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基于细胞色素B(Cytb)的市售海蛇药材基原物种的分子鉴定
被引量:
3
1
作者
张云
李炎连
+5 位作者
郑炎媚
陈广玉
邓麒蓉
李宏宇
余秋鲜
黄勇
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1102-1116,共15页
物种基原鉴定一直是中药鉴定中的热点研究问题之一。海蛇是我国名贵的中药材之一,为了解市售海蛇药材的基原情况,该研究基于细胞色素B(Cytb)片段测序对市售的46批海蛇药材的基原物种进行分子鉴定。经比对和人工校正,序列长度为582 bp,A+...
物种基原鉴定一直是中药鉴定中的热点研究问题之一。海蛇是我国名贵的中药材之一,为了解市售海蛇药材的基原情况,该研究基于细胞色素B(Cytb)片段测序对市售的46批海蛇药材的基原物种进行分子鉴定。经比对和人工校正,序列长度为582 bp,A+T的量(58.9%)高于G+C的量(41.1%),变异位点有197个,简约信息位点有179个。经BLAST比对的结果表明样品中出现序列比对一致性为100%的有44批,一致性为96%的有2批。此外,从美国国家生物技术信息中心数据库上共下载了408条Cytb有效序列(共68种),分别基于邻接法和贝叶斯法,与该研究样品共构建了454条海蛇序列的系统发育树,结果表明2种方法构建的系统发育树结构相似,能正确鉴别出海蛇药材样品有42批,而4批海蛇药材因节点支持率比较低,无法对它们鉴别。综合它们的结果,市售海蛇药材的基原物种至少来源于2属5种,分别是埃杜西剑尾海蛇Aipysurus eydouxii、青灰海蛇Hydrophis caerulescens、印度洋平颏海蛇H.curtus、淡灰海蛇H.ornatus、螺旋海蛇H.spiralis。可见市售海蛇药材的基原物种比较复杂,可为海蛇类药材鉴别提供了参考。
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关键词
分子鉴定
海蛇
细胞色素B
邻接树
系统发育树
原文传递
中成药蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定
被引量:
1
2
作者
景晓彤
邓麒蓉
+2 位作者
李宏宇
王乙淋
黄勇
《时珍国医国药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1657-1660,共4页
目的建立蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定方法。方法首先构建了蛤蚧定喘丸中原料动物药材的16S rRNA序列的数据库;然后收集3个不同厂家(每个厂家3个不同批号)和自制的蛤蚧定喘丸共计12份,使用改良CTAB法对蛤蚧定喘丸进行总DNA提取,...
目的建立蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定方法。方法首先构建了蛤蚧定喘丸中原料动物药材的16S rRNA序列的数据库;然后收集3个不同厂家(每个厂家3个不同批号)和自制的蛤蚧定喘丸共计12份,使用改良CTAB法对蛤蚧定喘丸进行总DNA提取,扩增16S rRNA,对PCR产物进行克隆测序,然后对测序结果进行BlastN分析。结果共挑取131个阳性克隆进行测序,序列去除载体序列和人工校正后,12份蛤蚧定喘丸样品均能鉴定出蛤蚧和鳖甲成分,其中鉴定结果为蛤蚧的有87个样品,占总样品的66.4%;鉴定结果为中华鳖的有44个样品,占总样品的33.6%。结论本研究的分子鉴别方法可鉴定蛤蚧定喘丸中原料动物药材,为该中成药的质量控制提供参考。
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关键词
蛤蚧定喘丸
蛤蚧
16S
rRNA
分子鉴定
中成药
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职称材料
题名
基于细胞色素B(Cytb)的市售海蛇药材基原物种的分子鉴定
被引量:
3
1
作者
张云
李炎连
郑炎媚
陈广玉
邓麒蓉
李宏宇
余秋鲜
黄勇
机构
广西中医药大学
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第5期1102-1116,共15页
基金
广西自然科学基金项目(2017GXNSFDA198001,2019GXNSFAA245084)
广西一流学科(培育)建设项目(中药学)(2019XK092,桂教科研[2018]12号)
广西中医药大学项目(2018BS020)。
文摘
物种基原鉴定一直是中药鉴定中的热点研究问题之一。海蛇是我国名贵的中药材之一,为了解市售海蛇药材的基原情况,该研究基于细胞色素B(Cytb)片段测序对市售的46批海蛇药材的基原物种进行分子鉴定。经比对和人工校正,序列长度为582 bp,A+T的量(58.9%)高于G+C的量(41.1%),变异位点有197个,简约信息位点有179个。经BLAST比对的结果表明样品中出现序列比对一致性为100%的有44批,一致性为96%的有2批。此外,从美国国家生物技术信息中心数据库上共下载了408条Cytb有效序列(共68种),分别基于邻接法和贝叶斯法,与该研究样品共构建了454条海蛇序列的系统发育树,结果表明2种方法构建的系统发育树结构相似,能正确鉴别出海蛇药材样品有42批,而4批海蛇药材因节点支持率比较低,无法对它们鉴别。综合它们的结果,市售海蛇药材的基原物种至少来源于2属5种,分别是埃杜西剑尾海蛇Aipysurus eydouxii、青灰海蛇Hydrophis caerulescens、印度洋平颏海蛇H.curtus、淡灰海蛇H.ornatus、螺旋海蛇H.spiralis。可见市售海蛇药材的基原物种比较复杂,可为海蛇类药材鉴别提供了参考。
关键词
分子鉴定
海蛇
细胞色素B
邻接树
系统发育树
Keywords
molecular identification
sea snake
Cytb
neighbor-joining trees
phylogenetic tree
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
中成药蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定
被引量:
1
2
作者
景晓彤
邓麒蓉
李宏宇
王乙淋
黄勇
机构
广西中医药大学
广州华立科技职业学院
出处
《时珍国医国药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第7期1657-1660,共4页
基金
广西自然科学基金(2020GXNSFAA238017,2023GXNSFDA026065,2017GXNSFDA198001)
广西中医药大学科研项目(2018BS020)
广西壮瑶药重点实验室项目(GXZYKF2022-20)。
文摘
目的建立蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定方法。方法首先构建了蛤蚧定喘丸中原料动物药材的16S rRNA序列的数据库;然后收集3个不同厂家(每个厂家3个不同批号)和自制的蛤蚧定喘丸共计12份,使用改良CTAB法对蛤蚧定喘丸进行总DNA提取,扩增16S rRNA,对PCR产物进行克隆测序,然后对测序结果进行BlastN分析。结果共挑取131个阳性克隆进行测序,序列去除载体序列和人工校正后,12份蛤蚧定喘丸样品均能鉴定出蛤蚧和鳖甲成分,其中鉴定结果为蛤蚧的有87个样品,占总样品的66.4%;鉴定结果为中华鳖的有44个样品,占总样品的33.6%。结论本研究的分子鉴别方法可鉴定蛤蚧定喘丸中原料动物药材,为该中成药的质量控制提供参考。
关键词
蛤蚧定喘丸
蛤蚧
16S
rRNA
分子鉴定
中成药
Keywords
Gejie Dingchuan Wan
Gekko gecko
16S rRNA
Molecular identification
Chinese patent medicine
分类号
R282.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于细胞色素B(Cytb)的市售海蛇药材基原物种的分子鉴定
张云
李炎连
郑炎媚
陈广玉
邓麒蓉
李宏宇
余秋鲜
黄勇
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2021
3
原文传递
2
中成药蛤蚧定喘丸中原料动物药材的分子鉴定
景晓彤
邓麒蓉
李宏宇
王乙淋
黄勇
《时珍国医国药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
1
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职称材料
已选择
0
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