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基于网络药理学分析生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
1
作者
郑方卉
赵磊
左韬
《中医临床研究》
2023年第5期35-41,共7页
目的:通过网络药理学研究方法探讨生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:通过中药药理数据库和分析平台(TCMSP)检索药物的活性成分和靶点;在GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索糖尿病视...
目的:通过网络药理学研究方法探讨生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:通过中药药理数据库和分析平台(TCMSP)检索药物的活性成分和靶点;在GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变相关靶点;利用Venny工具找出疾病与药物的交集靶点;通过Sting数据库对交集靶点进行分析;结果导入Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑异构分析;筛选出核心靶点并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图。将交集靶点录入Metascape进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,得到潜在作用通路。结果:(1)药物活性成分及靶点:通过TCMSP数据库筛选出生蒲黄-墨旱莲活性成分17个、作用靶点222个。(2)疾病靶点:经GeneCards、DrugBank、OMIM数据库筛选去重后获得相关的疾病靶点4005个,将药物靶点与疾病靶点交集后共获得108个共有靶点。(3)核心靶点:通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)A、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)等。(4)KEGG和GO富集分析:GO富集分析确定了1772个条目(P<0.01),KEGG通路富集筛选得到195条信号通路(P<0.01),主要有肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1α信号通路、癌症信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(AGE Receptor,RAGE)信号通路、VEGF信号通路等。结论:生蒲黄-墨旱莲治疗DR的作用机制可能与抗炎、抗氧化、抑制新生血管生成等作用有关。
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关键词
生蒲黄
墨旱莲
糖尿病视网膜病变
网络药理学
靶点预测
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职称材料
题名
基于网络药理学分析生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
1
作者
郑方卉
赵磊
左韬
机构
辽宁中医药大学
辽宁中医药大学附属第二医院
出处
《中医临床研究》
2023年第5期35-41,共7页
文摘
目的:通过网络药理学研究方法探讨生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变(Diabetic retinopathy,DR)的作用机制。方法:通过中药药理数据库和分析平台(TCMSP)检索药物的活性成分和靶点;在GeneCards、DrugBank和OMIM数据库检索糖尿病视网膜病变相关靶点;利用Venny工具找出疾病与药物的交集靶点;通过Sting数据库对交集靶点进行分析;结果导入Cytoscape 3.9.1软件进行拓扑异构分析;筛选出核心靶点并绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图。将交集靶点录入Metascape进行基因本体论(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,得到潜在作用通路。结果:(1)药物活性成分及靶点:通过TCMSP数据库筛选出生蒲黄-墨旱莲活性成分17个、作用靶点222个。(2)疾病靶点:经GeneCards、DrugBank、OMIM数据库筛选去重后获得相关的疾病靶点4005个,将药物靶点与疾病靶点交集后共获得108个共有靶点。(3)核心靶点:通过Cytoscape 3.9.1软件筛选出核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)A、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β)等。(4)KEGG和GO富集分析:GO富集分析确定了1772个条目(P<0.01),KEGG通路富集筛选得到195条信号通路(P<0.01),主要有肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、缺氧诱导因子(Hypoxia-inducible Factor,HIF)-1α信号通路、癌症信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End Products,AGE)-晚期糖基化终末产物受体(AGE Receptor,RAGE)信号通路、VEGF信号通路等。结论:生蒲黄-墨旱莲治疗DR的作用机制可能与抗炎、抗氧化、抑制新生血管生成等作用有关。
关键词
生蒲黄
墨旱莲
糖尿病视网膜病变
网络药理学
靶点预测
Keywords
Sheng Puhuang
Mohanlian
Diabetic retinopathy
Network pharmacology
Target prediction
分类号
R587.1 [医药卫生—内分泌]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于网络药理学分析生蒲黄-墨旱莲药对治疗糖尿病视网膜病变的作用机制
郑方卉
赵磊
左韬
《中医临床研究》
2023
0
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引证文献
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