基于4个线粒体基因的不同海拔高原林蛙群体遗传多样性研究

高原林蛙Rana kukunoris是中国特有的两栖动物,分布于青藏高原海拔2 000~4 400 m的湿润环境。为探究青藏高原的高原林蛙遗传多样性,将4个线粒体基因(COⅠ、cyt b、12S rRNA和16S rRNA)序列合并成联合数据集,对采自青海省4个海拔梯度(2 000 m、2 600 m、3 200 m和3 800 m)的100只高原林蛙个体进行测序分析。结果表明,2 000 m和2 600 m的高原林蛙群体的多态位点、单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数高于3 200 m和3 800 m群体;4个群体均出现了高单倍型多样性、低核苷酸多样性的结果。高原林蛙遗传分化主要发生在群体间,中性检验和错配分析表明,高原林蛙群体可能没有经历扩张事件。cyt b基因在2 600 m、3 200 m和3 800 m群体都检测到了正选择位点。综上所述,2 000 m和2 600 m的高原林蛙群体遗传多样性高于3 200 m和3 800 m群体,4个海拔群体的遗传分化程度较高;cyt b基因可能对高原林蛙适应高海拔环境起到了积极作用。本研究可为理解高原林蛙适应高原环境及其保护提供参考。

同域分布的饰纹姬蛙蝌蚪和泽陆蛙蝌蚪的肝脏转录组比较分析

饰纹姬蛙(Microhyla fissipes)蝌蚪和泽陆蛙(Fejervarya multistriata)蝌蚪是南方常见的无尾两栖类,两者同域分布,但在体型和发育分期上差异较大。为深度挖掘两者的肝脏功能基因和物种共存的内在机制,本研究通过Illumina Hiseq平台对发育到38期的饰纹姬蛙蝌蚪和泽陆蛙蝌蚪肝脏进行转录组测序。基因表达差异分析显示,泽陆蛙蝌蚪和饰纹姬蛙蝌蚪肝脏组织中存在3202个差异基因。相较于饰纹姬蛙蝌蚪,泽陆蛙蝌蚪肝脏中1635个Unigenes上调、1567个下调。具体而言,与泽陆蛙蝌蚪相比,在饰纹姬蛙蝌蚪肝脏中编码抗氧化酶和热休克蛋白以及与热应激相关的基因表达均升高,推测两种蝌蚪可能通过热生态位分离,从而有效减轻或避免有限资源下的种间竞争。本研究为探讨同域分布的不同物种之间的共存机制提供重要的参考依据。