猪UCP2基因5′调控区和外显子1的遗传变异研究

解偶联蛋白家族(uncouplingproteins,UCPs)是线粒体内膜的转运蛋白,具有解离氧化磷酸化偶联的功能,对机体能量平衡涉及的体重(肥胖)、静止代谢率和食物转化效率等性状具有显著的影响.首次对猪UCP2基因外显子1及开放阅读框上游部分序列(-80～0)进行了多态性分析,通过PCR-SSCP发现猪群内存在3种单倍型,经测序分析发现存在3个SNPs位点,分别位于G-42A、C-50T和T-51C位点,这3个SNPs位点均是首次发现的.该研究表明,T-C-G紧密连锁,C-T-A突变也紧密连锁.利用转录因子在线分析软件TFSEARCH(ver1.3),对UCP2基因开放阅读框上游部分序列(-80～0)进行潜在转录因子结合位点预测,发现该片段中的碱基T→C(-51)、C→T(-50)和G→A(-42)突变,导致此处比野生型单倍型A(T-C-G碱基连锁)少了一个AML-1a转录因子结合位点.内江猪存在A、B和AB三种单倍型,而其他猪种仅有单倍型A,说明内江猪具有独特的种质特性.