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杉木GRF和GIF基因家族鉴定、表达与互作分析
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作者 邱姗 王文新 +2 位作者 江梅 黄华宏 林二培 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期1224-1233,共10页
生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个Cl... 生长调节因子(GRF)和GRF相互作用因子(GIF)在植物的生长发育和逆境胁迫响应中发挥重要作用。为研究GRF和GIF基因在杉木生长发育和逆境胁迫响应中的功能,本研究基于杉木全长转录组数据,利用生物信息学手段共鉴定获得5个ClGRFs基因和2个ClGIFs基因。分析结果显示,ClGRFs氨基酸残基数目范围为386(ClGRF4)~723 aa(ClGRF3),等电点为7.07(ClGRF4)~9.26(ClGRF5);2个ClGIFs蛋白氨基酸数目分别为242和258 aa,等电点均在6左右,蛋白质分子质量分别为25.64和27.96 kDa。保守结构域和基序分析发现ClGRFs蛋白均含QLQ和WRC结构域,ClGIFs蛋白均含SSXT结构域,且高度保守。进一步分析结果显示,ClGRFs分别属于进化枝Ⅲ和进化枝Ⅵ,且均受miR396调控。表达分析结果表明,ClGRFs基因的表达具有一定的组织特异性,而ClGIFs在不同组织呈组成性表达,且ClGRFs和ClGIFs基因均能响应赤霉素(GA3)和水杨酸(SA)的处理。酵母双杂交结果表明5个ClGRFs蛋白和2个ClGIFs蛋白均存在互作关系。本研究结果为进一步研究杉木GRF和GIF基因的功能提供了理论基础。 展开更多
关键词 杉木 GRF基因 GIF基因 表达分析 互作
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基于污染物总量控制的流域预警体系构建研究 被引量:1
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作者 迟晓德 杨帆 邱姗 《环境科学与管理》 CAS 2012年第9期83-85,194,共4页
文章通过对中国目前水环境质量现状分析,指出流域环境预警体系建立的必要性,并选择总量控制指标作为预警体系的评价指标。利用层次分析法建立基于污染物总量控制的流域预警体系,确定预警因子的权重和评分标准,设立临界状态,不良状态预... 文章通过对中国目前水环境质量现状分析,指出流域环境预警体系建立的必要性,并选择总量控制指标作为预警体系的评价指标。利用层次分析法建立基于污染物总量控制的流域预警体系,确定预警因子的权重和评分标准,设立临界状态,不良状态预警、缓慢恶化预警和迅速恶化预警4个级别,为建立流域环境质量预警体系提供借鉴。 展开更多
关键词 总量控制 环境预警 流域 层析分析法
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光皮桦AP2/ERF基因家族鉴定与表达分析 被引量:2
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作者 黄奕孜 钱旺 +3 位作者 邱姗 王文新 黄华宏 林二培 《浙江农林大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第6期1183-1193,共11页
【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元... 【目的】深入研究AP2/ERF基因家族在光皮桦Betula luminifera生长发育及环境胁迫响应中的生物学功能。【方法】利用光皮桦基因组数据,通过生物信息学方法开展AP2/ERF基因家族鉴定、基因特征、系统进化、基因结构、保守基序、顺式作用元件、蛋白互作和表达分析。【结果】在光皮桦基因组中共鉴定到77个AP2/ERF基因,其编码的蛋白理化性质存在差异,大多数蛋白(60个)的理论等电点小于7.0。系统进化分析显示:这77个AP2/ERF转录因子属于5个亚家族,其中ERF亚家族最大,包含34个成员。光皮桦AP2/ERF各亚家族间的基因结构存在较大差异,其中AP2亚家族成员均具有6~9个内含子,而DREB亚家族基因则没有内含子;但AP2/ERF各亚家族内的不同成员具有相似的保守基序类型和分布。同时,AP2/ERF基因启动子上都存在大量与激素、调节、胁迫响应及生长发育相关的顺式作用元件。此外,互作网络分析预测不同的光皮桦AP2/ERF亚家族蛋白间存在广泛的互作关系。进一步的表达分析显示:绝大多数光皮桦AP2/ERF基因(71个)的表达存在较强组织特异性,且在高温胁迫下,多数ERF或DREB基因的表达发生显著变化,表明ERF和DREB基因在高温胁迫应答中可能发挥着重要作用。【结论】通过生物信息学分析获得光皮桦77个AP2/ERF基因,分属于5个亚家族。不同亚家族基因具有相似的基因结构、保守基序等特征。基因启动子区含激素、胁迫响应等相关的作用元件。基因表达具有较强的组织特异性,且多数ERF或DREB基因对高温胁迫有明显响应。图6表1参39。 展开更多
关键词 光皮桦 AP2/ERF家族 表达模式 高温胁迫
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“智能+教育”相适应的卓越教师培养体系探索 被引量:1
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作者 张迪 邱姗 +1 位作者 李兵 罗金红 《实验室科学》 2022年第4期212-215,219,共5页
实验教学是验证理论知识、培养实验技能、提高学生生物学素养的重要途径。但生物学教学始终存在重理论轻实验、学生实验积极性差等问题。为落实国家卓越教师培养计划、建设一流本科课程,通过深度剖析师范类生物实验教学现存问题,提出与... 实验教学是验证理论知识、培养实验技能、提高学生生物学素养的重要途径。但生物学教学始终存在重理论轻实验、学生实验积极性差等问题。为落实国家卓越教师培养计划、建设一流本科课程,通过深度剖析师范类生物实验教学现存问题,提出与智能教育相适应、以师范生为中心、以培养卓越生物教师为目标的实验课程动态培养体系。该体系有助于推进实验教学改革,提高师范生实践动手及实验教学能力,引领师范生科学价值观的建立,为基础教育培养并输送更多符合时代需要的卓越生物教师。 展开更多
关键词 实验教学 动态培养体系 卓越教师培养 信息化
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纳米银对小鼠卵巢颗粒细胞GRM02毒性作用研究 被引量:1
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作者 木魁 李登坤 +4 位作者 李艳玲 邱姗 葛文武 田杨杨 丁之恩 《山东化工》 CAS 2021年第13期30-32,共3页
纳米银(nAg)的使用增加了人类健康潜在风险,这迫切需要对nAg做出安全评估。本研究方法:选取20,50,80 nm粒径nAg,2,4,8,16,32,64,128和256μg/mL不同浓度,对小鼠卵巢颗粒细胞(GRM02)处理24 h,MTT法检测计算细胞存活率,并筛选出不引起细... 纳米银(nAg)的使用增加了人类健康潜在风险,这迫切需要对nAg做出安全评估。本研究方法:选取20,50,80 nm粒径nAg,2,4,8,16,32,64,128和256μg/mL不同浓度,对小鼠卵巢颗粒细胞(GRM02)处理24 h,MTT法检测计算细胞存活率,并筛选出不引起细胞大量凋亡或死亡的20 nm nAg,在20μg/mL浓度下处理GRM02细胞24 h,通过对培养细胞膜关键损伤指标乳酸脱氢酶(LDH)活力,抗氧化酶系统活性以及关键凋亡因子检测分析。结果表明:处理组相较实验组细胞膜损伤关键指标LDH含量升高约3.2倍(p<0.01),CAT降低约86%(p<0.01),caspase-3含量提高了32.72%。结论:nAg会诱导GRM02细胞产生氧化应激,降低抗氧化酶活性,破坏细胞膜结构,激活了凋亡因子Caspase-3相关途径,介导细胞凋亡或死亡。 展开更多
关键词 纳米银 小鼠卵巢颗粒细胞GRM02 毒性作用
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新型冠状病毒肺炎患者流行病学及临床特征分析 被引量:3
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作者 张鑫 李娜 +3 位作者 同重湘 冉燕 魏黛珏 邱姗 《微生物学免疫学进展》 2020年第3期42-46,共5页
目的分析新型冠状病毒肺炎(novel coronavirus pneumonia, NCP)兰州市病例与伊朗输入性病例的流行病学及临床特征,为诊疗提供依据。方法收集兰州市某医院核酸检测阳性NCP兰州市患者28例,伊朗输入性患者14例,分析和总结其临床症状、实验... 目的分析新型冠状病毒肺炎(novel coronavirus pneumonia, NCP)兰州市病例与伊朗输入性病例的流行病学及临床特征,为诊疗提供依据。方法收集兰州市某医院核酸检测阳性NCP兰州市患者28例,伊朗输入性患者14例,分析和总结其临床症状、实验室指标以及胸部CT表现。结果兰州市病例与伊朗输入性病例的男女比例分别为0.87∶1和13∶1,差异有统计学意义(χ~2=8.531、P=0.03);兰州市病例与伊朗输入性病例年龄中位数分别为47岁和23岁,兰州市病例年龄跨度较大,以中老年为主;兰州市患者13例白细胞总数(WBC)减少,5例淋巴细胞数(Lym)减少,14例血沉(ESR)、10例D-二聚体(D-Dimer)、9例肝酶、6例肌酸肌酶(CK)、15例C-反应蛋白(CRP)、15例乳酸脱氢酶(LDH)、7例肌红蛋白(Myo)均升高,24例有CT表现;伊朗输入性患者4例WBC减少,3例CRP升高,8例有CT表现;兰州市NCP患者与伊朗输入性患者相比, WBC明显减少且ESR、肝酶、CK、CRP、LDH、Myo均明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 NCP患者多有流行病学史,大部分以发热、干咳为首发临床症状,结合实验室检测结果、胸部CT特征性表现,有助于早期诊断NCP患者,以及有效阻止疫情的蔓延。 展开更多
关键词 新型冠状病毒肺炎 输入性病例 流行病学 临床特征 分析
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