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氨基磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白
1
作者
曾艳
安静林
+6 位作者
肖小帆
赵丽
郄鹏璠
黄胜
刘进
阳泰
许高洁
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2020年第1期43-49,共7页
目的采用磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白。方法地榆皂苷Ⅱ具有羧基端,将其活化后,羧基端与氨基磁珠的氨基端偶联。将0、2、10 mmol·L-1地榆皂苷Ⅱ与磁珠形成配合物后,与等量TF-1细胞蛋白裂解产物共孵育,使地榆皂苷Ⅱ结合潜在作...
目的采用磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白。方法地榆皂苷Ⅱ具有羧基端,将其活化后,羧基端与氨基磁珠的氨基端偶联。将0、2、10 mmol·L-1地榆皂苷Ⅱ与磁珠形成配合物后,与等量TF-1细胞蛋白裂解产物共孵育,使地榆皂苷Ⅱ结合潜在作用靶蛋白;利用磁力架捕获上述磁珠,解离地榆皂苷Ⅱ的结合蛋白;经过SDS-PAGE电泳分离,采用高分辨质谱鉴定PAGE胶上的蛋白,呈现与地榆皂苷Ⅱ相结合的蛋白;通过基因本体论和京都基因与基因组百科全书数据库分析差异蛋白;通过特异性肽段数量及基于强度的绝对蛋白质定量(IBAQ)值的高低,从中筛选可信度较高的地榆皂苷Ⅱ作用蛋白。结果鉴定空白磁珠及化合物偶联磁珠结合蛋白共计226种。扣除空白磁珠结合蛋白本底,鉴定出66种地榆皂苷Ⅱ特异性作用蛋白,通过特异性肽段与IBAQ值综合分析可知:与地榆皂苷Ⅱ作用相关的蛋白主要为DNA依赖性蛋白激酶催化亚基、翻译激活剂GCN1及酰基甘油激酶等。结论利用氨基磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ的潜在作用蛋白,可为进一步阐释地榆皂苷Ⅱ及地榆的作用机制提供依据。
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关键词
地榆
地榆皂苷Ⅱ
磁珠
靶蛋白
银染
差异蛋白
机制
基因本体论
京都基因与基因组百科全书
特异性肽段
基于强度的绝对蛋白质定量
磁珠-化合物偶联技术
原文传递
题名
氨基磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白
1
作者
曾艳
安静林
肖小帆
赵丽
郄鹏璠
黄胜
刘进
阳泰
许高洁
机构
成都医学院药学院
成都医学院科研实验中心
出处
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2020年第1期43-49,共7页
基金
国家自然科学基金资助项目(批准号:81201668)
成都市科技局项目(2015-HM01-00506-SF
+5 种基金
2018-YF05-00454-SN)
四川省教育厅重大培育项目(17CZ0011)
成都医学院科研基金(CYCG15-01)
国家级大学生创新创业训练计划项目(201613705009
201613705070
201613705092)
文摘
目的采用磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白。方法地榆皂苷Ⅱ具有羧基端,将其活化后,羧基端与氨基磁珠的氨基端偶联。将0、2、10 mmol·L-1地榆皂苷Ⅱ与磁珠形成配合物后,与等量TF-1细胞蛋白裂解产物共孵育,使地榆皂苷Ⅱ结合潜在作用靶蛋白;利用磁力架捕获上述磁珠,解离地榆皂苷Ⅱ的结合蛋白;经过SDS-PAGE电泳分离,采用高分辨质谱鉴定PAGE胶上的蛋白,呈现与地榆皂苷Ⅱ相结合的蛋白;通过基因本体论和京都基因与基因组百科全书数据库分析差异蛋白;通过特异性肽段数量及基于强度的绝对蛋白质定量(IBAQ)值的高低,从中筛选可信度较高的地榆皂苷Ⅱ作用蛋白。结果鉴定空白磁珠及化合物偶联磁珠结合蛋白共计226种。扣除空白磁珠结合蛋白本底,鉴定出66种地榆皂苷Ⅱ特异性作用蛋白,通过特异性肽段与IBAQ值综合分析可知:与地榆皂苷Ⅱ作用相关的蛋白主要为DNA依赖性蛋白激酶催化亚基、翻译激活剂GCN1及酰基甘油激酶等。结论利用氨基磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ的潜在作用蛋白,可为进一步阐释地榆皂苷Ⅱ及地榆的作用机制提供依据。
关键词
地榆
地榆皂苷Ⅱ
磁珠
靶蛋白
银染
差异蛋白
机制
基因本体论
京都基因与基因组百科全书
特异性肽段
基于强度的绝对蛋白质定量
磁珠-化合物偶联技术
Keywords
Sanguisorba officinalis
Ziyuglycoside Ⅱ
Magnetic beads
Target protein
Silver staining
Differential protein
Mechanism
Gene ontology
Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
Unique peptides
Intensity-based absolute-protein-quantification
Magnetic bead-compound coupling technology
分类号
R915 [医药卫生—微生物与生化药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
氨基磁珠偶联法解析地榆皂苷Ⅱ作用蛋白
曾艳
安静林
肖小帆
赵丽
郄鹏璠
黄胜
刘进
阳泰
许高洁
《华西药学杂志》
CAS
CSCD
2020
0
原文传递
已选择
0
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引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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