黑水虻抗菌肽的克隆及其生物信息学分析

为了开发新型昆虫抗菌肽资源,以黑水虻幼虫为研究对象,采用RT-PCR技术从黑水虻幼虫总RNA中扩增到一个新型抗菌肽基因DLP-5,并利用在线生物软件和工具分析了抗菌肽DLP-5的生物信息学特征。结果表明,DLP-5由40个氨基酸残基组成,分子量为4226.83 u,等电点为7.87,具有两亲性特征,其中N端为疏水性,C端为亲水性,具有3个磷酸化位点,无糖基化位点、信号肽序列和跨膜区。DLP-5的三级结构包含1个N端的loop区、1个α螺旋和1对反向平行β折叠,构成了防御素类抗菌肽典型的“环-螺旋-折叠”结构,说明DLP-5是一个新型的防御素类抗菌肽,可通过与微生物膜相互作用发挥其抗菌活性。