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基于网络药理学和分子对接技术探讨黄精-枸杞药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制
被引量:
3
1
作者
邱玲艳
王旭
《中医药信息》
2021年第12期36-44,共9页
目的:通过网络药理学和分子对接的方法,探讨黄精-枸杞子药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制。方法:首先,在TCMSP平台筛选出黄精-枸杞的活性成分,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb数据库筛选出糖尿病合并认知功能障碍的相关靶点基因...
目的:通过网络药理学和分子对接的方法,探讨黄精-枸杞子药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制。方法:首先,在TCMSP平台筛选出黄精-枸杞的活性成分,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb数据库筛选出糖尿病合并认知功能障碍的相关靶点基因,将两者通过R语言、Cytoscapes和STRING进行汇总分析,筛选出中药靶基因与疾病相关基因并构建中药调控网络和PPI网络图,通过metascape进行GO和KEGG富集分析。最后,以核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接。结果:黄精-枸杞药对共有57种有效活性成分,其与糖尿病合并认知功能障碍存在167个共同靶点,beta-sitosterol活性成分同时存在于中药黄精和枸杞之中。药对与疾病的较交集基因的PPI网络包涵618条边和167个节点,其核心基因有JUN、MAPK1、TP53等。通过GO富集分析(P<0.05),从生物学过程、细胞成分、分子功能生物成分三个层次分析了基因的形式功能。基于KEGG富集分析分析(P<0.05)获得P-value前20条进行分析,结果显示黄精-枸杞药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的通路主要包括AGE-RAGE信号通路、B细胞信号通路、人巨细胞病毒感染,分子对接结果显示黄精-枸杞药对的核心基因与成分有较好的结合能。结论:黄精-枸杞药对主要以黄芩素、槲皮素、β-谷甾醇为主要活性成分,通过对伤害的反应、氧化应激、药物反应等生物学过程,多通路、多靶点的治疗糖尿病合并认知功能障碍,为临床研究提供了更多可靠的理论依据。
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关键词
黄精-枸杞
糖尿病
认知功能障碍
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职称材料
糖脂清方对高糖诱导HT22细胞损伤的保护作用
被引量:
2
2
作者
石崯力
王旭
+3 位作者
赵云
邱玲艳
徐奚如
孙斯凡
《中医药信息》
2022年第3期7-15,共9页
目的:探讨“糖脂清”对高糖诱导的HT22细胞损伤的保护作用机制。方法:将Wistar大鼠随机分成正常组和“糖脂清”、二甲双胍含药血清组,依据成人临床剂量进行灌胃,灌胃后取每组大鼠腹主动脉血并进行离心、灭活、过滤,由此制备不同剂量的...
目的:探讨“糖脂清”对高糖诱导的HT22细胞损伤的保护作用机制。方法:将Wistar大鼠随机分成正常组和“糖脂清”、二甲双胍含药血清组,依据成人临床剂量进行灌胃,灌胃后取每组大鼠腹主动脉血并进行离心、灭活、过滤,由此制备不同剂量的“糖脂清”和二甲双胍大鼠含药血清。通过CCK-8法筛选干预HT22细胞最适造模高糖浓度和最佳干预时间,将生长稳定的HT22细胞分为空白组、模型组、二甲双胍含药血清组、低剂量含药血清组、中剂量含药血清组和高剂量含药血清组,造模组采用最适高糖浓度进行诱导,再对高糖环境下的HT22细胞给予“糖脂清”高、中、低剂量和二甲双胍含药血清进行干预,检测各组HT22细胞氧化应激指标超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)和乳酸脱氢酶(LDH)含量;免疫荧光法和Hoechst 33342染色法检测神经元凋亡和Lamp2的表达;WesternBlot法检测各组HT22细胞凋亡、自噬相关蛋白Bax、Bcl-2、Caspase-3、SIRT1和JNK表达水平。结果:“糖脂清”能够调节和改善小鼠海马HT22细胞在长期高糖环境下的生长和形态变化,升高SOD含量(P<0.01),降低MDA和LDH水平(P<0.01),对HT22细胞遭受的氧化损伤起到一定程度的保护作用;与模型组相比,“糖脂清”的干预可下调炎症凋亡、自噬相关因子Bax、Caspase-3、SIRT1、JNK蛋白的表达,上调Bcl-2、Lamp2蛋白表达水平(P<0.05)。结论:“糖脂清”可显著缓解海马区域神经元凋亡和氧化应激异常状态,并在一定程度上抑制细胞自噬,调控自噬体与溶酶体的结合过程,这些结果为“糖脂清”成为改善2型糖尿病合并认知功能的有效药物提供了全新的思路和方向。
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关键词
中医药
HT22细胞
糖尿病认知功能障碍
细胞凋亡
细胞自噬
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职称材料
萆菟汤治疗慢性前列腺炎的网络药理学研究
3
作者
李风雷
韩紫阳
+1 位作者
邱玲艳
朱杰
《医学信息》
2023年第8期1-6,12,共7页
目的基于网络药理学与分子对接技术分析萆菟汤治疗慢性前列腺炎的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台与BATMAN-TCM数据库查询并筛选萆菟汤的主要化学成分,通过DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库获取慢性前列腺炎相关疾病靶点;利...
目的基于网络药理学与分子对接技术分析萆菟汤治疗慢性前列腺炎的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台与BATMAN-TCM数据库查询并筛选萆菟汤的主要化学成分,通过DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库获取慢性前列腺炎相关疾病靶点;利用网站Venny2.1.0构建韦恩图筛选药对、疾病的共同靶点,通过软件Cytoscape构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图;利用STRING平台构建PPI网络图,运用网站Metascape进行GO和KEGG分析,利用PyMoL及AutoDock Vina软件进行分子对接。结果共筛选出药对300种成分和285个预测靶点,慢性前列腺炎靶点9109个;韦恩图得到药对、疾病的的共同靶点260个,这些靶点主要涉及对无机物的反应、氮化合物的细胞反应等,与MAPK、NF-κB等信号通路相关;分子对接结果显示,核心基因与成份结合性较好。结论MAPK、NF-κB信号通路可能是萆菟汤治疗慢性前列腺炎的主要作用通路。
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关键词
网络药理学
萆菟汤
慢性前列腺炎
分子对接
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职称材料
题名
基于网络药理学和分子对接技术探讨黄精-枸杞药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制
被引量:
3
1
作者
邱玲艳
王旭
机构
南京中医药大学第一临床医学院
南京中医药大学附属医院
出处
《中医药信息》
2021年第12期36-44,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81973796)。
文摘
目的:通过网络药理学和分子对接的方法,探讨黄精-枸杞子药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制。方法:首先,在TCMSP平台筛选出黄精-枸杞的活性成分,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb数据库筛选出糖尿病合并认知功能障碍的相关靶点基因,将两者通过R语言、Cytoscapes和STRING进行汇总分析,筛选出中药靶基因与疾病相关基因并构建中药调控网络和PPI网络图,通过metascape进行GO和KEGG富集分析。最后,以核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接。结果:黄精-枸杞药对共有57种有效活性成分,其与糖尿病合并认知功能障碍存在167个共同靶点,beta-sitosterol活性成分同时存在于中药黄精和枸杞之中。药对与疾病的较交集基因的PPI网络包涵618条边和167个节点,其核心基因有JUN、MAPK1、TP53等。通过GO富集分析(P<0.05),从生物学过程、细胞成分、分子功能生物成分三个层次分析了基因的形式功能。基于KEGG富集分析分析(P<0.05)获得P-value前20条进行分析,结果显示黄精-枸杞药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的通路主要包括AGE-RAGE信号通路、B细胞信号通路、人巨细胞病毒感染,分子对接结果显示黄精-枸杞药对的核心基因与成分有较好的结合能。结论:黄精-枸杞药对主要以黄芩素、槲皮素、β-谷甾醇为主要活性成分,通过对伤害的反应、氧化应激、药物反应等生物学过程,多通路、多靶点的治疗糖尿病合并认知功能障碍,为临床研究提供了更多可靠的理论依据。
关键词
黄精-枸杞
糖尿病
认知功能障碍
Keywords
Rhizoma Polygonatum-Lycium Barbarum
Diabetes mellitus
Cognitive impairment
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
下载PDF
职称材料
题名
糖脂清方对高糖诱导HT22细胞损伤的保护作用
被引量:
2
2
作者
石崯力
王旭
赵云
邱玲艳
徐奚如
孙斯凡
机构
南京中医药大学第一临床医学院
出处
《中医药信息》
2022年第3期7-15,共9页
基金
国家自然科学基金项目(81973796)。
文摘
目的:探讨“糖脂清”对高糖诱导的HT22细胞损伤的保护作用机制。方法:将Wistar大鼠随机分成正常组和“糖脂清”、二甲双胍含药血清组,依据成人临床剂量进行灌胃,灌胃后取每组大鼠腹主动脉血并进行离心、灭活、过滤,由此制备不同剂量的“糖脂清”和二甲双胍大鼠含药血清。通过CCK-8法筛选干预HT22细胞最适造模高糖浓度和最佳干预时间,将生长稳定的HT22细胞分为空白组、模型组、二甲双胍含药血清组、低剂量含药血清组、中剂量含药血清组和高剂量含药血清组,造模组采用最适高糖浓度进行诱导,再对高糖环境下的HT22细胞给予“糖脂清”高、中、低剂量和二甲双胍含药血清进行干预,检测各组HT22细胞氧化应激指标超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)和乳酸脱氢酶(LDH)含量;免疫荧光法和Hoechst 33342染色法检测神经元凋亡和Lamp2的表达;WesternBlot法检测各组HT22细胞凋亡、自噬相关蛋白Bax、Bcl-2、Caspase-3、SIRT1和JNK表达水平。结果:“糖脂清”能够调节和改善小鼠海马HT22细胞在长期高糖环境下的生长和形态变化,升高SOD含量(P<0.01),降低MDA和LDH水平(P<0.01),对HT22细胞遭受的氧化损伤起到一定程度的保护作用;与模型组相比,“糖脂清”的干预可下调炎症凋亡、自噬相关因子Bax、Caspase-3、SIRT1、JNK蛋白的表达,上调Bcl-2、Lamp2蛋白表达水平(P<0.05)。结论:“糖脂清”可显著缓解海马区域神经元凋亡和氧化应激异常状态,并在一定程度上抑制细胞自噬,调控自噬体与溶酶体的结合过程,这些结果为“糖脂清”成为改善2型糖尿病合并认知功能的有效药物提供了全新的思路和方向。
关键词
中医药
HT22细胞
糖尿病认知功能障碍
细胞凋亡
细胞自噬
Keywords
TCM
HT22 cells
Diabetic cognitive dysfunction
Apoptosis
Autophagy
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
萆菟汤治疗慢性前列腺炎的网络药理学研究
3
作者
李风雷
韩紫阳
邱玲艳
朱杰
机构
南京中医药大学翰林学院
泰州市海陵区里华卫生院
南京中医药大学中医学院
南京中医药大学第一临床医学院
江苏卫生健康职业学院
出处
《医学信息》
2023年第8期1-6,12,共7页
基金
泰州市科技支撑计划(社会发展)项目(编号:TS202023)。
文摘
目的基于网络药理学与分子对接技术分析萆菟汤治疗慢性前列腺炎的作用机制。方法利用中药系统药理学分析平台与BATMAN-TCM数据库查询并筛选萆菟汤的主要化学成分,通过DisGeNET、GeneCards、OMIM数据库获取慢性前列腺炎相关疾病靶点;利用网站Venny2.1.0构建韦恩图筛选药对、疾病的共同靶点,通过软件Cytoscape构建药物-活性成分-靶点-疾病网络图;利用STRING平台构建PPI网络图,运用网站Metascape进行GO和KEGG分析,利用PyMoL及AutoDock Vina软件进行分子对接。结果共筛选出药对300种成分和285个预测靶点,慢性前列腺炎靶点9109个;韦恩图得到药对、疾病的的共同靶点260个,这些靶点主要涉及对无机物的反应、氮化合物的细胞反应等,与MAPK、NF-κB等信号通路相关;分子对接结果显示,核心基因与成份结合性较好。结论MAPK、NF-κB信号通路可能是萆菟汤治疗慢性前列腺炎的主要作用通路。
关键词
网络药理学
萆菟汤
慢性前列腺炎
分子对接
Keywords
Network pharmacology
Bitu decoction
Chronic prostatitis
Molecular docking
分类号
R277.5 [医药卫生—中医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学和分子对接技术探讨黄精-枸杞药对治疗糖尿病合并认知功能障碍的作用机制
邱玲艳
王旭
《中医药信息》
2021
3
下载PDF
职称材料
2
糖脂清方对高糖诱导HT22细胞损伤的保护作用
石崯力
王旭
赵云
邱玲艳
徐奚如
孙斯凡
《中医药信息》
2022
2
下载PDF
职称材料
3
萆菟汤治疗慢性前列腺炎的网络药理学研究
李风雷
韩紫阳
邱玲艳
朱杰
《医学信息》
2023
0
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职称材料
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