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基于SSR-HRM技术的4种药用天麻变型遗传多样性及遗传结构分析
1
作者
张俊
于涵
+6 位作者
李召辉
邓佳乐
强萌
郑钰宁
张兴国
陈蓉
吕光华
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2898-2906,共9页
目的比较乌天麻Gastrodia elata f.glauca、绿天麻G.elata f.viridis、红天麻G.elata f.elata和黄天麻G.elata f.flavida 4种药用天麻变型的遗传多样性、遗传结构和遗传信息差异,为天麻新品种选育提供依据。方法从不同产地收集了40份不...
目的比较乌天麻Gastrodia elata f.glauca、绿天麻G.elata f.viridis、红天麻G.elata f.elata和黄天麻G.elata f.flavida 4种药用天麻变型的遗传多样性、遗传结构和遗传信息差异,为天麻新品种选育提供依据。方法从不同产地收集了40份不同天麻变型的花茎。应用简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记与高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)相结合技术,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,从80对引物中筛选出15对多态性高的SSR引物。对这些天麻花茎样品进行实时荧光定量PCR扩增,统计遗传多样性参数,分析群体遗传结构,结合40份天麻的HRM数据进行聚类分析。结果从15对SSR引物检测到114个等位基因,平均每对引物7.6个。天麻样品的观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(expected heterozygosity,He)、和Nei’s多样性指数(Nei's diversity index,Nei)的平均值分别为0.9813、0.8019和0.8121,表明天麻的遗传多样性丰富。这4种天麻变型的遗传多样性不同,从高到低依次为乌天麻、绿天麻、红天麻和黄天麻。SSR-HRM分析将这40份天麻样品分为4个基因型,各天麻变型的大多数样品分布在不同的基因型中。这4种天麻变型之间的遗传距离不同,乌天麻与绿天麻遗传距离最近,与黄天麻遗传距离最远。结论SSR-HRM技术对天麻基因分型更准确。这4种天麻变型的遗传信息不同,但存在基因交流现象。乌天麻与绿天麻亲缘关系最近,与红天麻次之,与黄天麻亲缘关系最远。可利用不同天麻变型遗传信息差异进行新品种选育。
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关键词
天麻
乌天麻
绿天麻
红天麻
黄天麻
变型
SSR
HRM
遗传多样性
遗传结构
亲缘关系
原文传递
DESI-MSI和UPLC分析芍药根不同组织药效成分的分布
被引量:
4
2
作者
陈文静
郑钰宁
+6 位作者
赵琳
宋尚红
龙飞
裴照卿
唐策
许志刚
吕光华
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第16期4333-4340,共8页
中药白芍和赤芍均以根粗为佳,质量评价指标成分同为芍药苷,但是药效成分含量高低与根粗细之间的相关性不明确。为此,该研究以白芍和赤芍的基原植物芍药根为对象,研究不同组织中芍药苷等7种药效成分的分布及其含量,从木部与皮部的比例,...
中药白芍和赤芍均以根粗为佳,质量评价指标成分同为芍药苷,但是药效成分含量高低与根粗细之间的相关性不明确。为此,该研究以白芍和赤芍的基原植物芍药根为对象,研究不同组织中芍药苷等7种药效成分的分布及其含量,从木部与皮部的比例,分析根粗细与药效成分含量的相关性,选择质量评价的指标成分。从白芍道地产区采集了9份芍药鲜根,先用解吸电喷雾电离质谱成像(DESI-MSI)观察各成分在横切面上各组织中的分布,再用UPLC测定这些成分在木部和皮部的含量,并用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)选出木部与皮部之间差异最大的成分。结果表明,芍药苷、苯甲酰芍药苷、氧化芍药苷、没食子酸和1,2,3,4,6-五没食子酰葡萄糖在木部分布多,含量高;而芍药内酯苷和儿茶素则在皮部分布多,含量高。芍药苷和芍药内酯苷是木部与皮部之间含量差异最大的成分,也是在这2个部位中含量最高的成分;根直径越粗,芍药苷的含量越高,而芍药内酯苷的含量越低。芍药苷与芍药内酯苷为同分异构体,药效作用各有侧重,可根据白芍、赤芍的不同用途,选择不同的指标成分,实行同药异用的质量分类评价。
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关键词
芍药
根
药效成分
分布
含量测定
解吸电喷雾电离质谱成像
超高效液相色谱法
原文传递
题名
基于SSR-HRM技术的4种药用天麻变型遗传多样性及遗传结构分析
1
作者
张俊
于涵
李召辉
邓佳乐
强萌
郑钰宁
张兴国
陈蓉
吕光华
机构
成都中医药大学药学院
西南交通大学中药研究所
成都中医药大学民族医药学院
出处
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第9期2898-2906,共9页
基金
国家自然科学基金项目(82274056)
四川省科技计划项目(2021YFYZ0012)。
文摘
目的比较乌天麻Gastrodia elata f.glauca、绿天麻G.elata f.viridis、红天麻G.elata f.elata和黄天麻G.elata f.flavida 4种药用天麻变型的遗传多样性、遗传结构和遗传信息差异,为天麻新品种选育提供依据。方法从不同产地收集了40份不同天麻变型的花茎。应用简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记与高分辨率熔解曲线(high-resolution melting,HRM)相结合技术,通过聚丙烯酰胺凝胶电泳,从80对引物中筛选出15对多态性高的SSR引物。对这些天麻花茎样品进行实时荧光定量PCR扩增,统计遗传多样性参数,分析群体遗传结构,结合40份天麻的HRM数据进行聚类分析。结果从15对SSR引物检测到114个等位基因,平均每对引物7.6个。天麻样品的观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(expected heterozygosity,He)、和Nei’s多样性指数(Nei's diversity index,Nei)的平均值分别为0.9813、0.8019和0.8121,表明天麻的遗传多样性丰富。这4种天麻变型的遗传多样性不同,从高到低依次为乌天麻、绿天麻、红天麻和黄天麻。SSR-HRM分析将这40份天麻样品分为4个基因型,各天麻变型的大多数样品分布在不同的基因型中。这4种天麻变型之间的遗传距离不同,乌天麻与绿天麻遗传距离最近,与黄天麻遗传距离最远。结论SSR-HRM技术对天麻基因分型更准确。这4种天麻变型的遗传信息不同,但存在基因交流现象。乌天麻与绿天麻亲缘关系最近,与红天麻次之,与黄天麻亲缘关系最远。可利用不同天麻变型遗传信息差异进行新品种选育。
关键词
天麻
乌天麻
绿天麻
红天麻
黄天麻
变型
SSR
HRM
遗传多样性
遗传结构
亲缘关系
Keywords
Gastrodia elata Bl.
G.elata Bl.f.glauca S.Chow
G.elata Bl.f.viridis Makino
G.elata Bl.f.elata S.Chow
G.elata Bl.f.flavida S.Chow
variant
simple sequence repeat
high-resolution melting
genetic diversity
genetic structure
relationship
分类号
R286.12 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
DESI-MSI和UPLC分析芍药根不同组织药效成分的分布
被引量:
4
2
作者
陈文静
郑钰宁
赵琳
宋尚红
龙飞
裴照卿
唐策
许志刚
吕光华
机构
成都中医药大学药学院
成都中医药大学民族医药学院
成都中医药大学中医药创新研究院
中江县万生农业科技有限责任公司
出处
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第16期4333-4340,共8页
基金
四川省科技计划项目(2016NFP0046)
四川高校科研创新团队建设计划项目(18TD0017)。
文摘
中药白芍和赤芍均以根粗为佳,质量评价指标成分同为芍药苷,但是药效成分含量高低与根粗细之间的相关性不明确。为此,该研究以白芍和赤芍的基原植物芍药根为对象,研究不同组织中芍药苷等7种药效成分的分布及其含量,从木部与皮部的比例,分析根粗细与药效成分含量的相关性,选择质量评价的指标成分。从白芍道地产区采集了9份芍药鲜根,先用解吸电喷雾电离质谱成像(DESI-MSI)观察各成分在横切面上各组织中的分布,再用UPLC测定这些成分在木部和皮部的含量,并用正交偏最小二乘判别分析(OPLS-DA)选出木部与皮部之间差异最大的成分。结果表明,芍药苷、苯甲酰芍药苷、氧化芍药苷、没食子酸和1,2,3,4,6-五没食子酰葡萄糖在木部分布多,含量高;而芍药内酯苷和儿茶素则在皮部分布多,含量高。芍药苷和芍药内酯苷是木部与皮部之间含量差异最大的成分,也是在这2个部位中含量最高的成分;根直径越粗,芍药苷的含量越高,而芍药内酯苷的含量越低。芍药苷与芍药内酯苷为同分异构体,药效作用各有侧重,可根据白芍、赤芍的不同用途,选择不同的指标成分,实行同药异用的质量分类评价。
关键词
芍药
根
药效成分
分布
含量测定
解吸电喷雾电离质谱成像
超高效液相色谱法
Keywords
Paeonia lactiflora
root
bioactive compound
distribution
content determination
DESI-MSI
UPLC
分类号
R284.1 [医药卫生—中药学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于SSR-HRM技术的4种药用天麻变型遗传多样性及遗传结构分析
张俊
于涵
李召辉
邓佳乐
强萌
郑钰宁
张兴国
陈蓉
吕光华
《中草药》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
2
DESI-MSI和UPLC分析芍药根不同组织药效成分的分布
陈文静
郑钰宁
赵琳
宋尚红
龙飞
裴照卿
唐策
许志刚
吕光华
《中国中药杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2022
4
原文传递
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