XIP木聚糖酶抑制蛋白对不同家族木聚糖酶的抑制作用

研究利用毕赤酵母GS115表达的小麦木聚糖酶抑制蛋白,探索了该XIP抑制蛋白对GH10和GH11家族木聚糖酶的抑制作用。结果显示,该抑制蛋白分子量约为37 k Da,高于氨基酸序列计算所得分子量30.2 k Da,可能是由于该蛋白发生了糖基化作用。该蛋白分别作用于黑曲霉GH10木聚糖酶和哈茨木霉GH11木聚糖酶,得到最适抑制比例分别为1.2??1和8??1,最适抑制时间分别是50 min和30 min,最适抑制p H值均为6.0,最适作用温度均是40℃。

DNA信息存储中关键生化方法的研究

随着生物技术特别是高通量的DNA合成和测序技术的发展,DNA信息存储技术在存储容量、稳定性以及可重复读取等方面都取得了重大成就。但目前携带有数据信息的大规模寡核苷酸文库的生化技术的操纵仍面临着巨大的挑战,比如合成、扩增、保存或测序过程引起的寡核苷酸不均一性、DNA序列丢失、碱基突变、DNA分子的衰减等,这些因素限制了DNA信息存储走向实际工业化应用。本文从操纵大型寡核苷酸文库的生化技术角度出发,归纳总结了造成生化问题的原因以及为解决这些问题所开发的一系列方法,包括合成工艺的改进、寡核苷酸文库的均一化、多种DNA保存方法、变体PCR以及恒温扩增反应,论证了它们在DNA信息存储流程中避免上述生化问题的可行性与有效性,最后分析了现阶段DNA信息存储所面临的合成、长时间保存方法以及扩增等方面的挑战。本文旨在为实现对大型寡核苷酸文库的操纵奠定基础,以期促进DNA信息存储迈向实际应用。

额外的错配碱基提高T4 DNA连接酶等位特异性连接（英文）

连接是一种主要的DNA处理过程。由于较低的商业成本以及核酸底物识别的灵活性,T4DNA连接酶被广泛应用于生物分子工程,特别是特定核酸序列的等位特异性连接检测。本文评估了在T4 DNA连接酶介导的连接反应中,引入额外的错配碱基对所产生的影响。设计了超过150组DNA/DNA或DNA/RNA带有的额外错配碱基对的组合。结果发现,引入额外的错配碱基对后,T4 DNA连接酶在DNA/DNA连接中特异性可提高60倍以上,而在DNA/RNA连接中特异性只能提高2倍。在等位特异性连接中,有的错配碱基对可使T4 DNA连接酶的特异性提高600多倍。

基于单链DNA开关调控的多功能生物电路（英文）

合成生物电路在生物传感及生物计算方面成为了广泛应用的工具。工程化生物电路系统具有良好的灵活性,同时也具备模块化的特征。在本文中,研究了基于单链DNA开关调控的多功能生物电路的构建方法。通过将计算机辅助设计的单链DNA开关作为核心控制元件,并利用长度为20 bp的toehold区域来激活单链DNA开关,驱动了简单的单向式、循环式以及级联的多层次的生物电路系统。在级联式电路系统中,通过调整单链DNA开关的结构,使信噪比从2.996变成5.274。同时,单链DNA开关作为长单链DNA(784 bp)的一部分,在无细胞蛋白质系统中实现了基因表达调控。因此,本文研究的工程化方法为今后复杂的人工生物电路的构建提供了坚实的技术基础。