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利用BC_3F_1群体定位和分析甘蓝型油菜A7-含油量QTL
被引量:
2
1
作者
邵玉锁
倪西源
+5 位作者
黄吉祥
任丽平
赵蔚
方小燕
曹明富
赵坚义
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期20-28,共9页
【目的】通过构建BC3F1群体对第7连锁群上一个影响油菜籽油分含量的主效QTL(A7-QTL)进行定位确认。【方法】在用SG-DH群体初定位基础上以欧洲品种Sollux为轮回亲本、目标区段含中国亲本Gaoyou等位基因片段的DH系为供体构建近等基因系。...
【目的】通过构建BC3F1群体对第7连锁群上一个影响油菜籽油分含量的主效QTL(A7-QTL)进行定位确认。【方法】在用SG-DH群体初定位基础上以欧洲品种Sollux为轮回亲本、目标区段含中国亲本Gaoyou等位基因片段的DH系为供体构建近等基因系。用1700个BC3F1单株基因型和其种子(BC3F2)表现型,采用WinQTLCartographer2.5和SPSS11.5软件对A7-QTL进行精细定位以及标记和性状的关联分析。【结果】含油量QTL的置信区间在标记ZAAS849s-R131之间,范围在21.7cM左右,其LOD峰值为9.71,距离两侧最近标记RPSaA3和ZAAS839分别为0.9和2.1cM,QTL的加性效应值是0.75;QTL区段内的单标记方差分析表明:目标区段内4个标记各3种基因型的含油量之间存在极显著差异,标记ZAAS839处的差异最显著(P=1.2×10-10);通过比较含油量和4个标记之间的对应关系,进一步推断QTL最可能位于标记RPSaA3和ZAAS839之间或临近。【结论】用BC3F1群体定位的QTL区间与DH群体分析结果相重叠,但置信区间明显缩小;定位结果进一步确认了A7连锁群上存在油分QTL的真实性,增加了在该区域存有参与控制油菜含油量基因的可靠性;QTL可能存在于标记RPSaA3和ZAAS839临近区域,两标记间距约3cM。
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关键词
甘蓝型油菜
含油量
QTL-近等基因系
QTL定位
下载PDF
职称材料
油菜N13和N18上含油量QTL作图区间相关候选基因克隆
2
作者
邵珏
汪义龙
+2 位作者
邵玉锁
曹明富
赵坚义
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期35-42,共8页
以前人报道的SG-图谱和DH群体为材料,利用拟南芥脂质基因库和芸薹属EST库信息资源,选择与拟南芥中诠释的重要油脂合成相关基因高度同源的甘蓝型油菜EST和其他具有基因信息的EST序列为标记来源,发展功能基因标记加密SG图谱;对定位在N13和...
以前人报道的SG-图谱和DH群体为材料,利用拟南芥脂质基因库和芸薹属EST库信息资源,选择与拟南芥中诠释的重要油脂合成相关基因高度同源的甘蓝型油菜EST和其他具有基因信息的EST序列为标记来源,发展功能基因标记加密SG图谱;对定位在N13和N18连锁群上含油量QTL区间的相关基因片段进行克隆、测序和生物信息学分析,以期获得可能与种子含油量QTL有关联的侯选基因。结果表明:在2条连锁群的3个含油量QTL区域内共连锁上6个功能基因,其中与拟南芥同源的3个基因在油脂合成途径中发挥重要作用;其双亲差异片段经克隆测序和比对分析,发现有2个在双亲间存在氨基酸水平差异;将获得的基因片段和拟南芥同源基因序列比对结果显示,二者间内含子部分核苷酸序列相似率平均为57.7%,外显子区域为86.7%,氨基酸水平上则达到89.2%。
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关键词
甘蓝型油菜
含油量
QTL
克隆
序列分析
下载PDF
职称材料
甘蓝型黄籽油菜育种研究进展
3
作者
邵珏
邵玉锁
曹明富
《杭州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008年第5期368-371,共4页
介绍了国内外甘蓝型黄籽油菜育种的理论及方法,概述近年来取得的成果,指明今后研究的重点和方向,并指出黄籽育种必须与生物技术相结合,才能适应育种科技发展的需要.
关键词
甘蓝型油菜
黄籽育种
进展
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职称材料
获取基因全长c DNA策略及应用
4
作者
邵珏
邵玉锁
曹明富
《健康研究》
CAS
2009年第2期140-142,共3页
全长cDNA是研究基因功能的关键,获得全长cDNA也是基因组研究的重要内容之一,本文概述了近年来国内外获取未知基因cDNA全长的理论及其应用。
关键词
全长CDNA
MRNA
PCR
进展
下载PDF
职称材料
题名
利用BC_3F_1群体定位和分析甘蓝型油菜A7-含油量QTL
被引量:
2
1
作者
邵玉锁
倪西源
黄吉祥
任丽平
赵蔚
方小燕
曹明富
赵坚义
机构
杭州师范大学生命与环境科学学院
浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所
河南省开封高级中学
扬州大学生物科学与技术学院
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期20-28,共9页
基金
国家重点基础研究发展规划("973"计划项目)(2006CB101600)
国家高技术研究发展计划("863"计划项目)(2006AA100106)
+1 种基金
浙江省科技计划项目(2007C22020)
国家自然科学基金面上项目(30871543)
文摘
【目的】通过构建BC3F1群体对第7连锁群上一个影响油菜籽油分含量的主效QTL(A7-QTL)进行定位确认。【方法】在用SG-DH群体初定位基础上以欧洲品种Sollux为轮回亲本、目标区段含中国亲本Gaoyou等位基因片段的DH系为供体构建近等基因系。用1700个BC3F1单株基因型和其种子(BC3F2)表现型,采用WinQTLCartographer2.5和SPSS11.5软件对A7-QTL进行精细定位以及标记和性状的关联分析。【结果】含油量QTL的置信区间在标记ZAAS849s-R131之间,范围在21.7cM左右,其LOD峰值为9.71,距离两侧最近标记RPSaA3和ZAAS839分别为0.9和2.1cM,QTL的加性效应值是0.75;QTL区段内的单标记方差分析表明:目标区段内4个标记各3种基因型的含油量之间存在极显著差异,标记ZAAS839处的差异最显著(P=1.2×10-10);通过比较含油量和4个标记之间的对应关系,进一步推断QTL最可能位于标记RPSaA3和ZAAS839之间或临近。【结论】用BC3F1群体定位的QTL区间与DH群体分析结果相重叠,但置信区间明显缩小;定位结果进一步确认了A7连锁群上存在油分QTL的真实性,增加了在该区域存有参与控制油菜含油量基因的可靠性;QTL可能存在于标记RPSaA3和ZAAS839临近区域,两标记间距约3cM。
关键词
甘蓝型油菜
含油量
QTL-近等基因系
QTL定位
Keywords
Brassica napus L.
oil content
QTL-NILs
QTL-mapping
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
TP212 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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职称材料
题名
油菜N13和N18上含油量QTL作图区间相关候选基因克隆
2
作者
邵珏
汪义龙
邵玉锁
曹明富
赵坚义
机构
杭州师范大学生命与环境科学学院
浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所
扬州大学生物科学与技术学院
出处
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第1期35-42,共8页
基金
国家重点基础研究发展计划“973”资助项目(2006CB101600)
国家自然科学基金面上资助项目(30871543)
浙江省科技计划资助项目(2007C22020)
文摘
以前人报道的SG-图谱和DH群体为材料,利用拟南芥脂质基因库和芸薹属EST库信息资源,选择与拟南芥中诠释的重要油脂合成相关基因高度同源的甘蓝型油菜EST和其他具有基因信息的EST序列为标记来源,发展功能基因标记加密SG图谱;对定位在N13和N18连锁群上含油量QTL区间的相关基因片段进行克隆、测序和生物信息学分析,以期获得可能与种子含油量QTL有关联的侯选基因。结果表明:在2条连锁群的3个含油量QTL区域内共连锁上6个功能基因,其中与拟南芥同源的3个基因在油脂合成途径中发挥重要作用;其双亲差异片段经克隆测序和比对分析,发现有2个在双亲间存在氨基酸水平差异;将获得的基因片段和拟南芥同源基因序列比对结果显示,二者间内含子部分核苷酸序列相似率平均为57.7%,外显子区域为86.7%,氨基酸水平上则达到89.2%。
关键词
甘蓝型油菜
含油量
QTL
克隆
序列分析
Keywords
Brassica napus L.
oil content
QTL
cloning
sequence analysis
分类号
Q349 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
甘蓝型黄籽油菜育种研究进展
3
作者
邵珏
邵玉锁
曹明富
机构
杭州师范大学生命与环境科学学院
出处
《杭州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008年第5期368-371,共4页
文摘
介绍了国内外甘蓝型黄籽油菜育种的理论及方法,概述近年来取得的成果,指明今后研究的重点和方向,并指出黄籽育种必须与生物技术相结合,才能适应育种科技发展的需要.
关键词
甘蓝型油菜
黄籽育种
进展
Keywords
Brassica napus
yellow-seed breeding
progress
分类号
Q-1 [生物学]
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职称材料
题名
获取基因全长c DNA策略及应用
4
作者
邵珏
邵玉锁
曹明富
机构
杭州师范大学生命与环境科学学院
出处
《健康研究》
CAS
2009年第2期140-142,共3页
文摘
全长cDNA是研究基因功能的关键,获得全长cDNA也是基因组研究的重要内容之一,本文概述了近年来国内外获取未知基因cDNA全长的理论及其应用。
关键词
全长CDNA
MRNA
PCR
进展
分类号
Q73 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
利用BC_3F_1群体定位和分析甘蓝型油菜A7-含油量QTL
邵玉锁
倪西源
黄吉祥
任丽平
赵蔚
方小燕
曹明富
赵坚义
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
2
下载PDF
职称材料
2
油菜N13和N18上含油量QTL作图区间相关候选基因克隆
邵珏
汪义龙
邵玉锁
曹明富
赵坚义
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2010
0
下载PDF
职称材料
3
甘蓝型黄籽油菜育种研究进展
邵珏
邵玉锁
曹明富
《杭州师范大学学报(自然科学版)》
CAS
2008
0
下载PDF
职称材料
4
获取基因全长c DNA策略及应用
邵珏
邵玉锁
曹明富
《健康研究》
CAS
2009
0
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职称材料
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