渝东北片区聚集性诺如病毒感染毒株的遗传多样性

目的分析2021-2022年渝东北片区聚集性诺如病毒感染毒株遗传多样性,促进重点人群和场所诺如病毒感染防控。方法采集聚集性诺如病毒感染事件中患者肛拭子及环境拭子,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测诺如病毒核酸,逆转录PCR扩增病毒RNA聚合酶/衣壳蛋白片段并测序分析,诺如病毒分型工具网站(http://www.rivm.nl/mpf/norovirus/typingtool)确定基因型,运用MEGA-X软件按最大似然法构建种系发生树。结果共调查渝东北片区4个区县11起聚集性诺如病毒感染事件,qRT-PCR检测55份样品,均为GII基因群诺如病毒,经测序存在6种基因型。GII.17[P17]基因型导致4起疫情,GII.17[P17]和GII.1[P16]基因型混合感染导致1起疫情,GII.6[P7]及GII.8[P8]基因型各引起2起疫情,GII.2[P16]及GII.3[P12]基因型分别导致1起疫情。种系发生分析显示55株GII基因群毒株分布在5个基因簇。不同事件相同基因型的诺如病毒都位于同一个基因簇。不同事件不同基因型的诺如病毒各自聚集成簇,分属于不同的基因簇。结论2021-2022年渝东北片区11起聚集性诺如病毒感染毒株涉及多种基因型,GII.17[17]是引起聚集性感染事件的常见基因型,绝大多数事件由单一传染源引起,不同事件相同基因型的诺如病毒存在遗传相关性。

重庆市万州区重点人群布鲁氏菌病血清抗体监测结果分析

目的:对重庆市万州区2017—2020年重点人群布鲁氏菌病(简称布病)血清抗体监测结果进行分析,了解该人群感染状况,为布病防控提供科学依据。方法:选定畜牧业较发达的乡镇为监测点,调查牛、羊养殖户,屠宰户以及畜牧兽医人员等重点职业人群,并对其进行布病抗体监测,实验数据采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果:1 085份血清标本检出布病抗体阳性13份,阳性率约为1.20%,不同监测年度阳性率,差异无统计学意义(χ^(2)=1.097,P>0.05)。其中,羊饲养人群检出阳性3人、牛饲养人群7人、牛/羊混合养殖人群2人、畜牧兽医检出1人;不同性别、年龄组阳性率,差异无统计学意义(χ^(2)=0.029、1.333、P>0.05);不同职业阳性率,差异有统计学意义(χ^(2)=9.057,P<0.05),其中畜牧兽医人群最高,羊饲养人群最低。结论:加强重点职业人群布病防控知识宣传,做好个人防护,持续开展人群布病抗体监测及预警工作。

重庆市万州区 GⅡ型诺如病毒流行病学特征分析

目的了解重庆市万州区GⅡ型诺如病毒流行病学特征,为相关疫情防控提供参考。方法收集2021年重庆市万州区GⅡ型诺如病毒感染性腹泻疫情资料和实验室检测数据,进行描述性分析。结果2021年共发生12起GⅡ型诺如病毒感染性腹泻疫情,其中聚集性疫情10起、暴发性疫情2起。12起疫情采集各类标本173份,检出GⅡ型诺如病毒阳性标本121份,阳性率为69.94%。其中,疑似病例与重点人群肛拭子阳性检出率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。疑似病例肛拭子与环境涂抹物标本阳性检出率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。6起疫情涉及的42株诺如病毒毒株的基因分型结果如下:18株为GⅡ.17[P17]型,占42.86%(18/42);16株为GⅡ.6[P7]型,占38.10%(16/42);5株为GⅡ.2[P16]型,占11.90%(5/42);3株为GⅡ.8[P8]型,占7.14%(3/42)。不同职业组、年龄组GⅡ型诺如病毒感染阳性率比较,差异有统计学意义(P<0.05)。不同性别组GⅡ型诺如病毒感染阳性率比较,差异无统计学意义(P=0.414)。不同地区GⅡ型诺如病毒感染罹患率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。不同场所GⅡ型诺如病毒感染罹患率比较,差异有统计学意义(P<0.001)。GⅡ型诺如病毒感染性腹泻疫情主要集中在春、冬季。结论2021年该地区存在多种基因型别的GⅡ型诺如病毒毒株流行,其中GⅡ型诺如病毒感染性腹泻疫情高发季节为春、冬季,重点防控场所为中、小学校和托幼机构。

2018-2021年渝东北地区HIV抗体确证试验结果分析

目的分析渝东北地区2018-2021年人类免疫缺陷病毒(HIV)抗体确证阳性样本分布特征,为艾滋病精准防控提供参考依据。方法依据《全国艾滋病检测技术规范》,对渝东北各HIV初筛实验室送检的样本进复检和确证试验,比较不同送检机构、性别、年龄送检人群的差异。结果4517份初筛阳性样本中,HIV-1抗体确证阳性3186份,占70.53%,阴性966份,占21.39%,不确定365份,占8.08%。送检机构以疾病预防控制中心阳性率最高,为86.64%;男性阳性占比为72.6%,女性占27.4%,男女比例约为2.65∶1;年龄主要集中在>40~60岁,阳性占比为44.70%;送检人群主要以医疗就诊人群的阳性占比最高,为52.66%。结论需重点关注中老年人群艾滋病防控,提倡自愿咨询检测,同时加大HIV筛查范围,全面覆盖重点人群和一般人群,有效防止艾滋病广泛传播。

2015—2021年重庆市万州区诺如病毒感染疫情流行特征分析

目的:了解重庆市万州区学校诺如病毒感染疫情流行特征,为精准防控提供参考。方法:从中国疾病预防控制中心“突发公共卫生事件管理信息系统”收集2015-2021年重庆市万州区诺如病毒感染疫情信息和实验室数据,进行描述性分析。结果:2015-2021年万州区共报告诺如病毒感染疫情14起(小学7起、幼儿园4起、中学3起),诺如病毒GⅡ型引起13起,GⅠ型引起1起,罹患率分别为1.07%、 1.95%,差异有统计学意义(χ^(2)=17.64,P<0.05)。共采集肛拭子、环境等标本311份,检出诺如病毒核酸阳性118份,阳性检出率为37.94%,其中GⅡ型85份(72.03%),GⅠ型30份(25.43%),GⅠ型、GⅡ型混合3份(2.54%)。托幼机构人群罹患率高于中小学(χ^(2)=61.10,P<0.05)。传播途径以人传人为主,其次是食源性,二者罹患率差异有统计学意义(χ~2=7.789,P<0.05)。症状以呕吐、腹泻为主,时间发生在冬季和春、秋季。结论:重庆市万州区诺如病毒感染疫情均发生在学校和托幼机构,应加强重点单位、人群传染病防治工作力度,做好早期病例排查和消毒等工作,持续开展病原学监测及传播途径研究。

34株O139群霍乱弧菌耐药性分析

目的了解O139群霍乱弧菌对常见抗菌药物的耐药性。方法按K-B法对2次疫情中分离的O139群霍乱弧菌分别进行药敏试验。结果34株O139群霍乱弧菌对诺氟沙星、环丙沙星、丁胺卡那霉素等抗菌药物敏感,对氨苄青霉素、链霉素、庆大霉素等高度耐药。结论在传染病疫情控制中应及时开展细菌的药物敏感试验监测工作,为临床提供针对性的指导用药,对疫情控制起到重要作用。

渝东北新发现HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞检测分析

目的了解渝东北片区新发现HIV感染者CD4+和CD8+水平及相关情况,为早期对艾滋病(AIDS)患者开展抗病毒治疗提供依据。方法采用流式细胞术对采集的抗凝全血标本进行CD4+和CD8+检测,并进行统计分析。结果 2010—2013年能随访到的741例新发现HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞绝对值均数为(302.86±216.99)个/μL,不同年度CD4+T淋巴细胞绝对值均值差异无统计学意义(F=0.63,P=0.59>0.05),不同年龄组HIV感染者首次CD4+T淋巴细胞绝对值均值差异有统计学意义(F=8.80,P=0.000001<0.01),且随年龄组增大CD4+T淋巴细胞绝对值均值有下降趋势。结论 1/3的HIV感染者发现时已经进入AIDS期。今后应加强宣传,早发现、早干预、早管理,以提高HIV感染者的生存质量。

万州区2010—2012年监管场所羁押人员HIV抗体检测结果分析

目的了解万州区监管场所艾滋病感染状况，为制定艾滋病病毒（HIV）控制策略和措施提供科学依据。方法对2010-2012年万州区监管场所羁押人员HIV抗体检测结果进行统计分析。结果2010-2012年共检测监管场所羁押人员52ll例，确证HIV-I抗体阳性25例，阳性率为0．48％，全部为男性，年龄在10～59岁，以20～49岁居多，以注射吸毒和性接触为主要传播途径。结论万州区监管场所HIV感染情况令人堪忧，而且已从高危人群向一般人群扩散，更趋向于中年化。因此．应加强监管场所羁押人员艾滋病防治知识教育和性道德教育．以预防和控制艾滋病的传播．

2020年初重庆市万州区新冠肺炎疫情核酸检测结果分析

目的:分析2020年初重庆市万州区新冠肺炎疫情核酸检测资料,为疫情防控提供参考。方法:对2020年1月19日—3月2日重庆市万州区新冠肺炎疫情中核酸检测数据进行分析,描述新冠肺炎感染者三间分布特征。结果:截至2020年3月2日,万州区累计采集各类标本23722份,检出新冠病毒核酸阳性178份,阳性检出率为0.75%。疫情防控分为4个阶段:1月19日—2月4日为第1阶段,2月5日—2月13日为第2阶段,2月14日—2月23日为第3阶段,2月24日—3月2日为第4阶段,阳性检出率分别为12.82%、2.11%、0.28%、0.10%,不同阶段阳性率比较,差异有统计学意义(χ^(2)=1155,P<0.05)。首例确诊病例报告时间为2020年1月21日,最后1例无症状感染者报告时间为3月2日,2月9日达疫情高峰期;累计报告确诊病例118例,无症状感染者60例;男女感染者比例为1.12∶1;最小年龄为7个月,最大82岁,集中在≥20岁年龄组(93.26%);疫情波及28个乡镇街道,城区感染者(57.87%)高于农村(42.13%);32.03%的疑似病例经2~3次重采复检核酸结果呈阳性。结论:核酸检测在新冠肺炎疫情防控中发挥了关键性作用。为防止漏检,适当增加采样监测频次,可提高核酸阳性检出率。

重庆市万州区人类免疫缺陷病毒感染者和艾滋病患者抗病毒治疗后病毒载量结果分析

目的:分析人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者和艾滋病患者经抗病毒药物治疗后病毒载量情况,为艾滋病防治工作提供参考。方法:收集2015—2021年重庆市万州区HIV感染者和艾滋病患者经抗病毒药物治疗后病毒载量检测相关资料,分析其治疗效果。结果:2015—2021年累计检测经抗病毒治疗后的HIV感染者和艾滋病患者血液标本4062份,其中3853份(94.85%)样本中病毒载量<400copy/mL,209份(5.15%)样本中病毒载量≥400copy/mL。经抗病毒治疗后,≥50岁年龄组病毒成功抑制率最高(96.07%),<20岁年龄组病毒成功抑制率最低(90.62%),20~49岁年龄组病毒成功抑制率为94.24%。病毒成功抑制率女性(96.39%)高于男性(94.41%),差异有统计学意义(χ^(2)=5.729,P<0.05)。结论:万州区HIV感染者和艾滋病患者经抗病毒药物治疗后病毒载量总体上得到抑制,抗病毒治疗效果良好。

2010—2021年重庆市万州区流行性感冒哨点监测病原学结果分析

目的分析重庆市万州区流感病毒流行趋势,为流行性感冒(简称流感)防控提供参考。方法收集2010年4月—2022年3月万州区流感哨点监测病原学检测数据,采用χ^(2)检验分析不同型别流感病毒流行特征。结果2010—2021年监测流感样病例标本10894份,检出流感病毒核酸阳性1496份,阳性率为13.73%,其中甲型893份、乙型603份,甲、乙型病毒阳性率分别为8.20%、5.54%。不同年度、季节阳性率差异均有统计学意义(χ^(2)年度=758.282、χ^(2)季节=242.641,P=0.000),其中以2017年最高、流行季以冬季最高;12个监测年度内8个年度有甲型H1N1、H3N2亚型、B型等混合流行,2个年度有H3N2亚型、B型流行,2个年度只有B型流行;其中2010、2013、2017年等3个年度流行优势株为H1N1亚型,2011、2015、2019、2021年等4个年度优势株为B型,2012、2014、2016、2018年等4个年度优势株为H3N2亚型。不同季节、不同型别病毒构成比差异有统计学意义,B型秋季最高(65.17%)、H3N2亚型夏季最高(78.82%),H1N1亚型冬春季高于夏秋季(χ^(2)=263.801,P=0.000);5个冬季流行高峰由H1N1亚型、B型和/或H3N2亚型流行引起,2个夏季高峰由H3N2亚型引起,B型引起春、秋季高峰各1个。各年龄组阳性率差异有统计学意义,5岁~年龄组最高,不同性别阳性率差异无统计学意义。结论2010—2021年重庆市万州区流感由甲型H1N1、H3N2亚型和乙型病毒交替流行,处于低水平活动期;不同型别流感病毒优势株具有明显季节性,流行高峰期以冬季为主;建议持续开展流感监测,关注毒株变化趋势,为流感防控提供科学指导。

2021年重庆市万州区两起食物中毒事件副溶血性弧菌溯源和耐药性分析

目的对2021年重庆市万州区两起食物中毒事件分离的副溶血性弧菌进行分子溯源分析,并分析其毒力基因、耐药性,为副溶血性弧菌引起的食源性疾病的防控和临床治疗提供参考。方法采用全自动微生物质谱仪鉴定病原菌,Illumina测序平台进行全基因组测序,利用多位点序列分型和全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide polymorphism,wgSNP)进行分子分型分析,数据库比对分析毒力和耐药基因,采用微量肉汤稀释法进行药敏实验。结果共鉴定8株副溶血性弧菌,其中7株来自患者,1株来自餐具。4株来自第1起食物中毒事件的副溶血性弧菌属于ST2156型克隆,wgSNP差异数为0,判断为同一克隆;3株来自第2起食物中毒事件的副溶血性弧菌属于ST199型克隆,wgSNP差异数为1~3 bp,判定为同一克隆。两次食物中毒事件患者的副溶血性弧菌间wgSNP差异数为50113~50114 bp,判定为不同克隆。7株来自患者的副溶血性弧菌携带外毒素基因tdh和tlh,来自餐具的仅携带tlh。8株副溶血性弧菌均仅携带blaCARB型耐药基因,且对氨苄西林中度敏感。结论两次食物中毒事件病原体均为副溶血性弧菌;两次食物中毒事件的副溶血性弧菌属于不同克隆,判断其无时空传播关系。未出现多重耐药现象,但均对抗生素氨苄西林中度敏感,建议临床治疗时尽量避免使用此类抗生素。

重庆市万州区乡镇居民诺如病毒无症状感染状况调查

目的了解重庆市万州区乡镇居民诺如病毒(norovirus,NoV)无症状感染状况,为NoV相关腹泻疫情防控提供依据。方法调查2022年万州区5个乡镇居民共计860人,采集粪便标本,用qRT-PCR方法检测NoV核酸及其型别(GⅠ和GⅡ)。结果共调查860人,检出NoV阳性32人,阳性率为3.72%,其中GⅠ型NoV 20人,阳性率为2.32%,GⅡ型NoV 12人,阳性率为1.40%。检测样本中男性和女性阳性率分别为4.60%和2.98%。3~6岁、7~18岁、19~60岁及61岁以上年龄组阳性率分别为10.49%、1.41%、2.58%和2.64%,3~6岁年龄组阳性率显著高于其余各年龄组(P<0.05)。GⅠ型NoV在男性和女性中阳性率分别3.07%和1.70%,3~6岁、7~18岁、19~60岁及61岁以上各年龄组阳性率分别为8.39%、1.41%、1.29%和0.75%,3~6岁年龄组与其余各年龄组阳性率差异均有统计学意义(P<0.05)。GⅡ型NoV在男性和女性中阳性率分别1.53%和1.28%,3~6岁、7~18岁、19~60岁及61岁以上各年龄组阳性率分别为2.10%、0.00%、1.29%和1.89%。5个被调查乡镇中有4个乡镇检出NoV,阳性率为3.09%~6.44%,GⅠ型阳性率为1.03%~4.95%且太龙镇与新田镇差异有统计学意义(χ^(2)=5.17,P=0.02),GⅡ型阳性率为1.49%~2.06%。结论2022年万州区被调查乡镇居民中各年龄段均存在NoV无症状感染,应加强NoV相关腹泻疫情防控,深入研究NoV无症状感染者在疫情暴发中的作用。

基于全基因组测序对一起食物中毒事件中的副溶血性弧菌溯源分析

目的 对一起食物中毒事件中的副溶血性弧菌进行分子分型溯源,并调查其毒力基因和耐药性。方法 采用全自动微生物质谱仪鉴定病原菌,illumina测序平台进行全基因组测序,利用多位点序列分型和全基因组单核苷酸多态性(whole genome single nucleotide polymorphism, wgSNP)进行溯源分析,数据库比对分析毒力和耐药基因,采用微量肉汤稀释法进行药敏实验。结果 共分离鉴定5株副溶血性弧菌,其中4株来自患者,1株来自龙虾开背刀。来自患者的均属于ST2156亚型,其wgSNP差异数为0,来自龙虾开背刀的为ST1880*型,其与来自患者的wgSNP差异数为36 649。4株ST2156型副溶血性弧菌均携带外毒素基因tdh和tlh,ST1880*型副溶血性弧菌只携带tlh。5株副溶血性弧菌均只携带氨苄西林耐药基因blaCARB-35,且仅对氨苄西林中度敏感。结论 此次食物中毒事件的病原菌为ST2156型副溶血性弧菌,未出现多重耐药现象,但均对抗生素氨苄西林中度敏感,建议临床治疗时尽量避免使用此类抗生素。

2010年-2015年重庆市万州区流感病原学监测结果分析

目的了解2010年-2015年万州区流感病毒流行情况及变化趋势,为科学制定流感防控策略和措施提供参考。方法收集2010年4月-2015年3月万州区国家级流感哨点监测医院流感样病例标本,利用实时荧光逆转录PCR法进行病毒核酸检测,阳性标本接种MDCK细胞进行病毒分离、鉴定。结果 2 766份流感样病例标本中检出流感病毒核酸阳性349份,阳性率为12.62%,各年度阳性率差异有统计学意义(χ2=85.78,P=0.000<0.05);分离出186株毒株,其中季节性H3N2型91株、BV系41株、甲型H1N1 37株、BY系17株。流感病毒在各监测年度均有1个冬季流行高峰,以甲型H1N1、B型、季节性H3N2型等混合流行;有3个年度均出现夏季流行高峰,以季节性H3N2型流行为主。结论万州区在2010年4月-2015年3月先后有4种毒株流行,流行强度呈总体下降趋势。甲型H1N1、B型、季节性H3N2型毒株呈现此消彼长、依次交替流行。

重庆三峡库区2011年手足口病监测结果分析

目的:对重庆三峡库区2011年手足口病监测病例进行病原学及流行特征分析,为该病的防控提供科学依据。方法:采用real-time RT-PCR技术检测肠道病毒通用型、肠道病毒71型及柯萨奇病毒A组16型。结果:972份标本检出肠道病毒通用型阳性619份,咽拭子、肛拭子、疱疹液检出率分别为60.25%、72.99%、72.53%;同一病例咽拭、肛拭子检出率差别无统计学意义(χ2=0.4444,P=0.5050)。手足口病患病人群中各年龄组之间,男、女患病率差别无统计学意义;发病季节呈现两个高峰,第1个高峰为4月-6月,第2个高峰为11月-12月。结论:2011年引起重庆三峡库区手足口病流行的主要病原体为EV71和CoxA16病毒。手足口病病原学核酸检测阳性率与不同类型标本无明显相关性,与标本采集质量、数量成正相关。

一起O139型霍乱暴发疫情的病原学分析

目的:查明一起霍乱疫情发生的原因,为疫情处置提供科学依据。方法:按照《霍乱防治手册》(第五版),对疫情中所有调查对象采集肛拭样,对肇事餐厅、追踪的市售可疑食物、有关环境、水质等采样共3167件,进行霍乱病原菌检测。结果:从813件就餐者肛拭样中共检出116株0139型霍乱弧菌,其中病原学确诊O139型霍乱病人3例,O139型霍乱携带者113例,其罹患率、带菌率、感染率分别为0.49%(4/813)、13.90%(113/813)、14.39%(117/813);从1377件环境样中检出0139型霍乱弧菌21件,阳性率为1.53%;与就餐者有接触史的800人份肛拭子、91件食品、86件水样中,均未检出霍乱病原菌。结论:此次疫情为一起聚餐引起的食源性O139型霍乱暴发,加工用具交叉污染是疫情暴发的直接原因;但未查明具体传染源。

重庆市万州区2010年-2011年流感病毒检测结果分析

目的:了解流感流行趋势及毒株变化情况,为制定流感防控策略提供科学依据。方法:利用实时荧光PCR法对流感监测标本进行流感病毒核酸检测,阳性标本进行病毒分离。结果:804份标本检出流感病毒核酸阳性168份;分离流感毒株57株。2010年流感高峰期发生在8月,以季甲H3型为优势毒株;2011年流感高峰期出现1月-3月,以新甲H1N1为优势毒株。流感患病率无性别差异,以5～年龄组流感病毒阳性率最高。结论:2010年-2011年万州区流感流行分别以季节性H3N2型、B-victoria系和新甲H1N1型为优势毒株。预防流感流行的重点人群是在校期间的中小学生。