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常见消化系统疾病湿热证微生态研究及思考
被引量:
2
1
作者
郭本琼
郑义馨
+2 位作者
牛競斌
盖筱
刘国萍
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023年第3期843-851,共9页
消化系统疾病湿热证是临床常见的疾病之一,消化道菌群的变化参与了慢性胃炎、溃疡性结肠炎、肠易激综合征及非酒精性脂肪肝等常见消化系统疾病湿热证的发生发展。正常生理状态下,消化道内的菌群相对处于微妙的平衡中,一旦被疾病“扰动...
消化系统疾病湿热证是临床常见的疾病之一,消化道菌群的变化参与了慢性胃炎、溃疡性结肠炎、肠易激综合征及非酒精性脂肪肝等常见消化系统疾病湿热证的发生发展。正常生理状态下,消化道内的菌群相对处于微妙的平衡中,一旦被疾病“扰动”会发生一种特异性偏离状态,表现为中医不同“证候”,并通过不同部位菌群的多样性、丰度、结构等特征改变而客观地反映出来。本文就近20年来常见消化系统疾病菌群湿热证研究相关文献进行梳理,从同病同证和异病同证两个方面对文献中的差异菌群进行比较和分析,从门、属、科3个水平筛选出相同的肠道差异菌群,以期为临床上非侵入性湿热证诊断及疾病治疗方面提供新的切入点。
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关键词
湿热证
消化系统疾病
菌群
综述
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职称材料
基于多种方法融合的慢性胃炎脾胃湿热证主症选择研究
被引量:
5
2
作者
牛競斌
徐玮斐
+4 位作者
钱鹏
盖筱
郑义馨
颜建军
刘国萍
《广州中医药大学学报》
CAS
2022年第8期1717-1722,共6页
【目的】从慢性胃炎患者的四诊数据中,筛选出脾胃湿热证患者的主症。【方法】提出多种特征选择算法集成机器学习的方法进行主症筛选,综合应用近邻传播聚类、随机森林、互信息和粗糙集挑选出主症特征,再融合判别分析方法完成脾胃湿热证...
【目的】从慢性胃炎患者的四诊数据中,筛选出脾胃湿热证患者的主症。【方法】提出多种特征选择算法集成机器学习的方法进行主症筛选,综合应用近邻传播聚类、随机森林、互信息和粗糙集挑选出主症特征,再融合判别分析方法完成脾胃湿热证主症的筛选。【结果】最终共筛选出7个主症,按照标准化典则判别函数系数大小依次为苔黄(1.641)、苔白(-1.065)、苔腻(0.757)、舌色红(0.504)、苔厚(0.495)、舌色淡白(-0.323)、胖大舌(-0.269),预测准确率为89.4%。【结论】本研究将多种数据处理方法融合,挑选出慢性胃炎脾胃湿热证患者的主症,结果与中医理论有较好的一致性。
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关键词
慢性胃炎
脾胃湿热证
数据挖掘
判别分析
主症选择
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职称材料
类风湿关节炎患者外周血循环中淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶甲基化的特征研究
3
作者
许玲夏
常岑
+10 位作者
姜平
魏凯
赵佳男
郑义馨
单雨
时一鸣
金晔华
沈逸
郭士成
何东仪
刘佳
《中华风湿病学杂志》
CAS
CSCD
2024年第3期155-161,I0002,共8页
目的分析类风湿关节炎(RA)患者外周血循环的淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)启动子区域的甲基化特征及其与临床指标的相关性。方法采用靶向甲基化测序方法分析比较RA与健康对照(HC)和骨关节炎(OA)患者外周血LCK启动子区域7个CpG位点...
目的分析类风湿关节炎(RA)患者外周血循环的淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)启动子区域的甲基化特征及其与临床指标的相关性。方法采用靶向甲基化测序方法分析比较RA与健康对照(HC)和骨关节炎(OA)患者外周血LCK启动子区域7个CpG位点的甲基化水平,并与临床信息进行相关性分析和ROC曲线构建。结果采用非参数检验分析发现,与HC[0.53(0.50,0.57)]和OA患者[0.59(0.54,0.62)]相比,RA患者[0.63(0.59,0.68)]的整体甲基化水平升高(H=47.17,P<0.001)。同时与HC组[0.38(0.35,0.41)、0.59(0.55,0.63)、0.60(0.55,0.64)、0.59(0.55,0.63)、0.58(0.53,0.62)、0.45(0.43,0.49)、0.57(0.54,0.61)]相比,RA组cg0535031560、cg0535031580、cg0535031595、cg05350-315101、cg05350315104、cg05350315128和cg05350315142CpG位点的甲基化水平都显著升高[0.46(0.42,0.49)、0.70(0.65,0.75)、0.70(0.66,0.76)、0.70(0.65,0.75)、0.69(0.64,0.74)、0.55(0.51,0.59)、0.68(0.63,0.73)],差异具有统计学意义(Z=-5.63,-5.89,-5.91,-5.89,-5.98,-5.95,-5.95,均P<0.001)。与OA组相比[0.65(0.59,0.69)、0.65(0.60,0.69)、0.64(0.58,0.68)、0.50(0.45,0.54)、0.63(0.58,0.67)],RA组cg0535-031595、cg05350315101、cg05350315104、cg05350315128、cg05350315142的CpG位点甲基化水平都显著升高[0.70(0.66,0.76)、0.70(0.65,0.75)、0.69(0.64,0.74)、0.55(0.51,0.59)、0.68(0.63,0.73)],差异具有统计学意义(Z=-3.56、-3.52、-3.60、-3.67、-3.62,P=0.036、0.042、0.031、0.030、0.030)。此外,利用Pearson相关分析发现该区域整体甲基化水平与CRP(r=0.19,P=0.004)和ESR(r=0.14,P=0.035)呈正相关。CRP(低)组[0.63(0.58,0.68)]的LCK启动子区域整体甲基化水平高于CRP(高)组[0.65(0.61,0.70)],差异有统计学意义(Z=2.60,P=0.009)。最后,通过构建ROC曲线,验证外周血LCK启动子区域甲基化水平作为RA患者,特别是血清阴性RA患者与HC、OA组的鉴别效能,曲线下面积(AUC)值(95%CI)为0.78(0.63,0.93)。结论本研究提供了RA患者外周血LCK启动子区域甲基化状态和甲基化单倍型模式特征,该区域整体甲基化水平与炎症水平呈正相关,同时可用于鉴别血清阴性RA患者与HC、OA患者。
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关键词
关节炎
类风湿
甲基化
淋巴细胞特异蛋白质酪氨酸激酶p56(LCK)
cg05350315
原文传递
题名
常见消化系统疾病湿热证微生态研究及思考
被引量:
2
1
作者
郭本琼
郑义馨
牛競斌
盖筱
刘国萍
机构
上海中医药大学基础医学院
出处
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023年第3期843-851,共9页
基金
国家自然科学基金委员会面上项目(81873236):基于复杂生物网络技术的慢性萎缩性胃炎湿热证诊断模型构建,负责人:刘国萍
文摘
消化系统疾病湿热证是临床常见的疾病之一,消化道菌群的变化参与了慢性胃炎、溃疡性结肠炎、肠易激综合征及非酒精性脂肪肝等常见消化系统疾病湿热证的发生发展。正常生理状态下,消化道内的菌群相对处于微妙的平衡中,一旦被疾病“扰动”会发生一种特异性偏离状态,表现为中医不同“证候”,并通过不同部位菌群的多样性、丰度、结构等特征改变而客观地反映出来。本文就近20年来常见消化系统疾病菌群湿热证研究相关文献进行梳理,从同病同证和异病同证两个方面对文献中的差异菌群进行比较和分析,从门、属、科3个水平筛选出相同的肠道差异菌群,以期为临床上非侵入性湿热证诊断及疾病治疗方面提供新的切入点。
关键词
湿热证
消化系统疾病
菌群
综述
Keywords
Dampness-heat syndrome
Digestive system diseases
Microbiota
Review
分类号
R256.3 [医药卫生—中医内科学]
下载PDF
职称材料
题名
基于多种方法融合的慢性胃炎脾胃湿热证主症选择研究
被引量:
5
2
作者
牛競斌
徐玮斐
钱鹏
盖筱
郑义馨
颜建军
刘国萍
机构
上海中医药大学基础医学院
华东理工大学机械与动力工程学院
出处
《广州中医药大学学报》
CAS
2022年第8期1717-1722,共6页
基金
国家自然科学基金面上项目(编号:81873236
81270050)。
文摘
【目的】从慢性胃炎患者的四诊数据中,筛选出脾胃湿热证患者的主症。【方法】提出多种特征选择算法集成机器学习的方法进行主症筛选,综合应用近邻传播聚类、随机森林、互信息和粗糙集挑选出主症特征,再融合判别分析方法完成脾胃湿热证主症的筛选。【结果】最终共筛选出7个主症,按照标准化典则判别函数系数大小依次为苔黄(1.641)、苔白(-1.065)、苔腻(0.757)、舌色红(0.504)、苔厚(0.495)、舌色淡白(-0.323)、胖大舌(-0.269),预测准确率为89.4%。【结论】本研究将多种数据处理方法融合,挑选出慢性胃炎脾胃湿热证患者的主症,结果与中医理论有较好的一致性。
关键词
慢性胃炎
脾胃湿热证
数据挖掘
判别分析
主症选择
Keywords
chronic gastritis
spleen and stomach damp-heat syndrome type
data mining
discriminant analysis
screening of primary syndromes
分类号
R259.733 [医药卫生—中西医结合]
下载PDF
职称材料
题名
类风湿关节炎患者外周血循环中淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶甲基化的特征研究
3
作者
许玲夏
常岑
姜平
魏凯
赵佳男
郑义馨
单雨
时一鸣
金晔华
沈逸
郭士成
何东仪
刘佳
机构
上海中医药大学附属光华医院关节内科
美国威斯康辛大学麦迪逊分校医学与公共卫生学院医学遗传学系
出处
《中华风湿病学杂志》
CAS
CSCD
2024年第3期155-161,I0002,共8页
基金
国家自然科学基金(82074234)
华东片区中西医结合关节病专科联盟项目(2021—2023)
上海何东仪名医工作室建设项目(SHGZS-202220)。
文摘
目的分析类风湿关节炎(RA)患者外周血循环的淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)启动子区域的甲基化特征及其与临床指标的相关性。方法采用靶向甲基化测序方法分析比较RA与健康对照(HC)和骨关节炎(OA)患者外周血LCK启动子区域7个CpG位点的甲基化水平,并与临床信息进行相关性分析和ROC曲线构建。结果采用非参数检验分析发现,与HC[0.53(0.50,0.57)]和OA患者[0.59(0.54,0.62)]相比,RA患者[0.63(0.59,0.68)]的整体甲基化水平升高(H=47.17,P<0.001)。同时与HC组[0.38(0.35,0.41)、0.59(0.55,0.63)、0.60(0.55,0.64)、0.59(0.55,0.63)、0.58(0.53,0.62)、0.45(0.43,0.49)、0.57(0.54,0.61)]相比,RA组cg0535031560、cg0535031580、cg0535031595、cg05350-315101、cg05350315104、cg05350315128和cg05350315142CpG位点的甲基化水平都显著升高[0.46(0.42,0.49)、0.70(0.65,0.75)、0.70(0.66,0.76)、0.70(0.65,0.75)、0.69(0.64,0.74)、0.55(0.51,0.59)、0.68(0.63,0.73)],差异具有统计学意义(Z=-5.63,-5.89,-5.91,-5.89,-5.98,-5.95,-5.95,均P<0.001)。与OA组相比[0.65(0.59,0.69)、0.65(0.60,0.69)、0.64(0.58,0.68)、0.50(0.45,0.54)、0.63(0.58,0.67)],RA组cg0535-031595、cg05350315101、cg05350315104、cg05350315128、cg05350315142的CpG位点甲基化水平都显著升高[0.70(0.66,0.76)、0.70(0.65,0.75)、0.69(0.64,0.74)、0.55(0.51,0.59)、0.68(0.63,0.73)],差异具有统计学意义(Z=-3.56、-3.52、-3.60、-3.67、-3.62,P=0.036、0.042、0.031、0.030、0.030)。此外,利用Pearson相关分析发现该区域整体甲基化水平与CRP(r=0.19,P=0.004)和ESR(r=0.14,P=0.035)呈正相关。CRP(低)组[0.63(0.58,0.68)]的LCK启动子区域整体甲基化水平高于CRP(高)组[0.65(0.61,0.70)],差异有统计学意义(Z=2.60,P=0.009)。最后,通过构建ROC曲线,验证外周血LCK启动子区域甲基化水平作为RA患者,特别是血清阴性RA患者与HC、OA组的鉴别效能,曲线下面积(AUC)值(95%CI)为0.78(0.63,0.93)。结论本研究提供了RA患者外周血LCK启动子区域甲基化状态和甲基化单倍型模式特征,该区域整体甲基化水平与炎症水平呈正相关,同时可用于鉴别血清阴性RA患者与HC、OA患者。
关键词
关节炎
类风湿
甲基化
淋巴细胞特异蛋白质酪氨酸激酶p56(LCK)
cg05350315
Keywords
Arthritis,rheumatoid
Methylation
Lymphocyte specific protein tyrosine kinase p56(LCK)
cg05350315
分类号
R593.22 [医药卫生—内科学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
常见消化系统疾病湿热证微生态研究及思考
郭本琼
郑义馨
牛競斌
盖筱
刘国萍
《世界科学技术-中医药现代化》
CSCD
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
2
基于多种方法融合的慢性胃炎脾胃湿热证主症选择研究
牛競斌
徐玮斐
钱鹏
盖筱
郑义馨
颜建军
刘国萍
《广州中医药大学学报》
CAS
2022
5
下载PDF
职称材料
3
类风湿关节炎患者外周血循环中淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶甲基化的特征研究
许玲夏
常岑
姜平
魏凯
赵佳男
郑义馨
单雨
时一鸣
金晔华
沈逸
郭士成
何东仪
刘佳
《中华风湿病学杂志》
CAS
CSCD
2024
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