表达网络,分析得到25个模块。根据玉米中已报道非生物胁迫相关基因与差异表达基因在模块中的分布,筛选出与低温胁迫、高温胁迫、干旱胁迫和盐胁迫最相关的mediumpurple4、ivory、coral2、darkseagreen4模块和响应多种胁迫的green模块。随后对这5个模块的基因进行GO富集分析,发现在这些模块内与非生物胁迫相关基因的在非生物胁迫调控相关功能显著富集,如胁迫响应、过氧化物酶活性等。对这5个模块作相关性分析,预测出Zm00001eb072870、Zm00001eb320970、Zm00001eb037640、Zm00001eb423300和Zm00001eb265310等10个非生物胁迫相关的核心基因。本研究为玉米非生物胁迫相关基因的挖掘和非生物胁迫调控网络研究等提供了新思路。

产愈创木酚的假单胞菌在白酒酿造中的应用初探

为提高白酒中愈创木酚类物质浓度,将一株产愈创木酚的YF-58产氮假单胞菌用于制备细菌麸曲。以愈创木酚浓度为指标,固定培养温度为30℃,通过单因素试验确定细菌麸曲的最佳水分含量、接种量和培养时间,并将所得细菌麸曲按照不同添加比例进行实验室条件下酱香型白酒酿造试验。结果表明,细菌麸曲的最佳培养条件为水分含量40%、接种量7%、培养温度30℃、培养时间3 d,酿酒用曲最佳添加比例是高温大曲:细菌麸曲为3:2,此条件下所酿造白酒的出酒率、愈创木酚浓度和4-乙基愈创木酚浓度较对照组分别提高了39%、223%、130%。该研究可为后续提高白酒中愈创木酚浓度提供一定的理论依据。