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幽门螺杆菌cgt基因表达量测定活菌的方法建立及应用研究
1
作者
唐智慧
符立发
+8 位作者
张焱荣
周博彦
冯天勤
杨文娟
梁鸽
严茜雅
郑璨璘
别明江
王保宁
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1316-1321,共6页
目的本研究旨在建立一种通过幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)cgt基因表达量来检测活菌的方法,以便为临床精准治疗开发快速、便捷的检测手段。方法通过培养法对活菌计数,并利用RT-qPCR方法测定相应H.pylori胆固醇-α-葡萄糖基...
目的本研究旨在建立一种通过幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)cgt基因表达量来检测活菌的方法,以便为临床精准治疗开发快速、便捷的检测手段。方法通过培养法对活菌计数,并利用RT-qPCR方法测定相应H.pylori胆固醇-α-葡萄糖基转移酶(cholesterol-α-glucosyltransferase,CGT)保守编码基因cgt(hp0421)的mRNA表达水平,分析菌落数与cgt基因表达量之间的相关性,并构建回归方程;探索该方法可测定的线性范围、灵敏度和特异性。将此方法用于测定克拉霉素杀菌作用,验证其在细菌耐药检测中有效性。结果H.pylori菌落数为10^(2)、10^(4)、10^(6)、10^(8) CFU/mL的cgt的Ct值分别是29.67±0.14、23.37±0.36、17.65±0.37、11.38±0.39,在H.pylori菌落数为10^(1)~10^(8) CFU/mL范围内,RT-qPCR法测定的cgt基因表达量和活菌数对应的回归方程:y=-0.3501x+12.49,决定系数R2=0.9992、灵敏度为10^(1) CFU/mL,此方法与13种其他菌无交叉反应。用0、5、10、20、40μg/mL质量浓度的克拉霉素作用12 h后培养法测定H.pylori的活菌lg值分别为2.57±0.02、2.45±0.01、2.19±0.02、1.91±0.07、1.33±0.05,对应cgt基因的Ct值分别为27.76±0.09、28.37±0.24、29.51±0.14、30.11±0.12、31.66±0.11,将cgt基因表达量代入上述方程推算活菌数为2.73±0.03、2.52±0.08、2.11±0.05、1.89±0.02、1.33±0.04,经分析差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究成功建立了通过测定H.pylori的cgt基因表达量反映活菌的方法,有效缩短了检测周期,为临床活菌检测提供了新方法。
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关键词
幽门螺杆菌
cgt基因
基因表达量
活菌测定
原文传递
题名
幽门螺杆菌cgt基因表达量测定活菌的方法建立及应用研究
1
作者
唐智慧
符立发
张焱荣
周博彦
冯天勤
杨文娟
梁鸽
严茜雅
郑璨璘
别明江
王保宁
机构
四川大学华西基础医学与法医学院
四川大学华西临床医学院
四川大学华西公共卫生学院/四川大学华西第四医院
四川大学学报(医学版)编辑部
出处
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1316-1321,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.82260402)
西藏自治区科技厅基金项目(No.XZ202201ZY0009N)
四川省科技厅基金项目(No.2023YFQ0051、No.2024YFFK0224)资助。
文摘
目的本研究旨在建立一种通过幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)cgt基因表达量来检测活菌的方法,以便为临床精准治疗开发快速、便捷的检测手段。方法通过培养法对活菌计数,并利用RT-qPCR方法测定相应H.pylori胆固醇-α-葡萄糖基转移酶(cholesterol-α-glucosyltransferase,CGT)保守编码基因cgt(hp0421)的mRNA表达水平,分析菌落数与cgt基因表达量之间的相关性,并构建回归方程;探索该方法可测定的线性范围、灵敏度和特异性。将此方法用于测定克拉霉素杀菌作用,验证其在细菌耐药检测中有效性。结果H.pylori菌落数为10^(2)、10^(4)、10^(6)、10^(8) CFU/mL的cgt的Ct值分别是29.67±0.14、23.37±0.36、17.65±0.37、11.38±0.39,在H.pylori菌落数为10^(1)~10^(8) CFU/mL范围内,RT-qPCR法测定的cgt基因表达量和活菌数对应的回归方程:y=-0.3501x+12.49,决定系数R2=0.9992、灵敏度为10^(1) CFU/mL,此方法与13种其他菌无交叉反应。用0、5、10、20、40μg/mL质量浓度的克拉霉素作用12 h后培养法测定H.pylori的活菌lg值分别为2.57±0.02、2.45±0.01、2.19±0.02、1.91±0.07、1.33±0.05,对应cgt基因的Ct值分别为27.76±0.09、28.37±0.24、29.51±0.14、30.11±0.12、31.66±0.11,将cgt基因表达量代入上述方程推算活菌数为2.73±0.03、2.52±0.08、2.11±0.05、1.89±0.02、1.33±0.04,经分析差异无统计学意义(P>0.05)。结论本研究成功建立了通过测定H.pylori的cgt基因表达量反映活菌的方法,有效缩短了检测周期,为临床活菌检测提供了新方法。
关键词
幽门螺杆菌
cgt基因
基因表达量
活菌测定
Keywords
Helicobacter pylori
cgt gene
Gene expression level
Viable bacteria assay
分类号
R446.5 [医药卫生—诊断学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
幽门螺杆菌cgt基因表达量测定活菌的方法建立及应用研究
唐智慧
符立发
张焱荣
周博彦
冯天勤
杨文娟
梁鸽
严茜雅
郑璨璘
别明江
王保宁
《四川大学学报(医学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2024
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