长毛兔Hoxa4基因多态性及其与产毛量关联性分析

【目的】分析苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子遗传多态性及其与产毛量的相关性,发现与产毛量相关的分子标记,为加快毛兔选育提供参考。【方法】采用PCR产物直接测序法对208只苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子进行遗传变异检测,并运用SAS 8.1软件对苍溪长毛兔Hoxa4基因遗传变异与产毛量进行关联性分析。【结果】苍溪长毛兔Hoxa4基因第2外显子存在1个SNP位点(c.294T>C),该突变导致氨基酸由Ser-Pro(TCC-CCC)转变,共检测到TT、TC、CC三种基因型。其中TC基因型为优势基因(0.596 2),T为优势等位基因(0.562 9)。对突变位点的群体遗传参数分析发现:杂合度为0.494 4,有效等位基因数为1.977 9,多态信息含量(0.372 2)处于中度多态,说明Hoxa4基因在苍溪长毛兔中具有较高遗传变异能力,有持续选育的潜力实现兔群遗传改良。关联性分析发现携带CC基因型的个体73日龄产毛量显著高于TC型(P<0.05),且146日龄阶段产毛量显著高于TT型(P<0.05),极显著高于TC型(P<0.01)。【结论】Hoxa4基因第2外显子突变可作为评定苍溪长毛兔产毛量的遗传标记。