单向锚定 PCR 富集扩增在克隆低丰度基因转录本中的应用

利用国际生物信息资源，通过计算机检索寻找与已知功能基因具有高度同源的ＥＳＴｓ，据此设计特异的ＰＣＲ扩增引物，并通过单侧特异引物搭配ｃＤＮＡ分子库载体引物（锚定引物），在低严紧条件下扩增各种组织的ｃＤＮＡ分子库以富集目标片段。继以单向锚定ＰＣＲ扩增产物为模板，用双侧特异引物再次扩增，获得的特异扩增ＰＣＲ产物经测序证实之后，将其用作探针杂交筛选相应的ｃＤＮＡ文库并进而克隆目的基因的全长ｃＤ－ＮＡ。此方法用于三个人类新基因的全长ｃＤＮＡ的分离与克隆，结果全部获得成功。这三个人类新基因分别是Ｈ－ＲａｌＧＤＳ基因、Ｈ－ＣＩＳ基因和Ｈ－Ｓ６ＰＫ基因，它们在ＧｅｎＢａｎｋ数据库的登录号分别是：ＡＦ０２７１６９、ＡＦ０３５９４６及ＡＦ０３７４４７。本文结果提示这一方法对于应用现有的人类基因组生物信息资源，克隆具有重要生物学功能的人类新基因，尤其是克隆呈低丰度的基因转录本全长序列具有较高的实用价值。

中国人dystrophin基因基本结构概况的研究

Ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ是ＤＭＤ／ＢＭＤ基因完整的ｃＤＮＡ分子所编码的蛋白质产物，称肌营养不良蛋白。该基因跨Ｘｐ２１．１－ｐ２１．３。本文用ＤｙｓｔｒｏｐｈｉｎｃＤＮＡ制作了该基因的部分ＨｉｎｄⅢ限制性图，证实该基因共有６６个Ｈｄ片段。经与ＰｖｕⅡ，ＸｂａⅠ，ＴａｑⅠ等限制性图的对比分析，得出了Ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ基因至少含有７９个外显子的结论。此外，应用脉冲场电泳的方法作出了Ｘｐ２１区内２７２０ｋｂ的ＳｆｉⅠ限制图，Ｄｙｓ－ｔｒｏｐｈｉｎ基因跨其中的２３００ｋｂ，并分别阐明了其外显子的分布概况。

用PCR-RFLP方法研究藏族HLA-DQA1和-DQB1基因多态性

应用目前HLA研究领域中成熟的,有效的PCR-RFLP基因分型技术,从DNA水平对藏族健康群体进行了HLA-DQA1(49人)和-DQB1(49人)基因分型,这在国内外属首次。所采用的PCR-RFLP基因分型技术是在HLA-DQA1和-DQB1各等位基因全部序列已知的情况下,对其第2个外显子碱基序列扩增进而进行RFLP分析的方法。这种方法得到的RFLP的所有片段都是已知序列,因而精确度很高,同时为发现新的等位基因提供了成熟而有效的分析方法。研究结果表明,在藏族DQA1的8个等位基因,DQA1*0301的基因频率最高(36.74％)。DQA1*0601(4.08％)、*0103(4.08％)和*0401(5.10％)最低。在DQB1的16个等位基因中,OQB1*0302(16.33％)、*0303(15.31％)和*0602(15.31％)为最常见,没有观察到*0504。统计分析表明,在DQA1各等位基因分布上,藏族与新疆汉族、北方汉族、上海汉族十分相近;与维吾尔族和哈萨克族也没有明显差异。在OQB1各等位基因的分布上,藏族与汉族、维族、哈族之间略有差异,而汉族、维族、哈族之间也存在一些差异。

用GT重复多态性诊断21三体患者中超数21号染色体减数分裂起源的研究

通过PCR扩增、PAG电泳和硝酸银显色，首次分析了人类21号染色体长臂上两个紧靠着丝粒的GT重复序列（D21S215和D21S120）在中国人中的多态性，并用于光天愚型患者中超数21号染色体减数分裂起源的诊断。D21S215和D21S120在中国人中分别有6和5个等位片段，杂合率观测值均为0.68，多态信息含量分别为0.67和0.65。用这两标记，在17例已知超数21号染色体双亲来源的患者中，检测出16例的减数分裂起源；其中来自母亲减数分裂Ⅰ和Ⅱ的分别有7和4例，属父亲减数分裂Ⅰ和Ⅱ不分离的分别为2和3例。对研究超数21号染色体起源的生物学意义等进行了讨论。

用人/啮齿类体细胞杂种系及荧光原位杂交将人类新基因ZNF191定位于染色体18q12.1

本文以锌指蛋白ZNF191全长cDNA为探针,与人/啮齿类体细胞杂种系DNA杂交,将这个新的人类锌指基因定位于18号染色体。又用该cDNA筛选人基因组DNA lambda/DASH文库,以获得的DNA片段为探针,进行人染色体荧光原位杂交(FISH)分析,将ZNF191基因精细定位在染色体18q 12.1区带。依据有关遗传连锁分析和等位基因荧光原位杂交(FISH),将ZNF191精确定位于人染色体18q12.1。通过遗传连锁及染色体杂合性丢失分析.目前已知多种遗传病和肿瘤与这个区域相关。因此,ZNF191基因可作为这些疾病或肿瘤的候选相关基因。

用万能引物PCR法从YAC中分离制备荧光原位杂交探针的研究

报道了一种从微量且未知碱基顺序的YAC DNA中制备FISH探针的新方法——万能引物PCR(UP PCR),即把复性后的UP-Linker连接于PFGE分离后经Alu Ⅰ酶切的YAC DNA上,再用UP对其进行PCR扩增和标记。由于Alu Ⅰ的广谱性和UP与Linker长度不同等,使该法能根据PCR效率调节扩增产物的广泛性向特异性的转变,且产物能覆盖YAC嵌入DNA的全长。此法制备的人21号染色体FISH探针,特异性强,杂交信号明亮,21号染色体的检出率高。该法稳定简便。

URI1蛋白生物信息学分析及在人体组织中的表达

目的分析人非经典前折叠素RPB5相互作用因子1(URI1)蛋白的特性、结构和变异体,观察URI1蛋白在人组织中的表达。方法通过多种网络分析工具,预测和分析URI1的基本特性及结构。用人组织微阵列免疫组化染色方法检测其在多种组织/细胞中的表达。结果 URI1编码1个535个氨基酸的蛋白质,该蛋白质性质不稳定,无跨膜片段,N末端无信号肽,非分泌型蛋白质,其mRNA在组织中广泛表达。URI1具有11个潜在的泛素化位点,其中6个为高度可信,5个为中度可信。有48个潜在的磷酸化位点(35个在丝氨酸位、11个在苏氨酸位、2个在酪氨酸位)。在第287氨基酸位有一糖基化位点,在第291、371氨基酸位也可能发生糖基化修饰,未发现乙酰化位点。蛋白质结构预测α螺旋(H)占39.63%,N端具有1个PFD功能域。URI1在多种组织/细胞广泛表达并存在明显差异表达,与基于高密度微阵列技术的BioGPS mRNA表达谱数据吻合。结论用生物信息学技术预测了URI1蛋白的结构和功能,为URI1蛋白的相关研究提供了信息。

脆性位点研究的过去、现在和未来

脆性位点(fragile site),简称脆点,是染色体上的特异位点。在特定的组织培养条件下或通过特殊的化学物质诱导,染色体在该处发生非随机的裂隙或断裂。它与人的智力低下和癌症发生有关。人们对此仅研究了10多年,当然还有大量的问题没有解决。

牛血清清蛋白在小鼠骨肉瘤模型PCR基因分型中的应用

目的验证在PCR反应体系中加入牛血清清蛋白(BSA)可否提高小鼠骨肉瘤模型floxed Rb1基因杂合子和纯合子的检出率与准确率。方法以小鼠骨肉瘤模型子代小鼠基因组DNA为模板,进行Rb1基因的PCR基因分型。对在PCR反应体系中添加适量浓度(0.16 mg/mL)的BSA与不加BSA的PCR基因分型结果相比较。PCR引物序列涵盖Rb1基因外显子19两侧或3'端的LoxP序列。结果反应体系中添加BSA后,可成功获得PCR扩增条带:单一650 bp或247 bp(野生型)、单一700bp或295 bp(floxed Rb1基因纯合型)以及650 bp和700 bp(或247 bp和295 bp)混合条带(floxed Rb1基因杂合型),而反应体系中未加BSA的则无PCR扩增条带产生。结论 BSA可显著提高floxed Rb1基因的扩增效率,增加了该基因杂合子和纯合子的检出率并排除了假阴性结果,对于难以扩增的靶基因序列的PCR基因分型具有借鉴意义。

利用锌指基序的保守性从人脑组织分离新的C_2H_2型锌指蛋白基因表达序列

本文利用锌指基序的保守性设计引物,在低严谨条件下扩增人基因组总DNA,获得8个长度呈梯度的PCR扩增产物电泳条带。取其中第2和第3电泳条带,回收DNA片段并将它们克隆,经测序和查新比较,共获得60个含有锌指蛋白基因基序的单一的序列,其中23个为新的锌指蛋白基因DNA片段。以它们为探针,杂交筛选人脑组织cDNA文库,得到初筛cD-NA克隆44个。对其中28个初筛cDNA克隆进行复筛之后,得到20个cDNA单克隆。对这些阳性克隆进行测序,读出18个含有锌指蛋白基因基序的序列,国际联网查新之后,证明其中16个是新的锌指蛋白基因片段。这些新的锌指蛋白基因片段为今后克隆有意义的全长锌指蛋白cDNA提供了重要的实验材料。

人C2H2型锌指蛋白基因ZNF194全长cDNA的克隆

用一个含有锌指编码序列的人cDNA片段(L2～9)作为探针杂交筛选人肝组织cDNA分子库,得到8个杂交阳性克隆,经测序和拼接后,将其整合为一条长1838bp的cDNA序列.该序列的221～1642bp为一个完整的开放阅读框,编码了一个由473个氨基酸组成的蛋白质,1～220 bp为5’-UTR,1643～1838 bp为3’-UTR,在1801～1806bp有一个加尾信号序列AATAAA,3’端为18 bp的polyA.编码蛋白质已被HGMW命名为ZNF194.全长cDNA在GenBank登录为No.U95044.ZNF194蛋白的N端有一个KRAB-A box,C端含10个C_2H_2型锌指结构.该基因呈泛在性表达,经用FISH方法定位,结果显示它位于染色体19q13.3～13.

人类“锌指”蛋白基因ZNF191 cDNA的分离与克隆

“锌指”蛋白是一类调控基因表达的转录因子,它们与特定的DNA序列(如启动子)结合而激活或抑制基因的转录;还能与单链DNA和RNA结合,或与有关蛋白质相互作用参与细胞分化,配子形成以及胚胎发育.近年来,人们还发现“锌指”蛋白基因突变与多种恶性肿瘤的发生密切相关.例如,易位突变的人体锌指基因WT-1和LAZ3可分别导致Wilm氏瘤和淋巴癌的发生;陈竺等发现染色体易位点上t(11;17)的一个“锌指”基因PLZF与维甲酸受体a基因RARa的融合导致急性早幼粒细胞性白血病.因此,分离和克隆新的锌指基因并探讨其生物学功能是十分有意义的课题.本文报道克隆一个新的人“锌指”蛋白cDNA.它在GenBank数据库的注册号是U68536,国际HGMW命名委员会将其命名为ZNF191基因.

强直性肌营养不良症的分子遗传学研究进展

强直性肌营养不良症(myotonic dystrophy,DM)是一种常染色体显性遗传性神经肌肉疾病,发病率1/8000～1/20000,为最常见的累及成人的肌营养不良症。近年来的分子遗传学研究表明,19号染色体上的一蛋白激酶基因为本病的候选基因,且三联体(CTG)。拷贝数的增加与本病的发生有关。本文就最近几年有关DM的分子遗传学研究进展与本病的临床联系及有关DM的产前或症状前诊断等问题作一综述。

TAP63γ基因调节Col10a1基因表达及软骨细胞分化成熟

目的拟应用两种软骨细胞模型MCT和ATDC5细胞阐明TAP63γ基因如何调节十型胶原蛋白基因(Col10a1)基因表达及软骨细胞分化、成熟。方法应用荧光定量聚合酶链反应(PCR)技术检测TAP63γ基因和Col10a1基因分别在增殖/肥大状态下小鼠MCT细胞和ATDC5细胞中的表达。应用基因转染,在MCT细胞和ATDC5细胞中过表达或抑制TAP63γ基因的表达,以研究其对Col10a1基因表达的调控作用。在细胞诱导培养的第4、7、14、21天,用阿尔新蓝染色、碱性磷酸酶染色和茜素红染色分别对稳定转染TAP63γ表达质粒的目的组和转染空载体pCMV的对照组及未转染的空白组进行染色,统计分析阳性染色面积,从而确定过表达TAP63γ基因在软骨细胞骨化期间给软骨内成骨所带来的影响。结果与增殖型软骨细胞比较,TAP63γ基因与Col10a1基因在MCT和ATDC5两种肥大型软骨细胞的相对表达量都明显升高(P<0.05)。在MCT细胞和ATDC5细胞中抑制TAP63γ基因的表达,结果导致Col10a1基因的相对表达量明显降低,而过表达TAP63γ基因则明显升高Col10a1基因的相对表达量。阿尔新蓝染色在诱导培养的第7天显示出最强的染色强度,但目的组与对照组没有明显差异;在诱导培养的第21天,碱性磷酸酶染色目的组比对照组显示出更强的染色强度,茜素红染色未见差异。结论TAP63γ基因与两种软骨细胞模型MCT和ATDC5细胞中Col10a1基因的表达一致,TAP63γ基因促进软骨细胞的成熟分化。TAP63γ基因可能与多种转录因子一起构成调节Col10a1基因表达的新型机制进而影响骨骼发育与疾病中软骨细胞成熟的进程。

针灸推拿联合康复训练治疗脑梗死偏瘫的临床研究

目的探讨针灸推拿联合康复训练治疗脑梗死偏瘫患者的临床效果。方法 50例脑梗死偏瘫患者,按治疗方法不同分为观察组和对照组,各25例。对照组患者在常规治疗基础上给予康复训练辅助治疗,观察组患者在常规治疗基础上给予针灸推拿联合康复训练辅助治疗。观察并比较两组的治疗效果。结果治疗4周后两组患者美国国立卫生研究院的卒中量表(NIHSS)评分均明显下降,观察组下降幅度明显优于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);观察组患者治疗总有效率明显高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论针灸推拿联合康复训练治疗脑梗死偏瘫疗效显著,可有效提高患者的生活质量。

93例缺血性脑血管病心电图分析

缺血性脑卒中患者急性期心电图（ＥＣＧ）异常较为多见。本文收集我院１９８９年～１９９６年有完整ＥＣＧ记录的血性脑血管病９３例，现分析如下：１一般资料９３例中，男６４例，女２９例，年龄４０～８４岁，平均年龄（６２．５±２．３）岁。脑血栓形成８５例，其中脑...

URI在胃癌组织的表达及对顺铂诱导的胃癌细胞凋亡的影响

目的:探讨癌蛋白非经典前折叠素RPB5相互作用因子(unconventional prefoldin RPB5 interactor,URI)在胃癌组织中的表达及其临床意义,分析URI对顺铂诱导的胃癌细胞凋亡的影响。方法:采用免疫组化辣根过氧化物酶法检测胃癌组织芯片中URI的表达,并分析其与临床特征的相关性;体外培养胃癌MGC-803细胞和SGC-7901细胞,运用Hiperfect转染试剂分别在两类胃癌细胞株中转染URI siRNA片段构建URI基因敲低细胞株,并用荧光定量PCR和蛋白质印迹法验证敲低效果;将细胞分为空白组、siRNA URI干扰组以及顺铂诱导下的未转染组、无关序列组和siRNA URI干扰组,采用流式细胞术检测各组细胞凋亡情况。结果:胃癌组织芯片检测结果显示,胃癌组织胞质中URI的表达量显著高于癌旁组织(P<0.05),胞核中URI的表达量虽比癌旁组织增高,但无显著性差异。URI的表达量与胃癌患者生存期、临床分期等无显著相关性。URI基因敲低后两类细胞株顺铂诱导的凋亡率均显著增加(P<0.01)。结论:URI可能作为一种凋亡抑制因子在胃癌的发生中起作用。

人类实体瘤的染色体分析—三个争议的问题

人类恶性肿瘤染色体变化的非随机性已得到很好地确认,在5345例癌细胞的细胞遗传学显带研究中,揭示610例具单纯的数目改变,76例具单纯结构重排。染色体多余或丢失明显具非随机性:8、9、12和21号染色体常以三体出现,而最常丢失的染色体是7、22和 Y 染色体。断裂点仅局限在标准核型所有可显带的1/4之内。

第一届欧州人类实体瘤细胞与分子遗传学专业会议——1988年10月13～15日于法国

自从细胞遗传学开始应用于癌症的研究以来,实体瘤中频繁复杂的染色体变化就一直受到人们的重视。短期培养技术和染色体制备技术的改进,分子研究的进展和研究恶性血液系疾病所获得的结果使得细胞遗传学和分子学方法结合起来,促进了对实体瘤的研究。第一届欧州会议关于人类实体瘤的细胞和分子遗传学的研究资料支持这一进展。