TDG介导的去甲基化在细胞发育分化及肿瘤发生中的研究进展

DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,可对生命发生发展阶段中的基因表达进行调控。近来研究发现,胸腺嘧啶DNA糖苷酶(thymine DNA glycosylase, TDG)是能特异修复G:T错配的酶,在DNA去甲基化过程中起到重要作用。TDG与TET、AID、Gadd45a等蛋白协同,通过碱基切除修复(base excision repair, BER)作用参与DNA去甲基化过程。此外,TDG介导的BER作用能去除甲基化中间产物的5-羟甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine, 5hmC)及其衍生物的积累、消除5-甲基胞嘧啶(5-methylcyosine, 5mC)自发脱氨基导致的突变,保持基因组的遗传稳定性。TDG的表达下降或酶的失活会引起基因组稳定性降低,增加肿瘤发生的风险。TDG介导的DNA去甲基化修饰调节影响胚胎发育、细胞分化与衰老的过程,其对癌症的发生也有着不可忽视的作用。

乳头状甲状腺癌术后功能减低患者肠道微生物群落的结构性变化

目的探索乳头状甲状腺癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)术后患者特定病程中的肠道微生物群落的结构性变化。方法纳入64例PTC术后拟行131 I治疗的住院患者为甲癌(thyroid carcinoma,TC)组,同时招募15名健康志愿者作为健康对照(healthy control,HC)组。对TC组及HC组粪便样本用16S rRNA(16S ribosomal RNA)测序法进行微生物组学的分析。将TC组进一步分为合并桥本甲状腺炎(TPOAb>40 IU/mL,TPOAb^+)组和不合并桥本甲状腺炎(TPOAb≤40 IU/mL,TPOAb^-)组,进行微生物组学的分析。结果相比于HC组,TC组患者存在显著的甲状腺功能低下,且TC组粪便微生物群落的丰富度指数显著低于HC组。在属水平上,6种菌群的丰度在两组间具有统计学差异。功能注释分析提示,这些菌群的改变可能与转录因子、膜和胞内结构分子生物合成等相关。TPOAb^+组与TPOAb^-组的粪便微生物群落丰度指数差异无统计学意义。结论与健康人群相比,PTC术后伴随甲状腺功能减低的特定病程中,患者存在肠道微生物群落失调。

NSCLC患者尿液中游离miRNAs qPCR内参基因的选择

目的探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)患者和健康志愿者尿液中微小RNA(miRNA)内参基因的稳定性。方法分别收集NSCLC患者(12名)和健康志愿者(7名)尿液样本,经膜浓缩过滤后提取其中的总RNA。通过BGISEQ-500 miRNA建库和二代测序技术(NGS)测定尿液样本中miRNA的表达谱,基于测序表达量(transcript per million, TPM)值筛选出前5个高丰度的候选内参基因,包括常用的内参基因U6,通过实时荧光定量PCR(qPCR)技术在另一组样本中进行验证。利用geNorm软件、NormFinder软件和BestKeeper软件评价候选内参基因表达的稳定性。结果 geNorm软件和NormFinder软件分析结果一致,候选内参基因的稳定性由高到低的顺序为:真核生物核糖体大亚基(28S rRNA)、真核生物核糖体小亚基(18S rRNA)、U6、5S rRNA和tRNA。BestKeeper软件分析结果显示28S rRNA和U6的稳定性优于其它候选内参基因,tRNA的表达不稳定,18S rRNA最适合与其它候选内参基因联合使用。结论 28S rRNA是最稳定的内参基因,28S rRNA和18S rRNA可联合使用作为尿液样本中qPCR的内参基因;这为尿液中游离miRNAs在疾病诊断中的定量分析提供了重要依据。

肠道微生物对甲状腺碘代谢的潜在调控机制

碘是人体必需的微量元素,胃肠道摄入是人体获取碘的主要途径。肠道包含的万亿数量级的微生物对于人体物质能量代谢及基因信息调控有着十分重要的影响。肠道微生物或其代谢产物可通过循环系统作用于甲状腺(即"肠-甲状腺轴"),对甲状腺的碘代谢进行潜在调控。该文综述了肠道微生物对肠内碘摄取的影响及其对甲状腺细胞表面钠/碘同向转运体(NIS)表达及活性的调控,探讨了肠道微生物参与甲状腺碘代谢的潜在调控机制。肠道微生物影响甲状腺碘代谢的直接因素包括脂多糖、短链脂肪酸、微生物肽段或蛋白质等,通过影响核因子kappa B通路、参与组蛋白乙酰化修饰或抗原抗体反应等方式影响甲状腺NIS的表达或活性;间接因素包括肠道微生物改变细胞内环境,从而通过调控甲状腺特异转录因子的水平及调节促甲状腺激素及其受体介导的信号通路等方式影响甲状腺细胞内外碘离子的转运。

基于深度神经网络构建的甲状腺平面显像智能识别甲状腺功能状态诊断模型

目的研发基于深度神经网络的智能识别甲状腺功能状态的诊断模型.方法选取2016年5月至2018年6月1616例(男283例,女1333例,平均年龄52岁)临床已确诊受检者的甲状腺平面显像图,其中甲状腺正常图像299例,甲状腺功能亢进症(简称甲亢)图像876例,甲状腺功能减退症(简称甲减)图像441例.利用2种深度神经网络模型AlexNet和深度卷积生成对抗网络(DCGAN),应用深度学习算法对1000例训练集样本进行特征提取和训练,对616例测试集样本进行效能验证,对2种模型的验证结果分别进行分析,采用Kappa检验进行一致性分析,并分析智能诊断模型的时间优越性.结果AlexNet模型平均诊断时间为1s/例,其对甲状腺功能正常、甲亢和甲减的分类判别准确性分别为82.29%(79/96)、94.62%(369/390)、100%(130/130),分类结果与确诊结果的一致性检验Kappa值为0.886(P<0.05);DCGAN模型平均诊断时间为1s/例,其对甲状腺功能正常、甲亢和甲减的分类判别准确性分别为85.42%(82/96)、95.64%(373/390)、99.23%(129/130),分类结果与确诊结果的一致性检验Kappa值为0.904(P<0.05).结论深度神经网络智能诊断模型可快速判别甲状腺平面显像中甲状腺的功能状态,识别准确性较高,为甲状腺平面显像图审阅提供了新方式.

趋化因子水平变化在预测分化型甲状腺癌病情进展中的价值

目的探讨趋化因子在分化型甲状腺癌(DTC)患者血清中的表达水平与DTC进展间的关系。方法回顾性收集2017年1月至2017年4月间同济大学附属第十人民医院核医学科的76例DTC术后患者(男25例、女51例,中位年龄39岁)外周血血样,检测其中40种趋化因子水平。以不同方式对患者进行分组:(1)按照是否发生转移,分为非转移组(n=13)和转移组(n=63);(2)按照DTC失分化程度,分为未转移组(n=13)、仅淋巴结转移组(n=48)、高度恶性组(n=11)和碘难治性DTC(RAIR-DTC)伴远处转移组(n=4);(3)按照患者近2年随访131I治疗次数,分为单次治疗组(n=51)与多次治疗组(n=25)。比较各组间趋化因子的水平差异;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析评价有差异的趋化因子水平预测DTC转移及行多次131I治疗的效能。采用两独立样本t检验、Mann-Whitney U检验、单因素方差分析等分析数据。结果与非转移组相比,转移组中嗜酸性粒细胞趋化因子3[Eotaxin-3;(25.94±6.05)与(21.76±5.71)ng/L]、γ-干扰素[IFN-γ;(116.04±28.98)和(98.71±26.18)ng/L]、巨噬细胞衍生趋化因子[MDC;(1468.08±401.74)和(1082.94±423.30)ng/L]及胸腺表达趋化因子[TECK;505.22(419.80,563.36)和402.89(347.43,442.97)ng/L]的表达降低(t值:2.376、2.131、3.007,U=215.000,均P<0.05)。采用IFN-γ+MDC+TECK预测甲状腺癌转移的ROC曲线下面积为0.844(95%CI:0.755~0.932,P<0.001),灵敏度为79.37%(50/63)。未转移组、仅淋巴结转移组、高度恶性组和RAIR-DTC伴远处转移组间仅MDC的差异有统计学意义[(1468.08±401.74)、(1121.59±454.20)、(976.07±281.04)和(922.68±342.41)ng/L;F=3.564,P<0.05],且随失分化程度增加MDC水平逐渐降低。与单次治疗组相比,多次治疗组中仅白介素(IL)-8的水平升高[28.20(23.22,32.51)与30.51(26.98,35.57)ng/L;U=801.000,P<0.05];IL-8预测行多次131I治疗的ROC曲线下面积为0.648(95%CI:0.523~0.773,P<0.05),灵敏度达100%(25/25)。结论在DTC中,IFN-γ、MDC及TECK水平降低可能是预测肿瘤发生转移的潜在标志;MDC很可能是DTC失分化的潜在分子靶标,其表达降低可能预示肿瘤失分化的恶性程度增加;IL-8或可用于预测患者是否需行多次131I治疗。

儿童骨外软组织肿瘤摄取99Tcm-MDP的特点与肿瘤组织病理学的关系

目的探讨肿瘤患儿骨显像中骨外软组织肿瘤摄取99Tcm-亚甲基二膦酸盐(MDP)的特点,以及其与肿瘤组织病理学的关系。方法回顾性分析2008年12月至2018年12月在上海交通大学医学院附属新华医院和同济大学附属第十人民医院行骨显像的33例肿瘤患儿的临床资料,其中男患儿21例、女患儿12例,年龄3个月~10岁。根据病理学结果将肿瘤类型分为母细胞瘤、间叶组织肿瘤和生殖细胞肿瘤3大类。根据骨显像等影像学结果,将骨外软组织肿瘤的最高放射性浓聚程度从低到高分为“+”、“++”和“+++”,分析骨显像的特点及其与肿瘤病理学的关系。软组织肿瘤摄取99Tcm-MDP的多组间比较采用Kruskal-Willis H秩和检验。结果33例患儿中母细胞瘤26例(78.8%,包括神经母细胞瘤15例、肾母细胞瘤6例、肝母细胞瘤4例和胰母细胞瘤1例)、间叶组织肿瘤5例(15.2%,包括骨肉瘤肺转移灶3例、恶性肾外横纹肌样瘤1例和左大腿脉管瘤1例)和生殖细胞肿瘤2例(6.0%),软组织肿瘤的3种类型摄取99Tcm-MDP程度的差异无统计学意义(H=1.993,P=0.369)。所有患儿骨外软组织肿瘤骨显像内部特点为钙化、坏死和其他特点(含有骨化基质或实性肿块无明显坏死及钙化),摄取99Tcm-MDP为“+”的6例(6/33,18.2%)、“++”的11例(11/33,33.3%)和“+++”的16例(16/33,48.5%),肿瘤内钙化伴坏死、钙化、坏死和其他原因引起的99Tcm-MDP摄取程度的差异无统计学意义(H=2.313,P=0.315)。不同病理类型的肿瘤摄取99Tcm-MDP为“+”的6例(18.2%,包括母细胞瘤5例、间叶组织肿瘤1例)、“++”的11例(33.3%,包括母细胞瘤9例、间叶组织肿瘤2例)和“+++”的16例(48.5%,包括母细胞瘤12例、间叶组织肿瘤2例、生殖细胞肿瘤2例)。结论骨显像时患儿骨外软组织肿瘤摄取99Tcm-MDP多提示为恶性肿瘤,以神经母细胞瘤最常见,其程度与组织病理学分类无明显相关性。