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HCV NS_3区C_(33)c抗原基因cDNA的克隆及序列分析
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作者 邱纪慧 陆志檬 +2 位作者 张东华 董硕 陈竺 《上海第二医科大学学报》 CSCD 1996年第2期148-152,共5页
自上海市及江苏省慢性丙型肝炎患者血清中分离丙型肝炎病毒(HCV)RNA,采用自行设计的引物,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),获得长为694bp的C33c抗原基因cDNA,将其克隆于表达载体并作序列分析。结果表... 自上海市及江苏省慢性丙型肝炎患者血清中分离丙型肝炎病毒(HCV)RNA,采用自行设计的引物,经逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR),获得长为694bp的C33c抗原基因cDNA,将其克隆于表达载体并作序列分析。结果表明,上海株HCV-S1及江苏株HCV-S2该区域核苷酸水平有很高的同源性(>99%),上海及江苏株HCV与美国原型HCV-1、日本株HCV-J及河北株HCV-HB在该区域核苷酸水平的差异分别为18.64%、5.55%及8.01%~8.17%,氨基酸水平的差异在2.31%~6.02%之间。上海株同一份血清三个独立克隆间核苷酸水平有0.6%~0.9%的差异。本实验为进一步表达C33c蛋白作好了准备。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 CDNA克隆 序列分析
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中国地区HCV株包膜区cDNA序列变异性分析
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作者 蔡倩 邱纪慧 +1 位作者 张欣欣 陆志檬 《肝脏》 1999年第4期200-204,共5页
目的 研究国内不同地区HCV包膜基因区变异。方法 对国内不同地区慢性丙型肝炎患者的13株 HCV采用RT-PCR技术扩增HCV包膜基因区(E1、 E2/NS1)片段,对其中的1005bp的cDNA进行测序,并与 国内外... 目的 研究国内不同地区HCV包膜基因区变异。方法 对国内不同地区慢性丙型肝炎患者的13株 HCV采用RT-PCR技术扩增HCV包膜基因区(E1、 E2/NS1)片段,对其中的1005bp的cDNA进行测序,并与 国内外株进行变异性分析。结果 国内HCV株比较,同型(Ⅱ)间该区核苷酸和氨基酸的同源性分别介于76.42%~ 97.11%和75.22%~93.15%,不同型(Ⅲ)间分别为62.29%~63.38%和51,29%~60.00%;国内与国际同型株比较,同型 (Ⅱ)间分别为73.73%~87.76%和75.82%~88.095%,不同型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ)间分别为61.49%~81.49%和49.35%~78.21%;国 内外18株HCV的HVR1区同源性仅为36.11%~75、31%和20.80%~62.96%,发现两个新的较高变异区(第250~257 位和第443~465位氨基酸)。结论 HCV包膜区序列分析同型间同源性较高,异型间同源性较低;南北地区有差 异,国内外差异更大;最大的变异在HVR1,并发现两个新的较高变异区。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 包膜区 序列分析 CDNA
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丙型肝炎病毒C_(33C)抗原基因的融合表达及初步应用 被引量:1
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作者 邱纪慧 李光地 +2 位作者 杨莉 张东华 陆志檬 《中华肝脏病杂志》 CAS CSCD 1999年第2期121-121,共1页
关键词 HCV C33c抗原 基因融合 诊断试剂
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上海地区Ⅱ、Ⅲ型丙型肝炎病毒包膜区cDNA序列分析
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作者 邱纪慧 张欣欣 +2 位作者 陆志檬 金根娣 汪垣 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2000年第2期98-100,共3页
目的 分析上海地区丙型肝炎病毒 (hepatitisCvirus ,HCV)Ⅱ、Ⅲ型包膜区cDNA序列变异。方法 采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增HCV包膜区E1、E2 /NS1片断 (10 0 5bp) ,在373DNA全自动测序仪上进行了序列分析。结果 HCV E1、E2 /... 目的 分析上海地区丙型肝炎病毒 (hepatitisCvirus ,HCV)Ⅱ、Ⅲ型包膜区cDNA序列变异。方法 采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)扩增HCV包膜区E1、E2 /NS1片断 (10 0 5bp) ,在373DNA全自动测序仪上进行了序列分析。结果 HCV E1、E2 /NS1区核苷酸和氨基酸同源性比较显示 :上海株Ⅱ型、Ⅲ型间同源性分别为 6 2 .48%和 5 9.10 % ;上海株与国内外同型株间分别为85 .97%~ 87.36 %和 83.38%~ 86 .5 7% ;上海株与国内外不同型株间分别为 6 1.49%~ 70 .95 %和5 9 .10 %~ 78.2 1%。此外 ,共发现 5个变异较大的区域 ,其中两个是国际公认的高变区 (HVR1及HVR2 ) ,另外 3个为首次报道 (第 2 5 1~ 2 5 8、2 97~ 30 1、46 1~ 46 7位氨基酸 )。结论 HCV E1、E2 /NS1序列变异大 。 展开更多
关键词 包膜区 丙型肝炎 序列分析 HCV CDNA
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上海市、江苏省丙型肝炎病毒NS_3区C_(33c)抗原基因cDNA的克隆及序列
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作者 邱纪慧 陆志檬 +1 位作者 张东华 陈竺 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1995年第3期133-135,共3页
本文作者旨在运用分子克隆技术阐明上海市及江苏省丙型肝炎患者血清中两株丙型肝炎病毒(HCV)C33c抗原基因的序列及变异特征,为临床检测提供理论依据,并为进一步表达C33c抗原作好准备。结果表明:上海株及江苏株C33c... 本文作者旨在运用分子克隆技术阐明上海市及江苏省丙型肝炎患者血清中两株丙型肝炎病毒(HCV)C33c抗原基因的序列及变异特征,为临床检测提供理论依据,并为进一步表达C33c抗原作好准备。结果表明:上海株及江苏株C33c抗原基因同源性大于99%,推测属同一基因型。此两株与其它分离株相比较,氨基酸水平的同源性(93.08%~97.69%)明显高于核苷酸水平的同源性(81.36%~94.45%),说明C33c抗原特别适于作诊断抗原。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 分子克隆 抗原 基因 互补DNA
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丙型肝炎病毒基因组变异的研究进展
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作者 邱纪慧 《国际病毒学杂志》 1994年第3期67-69,共3页
丙型肝炎病毒(HCV)基因组具有很大的变异性。本文就HCV基因组变异的特征、分型及研究变异的意义作一综述。
关键词 肝炎病毒 基因组变异 核苷酸 基因分型 不同基因型 分离株 干扰素治疗 丙型 序列分析 变异性
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基因型和核苷酸序列分析研究丙型肝炎病毒母婴传播 被引量:21
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作者 陆建春 陆志檬 +3 位作者 邱纪慧 白敬羽 徐玉玲 王耆煌 《中华传染病杂志》 CAS CSCD 北大核心 1996年第4期207-210,共4页
为研究丙型肝炎病毒(HCV)的母婴传播,应用EIA方法检测1816例孕妇血清抗-HCV抗体。结果抗体阳性者16例(0.88%)。进一步用逆转录-套式-聚合酶链反应(RT-Nested-PCR)检测病毒核酸(HCVRN... 为研究丙型肝炎病毒(HCV)的母婴传播,应用EIA方法检测1816例孕妇血清抗-HCV抗体。结果抗体阳性者16例(0.88%)。进一步用逆转录-套式-聚合酶链反应(RT-Nested-PCR)检测病毒核酸(HCVRNA),14例孕妇为阳性。对其中13例孕妇所生13例婴儿随访至出生后6个月,3例婴儿检出HCVRNA,其中2例为短暂HCV感染者,1例为慢性HCV感染者伴ALT异常,母婴传播率为23.0%(3/13)。结果提示:经母婴对HCV基因分型和HCVC/E1区核苷酸序列分析支持婴儿感染的HCV来自于母亲。 展开更多
关键词 丙型肝炎病毒 母婴传播 基因型 核苷酸
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聚合酶链反应和杂交试验检测上海地区庚型肝炎病毒感染的初步报告 被引量:13
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作者 金根娣 陆志檬 +4 位作者 张东华 邱纪慧 张欣欣 陆林 陈竺 《中华传染病杂志》 CSCD 北大核心 1997年第3期142-144,共3页
为探讨上海地区庚型肝炎病毒感染的现状,采用逆转录套式聚合酶链反应(RTNestedPCR)检测庚型肝炎病毒(HGV/GBVC)核酸(HGVRNA)。结果在各类患者和助血员中HGVRNA的检出率分别是:血液... 为探讨上海地区庚型肝炎病毒感染的现状,采用逆转录套式聚合酶链反应(RTNestedPCR)检测庚型肝炎病毒(HGV/GBVC)核酸(HGVRNA)。结果在各类患者和助血员中HGVRNA的检出率分别是:血液透析和肾移植为157%(8/51)、丙型肝炎为33%(1/30)、乙型肝炎为0(0/19)、散发性非A~E型肝炎为0(0/28)、义务助血员为75%(5/67)。提示HGV感染多为无症状或亚临床型,常与HCV重叠感染,并与输血密切相关。作者肯定了上海地区存在庚型肝炎,指出筛选助血员对控制输血后庚型肝炎至关重要。 展开更多
关键词 庚型肝炎病毒 聚合酶链反应 核酸杂交 输血
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急性早幼粒细胞白血病中 PLZF/RARα 对野生型 RARα 显性负作用的研究 被引量:2
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作者 董硕 朱军 +4 位作者 况少青 邱纪慧 王振义 陈赛娟 陈竺 《中华血液学杂志》 CAS CSCD 北大核心 1997年第1期8-12,共5页
目的:了解急性早幼粒细胞白血病(APL)的早幼粒细胞白血病锌指基因(PLZF)和17号染色体上的RARα基因与APL发生的关系。方法:应用PCR克隆方法,缺失PLZF/RARα的PLZF不同区域,构建了8个PLZF/... 目的:了解急性早幼粒细胞白血病(APL)的早幼粒细胞白血病锌指基因(PLZF)和17号染色体上的RARα基因与APL发生的关系。方法:应用PCR克隆方法,缺失PLZF/RARα的PLZF不同区域,构建了8个PLZF/RARα的突变体进行细胞转染。结果和结论:证实了PLZF/RARα对野生型RARα有明显的显性负作用,而POZ区域(即氨基酸1~120)对PLZF/RARα的显性负作用的形成是至关重要的,2个锌指结构可能通过与POZ区域的空间构型的相互作用而在显性负作用中起一定作用。 展开更多
关键词 急性白血病 融合基因 野生型
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