目的 基于湖北黄足蜈蚣(HY)、湖北红足蜈蚣(HR)和浙江舟山红足蜈蚣(ZR)的转录组和蛋白组数据,分析其足色差异的形成机制。方法 利用llumina高通量测序技术和质谱检测平台对以上3个批次各取3条蜈蚣进行转录组和蛋白组测序,从头组装获得Un...目的 基于湖北黄足蜈蚣(HY)、湖北红足蜈蚣(HR)和浙江舟山红足蜈蚣(ZR)的转录组和蛋白组数据,分析其足色差异的形成机制。方法 利用llumina高通量测序技术和质谱检测平台对以上3个批次各取3条蜈蚣进行转录组和蛋白组测序,从头组装获得Unigene,筛选出差异表达基因和差异表达蛋白,并对其进行GO和KEGG富集分析。结果 (1)9个蜈蚣样品共获得71351个Unigenes和1688个蛋白质;(2)在HY vs HR组差异表达基因数量为6个,在HR vs ZR组、HY vs ZR组差异表达基因数量为1579和2567个,湖北地区的黄足和红足蜈蚣基因表达水平相近、湖北地区蜈蚣与浙江舟山地区蜈蚣基因表达水平差异较大;(3)在KEGG富集分析中,找到影响动物体色的黑素原生成相关的差异表达基因和差异表达蛋白。结论 根据湖北和舟山地区差异表达基因数量的差异和差异表达蛋白的通路富集结果,推测产地环境对蜈蚣生长发育影响较大,蜈蚣足色差异主要与黑色素合成途径相关。展开更多
文摘目的 基于湖北黄足蜈蚣(HY)、湖北红足蜈蚣(HR)和浙江舟山红足蜈蚣(ZR)的转录组和蛋白组数据,分析其足色差异的形成机制。方法 利用llumina高通量测序技术和质谱检测平台对以上3个批次各取3条蜈蚣进行转录组和蛋白组测序,从头组装获得Unigene,筛选出差异表达基因和差异表达蛋白,并对其进行GO和KEGG富集分析。结果 (1)9个蜈蚣样品共获得71351个Unigenes和1688个蛋白质;(2)在HY vs HR组差异表达基因数量为6个,在HR vs ZR组、HY vs ZR组差异表达基因数量为1579和2567个,湖北地区的黄足和红足蜈蚣基因表达水平相近、湖北地区蜈蚣与浙江舟山地区蜈蚣基因表达水平差异较大;(3)在KEGG富集分析中,找到影响动物体色的黑素原生成相关的差异表达基因和差异表达蛋白。结论 根据湖北和舟山地区差异表达基因数量的差异和差异表达蛋白的通路富集结果,推测产地环境对蜈蚣生长发育影响较大,蜈蚣足色差异主要与黑色素合成途径相关。