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酿酒酵母核小体定位理论模型的体外实验验证 被引量:2
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作者 王成爱 赵宏宇 +2 位作者 邢永强 邵灵利 蔡禄 《生命科学研究》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期21-27,共7页
核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好地预测了核小体占据率。利用该理论模型,以1 bp碱基为步长、147 bp碱基为窗口... 核小体定位对真核生物基因表达调控发挥着重要作用。前期基于核小体核心及连接区域的k-mer频次分布偏好性,构建了位置权重矩阵算法,并在酿酒酵母基因组内较好地预测了核小体占据率。利用该理论模型,以1 bp碱基为步长、147 bp碱基为窗口,用该算法计算了酵母1号、3号、14号染色体上核小体形成能力强、中、弱各3条长度为147 bp的DNA序列,将这些片段克隆到重组质粒中,大量扩增回收9条标记biotin分子的目的序列。同时分别表达纯化了组蛋白H2A、H2B、H3和H4,复性后装配形成组蛋白八聚体结构。利用盐透析方法将9条DNA序列在体外组装形成核小体结构,经biotin标记检测后计算了反应过程的吉布斯自由能,对比了9条目的序列形成核小体的亲和力大小。研究发现,9条序列中有5条序列与理论预测完全符合,4条序列与理论预测不完全一致。实验结果与该算法预测的核小体定位结果基本一致,表明该理论模型能够有效预测酿酒酵母基因组核小体占据水平。 展开更多
关键词 酿酒酵母 核小体定位 位置权重矩阵 盐透析法 体外实验
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写景之妙 在乎一心
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作者 张进 邵灵利 《语文教学之友》 2008年第11期44-45,共2页
在写作中,我们总少不了写景,它不仅能烘托人物、渲染氛围、表达我们的思想感情,有效地为文章的中心服务,还能增添文章的诗情画意,使之富有美好意境,从而收到更好的艺术表达效果。要写好景物,使景物描写达到理想的效果,关键是要... 在写作中,我们总少不了写景,它不仅能烘托人物、渲染氛围、表达我们的思想感情,有效地为文章的中心服务,还能增添文章的诗情画意,使之富有美好意境,从而收到更好的艺术表达效果。要写好景物,使景物描写达到理想的效果,关键是要用“心”去感受、去发现、去抒写。 展开更多
关键词 写景 景物描写 思想感情 诗情画意 表达效果 “心” 文章 写作
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流光溢彩 美不胜收——谈《菜园小记》的美
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作者 张进 邵灵利 《语文天地(初中版)》 2007年第12期5-6,共2页
《菜园小记》是著名散文家吴伯箫的一篇叙事散文。作者以抗日战争时期延安大生产运动为背景,描写了延安军民的生产场景和他们的精神面貌。
关键词 《菜园小记》 流光溢彩
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