为分析桦木科叶绿体基因组编码区密码子的使用特征,利用CodonW1.4.2、Origin、SPSS25.0、MEGA7.0软件和在线程序CUSP对50种桦木科植物叶绿体基因组密码子的偏好性及物种间的系统发育进行分析。结果表明,桦木科叶绿体基因组密码子适应指...为分析桦木科叶绿体基因组编码区密码子的使用特征,利用CodonW1.4.2、Origin、SPSS25.0、MEGA7.0软件和在线程序CUSP对50种桦木科植物叶绿体基因组密码子的偏好性及物种间的系统发育进行分析。结果表明,桦木科叶绿体基因组密码子适应指数(codon adaptation index,CAI)在0.163~0.166之间,平均0.165,有效密码子数(effective number of codon,ENC)范围在49.29~50.46之间,平均49.78,密码子偏好性弱。密码子不同位置的GC含量表现为GC1(45.4%)>GC2(37.4%)>GC3(29.7%),表明桦木科叶绿体密码子偏好于使用A/U结尾。ENC与密码子GC2、GC3及平均GC含量呈极显著正相关(P<0.01)。中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析表明,自然选择是桦木科叶绿体基因组密码子偏好性的主要影响因素。桦木科叶绿体基因组共有15个最优密码子,分别为CUC、CUG、AUC、GUC、GUG、GGG、UGC、CCA、ACG、GCC、CGA、CGG、CAG、GAG、AGG。基于同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)的聚类结果和基于matK基因序列构建的系统发育树在拓扑结构上具有相似性。以上研究结果为进一步对桦木科植物的资源利用、系统发育及叶绿体基因工程研究提供参考。展开更多
In this paper,we study the existence and local uniqueness of multi-peak solutions to the Kirchhoff type equations-(ε^(2)a+εb∫_(R^(3))|■u|^(2))△u+V(x)u=u^(p),u>0 in R^(3),which concentrate at non-degenerate cri...In this paper,we study the existence and local uniqueness of multi-peak solutions to the Kirchhoff type equations-(ε^(2)a+εb∫_(R^(3))|■u|^(2))△u+V(x)u=u^(p),u>0 in R^(3),which concentrate at non-degenerate critical points of the potential function V(x),where a,b>0,1<p<5 are constants,andε>0 is a parameter.Applying the Lyapunov-Schmidt reduction method and a local Pohozaev type identity,we establish the existence and local uniqueness results of multi-peak solutions,which concentrate at{a_(i)}1≤i≤k,where{a_(i)}1≤i≤k are non-degenerate critical points of V(x)asε→0.展开更多
文摘为分析桦木科叶绿体基因组编码区密码子的使用特征,利用CodonW1.4.2、Origin、SPSS25.0、MEGA7.0软件和在线程序CUSP对50种桦木科植物叶绿体基因组密码子的偏好性及物种间的系统发育进行分析。结果表明,桦木科叶绿体基因组密码子适应指数(codon adaptation index,CAI)在0.163~0.166之间,平均0.165,有效密码子数(effective number of codon,ENC)范围在49.29~50.46之间,平均49.78,密码子偏好性弱。密码子不同位置的GC含量表现为GC1(45.4%)>GC2(37.4%)>GC3(29.7%),表明桦木科叶绿体密码子偏好于使用A/U结尾。ENC与密码子GC2、GC3及平均GC含量呈极显著正相关(P<0.01)。中性绘图、ENC-plot和PR2-plot分析表明,自然选择是桦木科叶绿体基因组密码子偏好性的主要影响因素。桦木科叶绿体基因组共有15个最优密码子,分别为CUC、CUG、AUC、GUC、GUG、GGG、UGC、CCA、ACG、GCC、CGA、CGG、CAG、GAG、AGG。基于同义密码子相对使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)的聚类结果和基于matK基因序列构建的系统发育树在拓扑结构上具有相似性。以上研究结果为进一步对桦木科植物的资源利用、系统发育及叶绿体基因工程研究提供参考。
基金supported by the Natural Science Foundation of China(11771166,12071169)the Hubei Key Laboratory of Mathematical Sciences and Program for Changjiang Scholars and Innovative Research Team in University#IRT17R46。
文摘In this paper,we study the existence and local uniqueness of multi-peak solutions to the Kirchhoff type equations-(ε^(2)a+εb∫_(R^(3))|■u|^(2))△u+V(x)u=u^(p),u>0 in R^(3),which concentrate at non-degenerate critical points of the potential function V(x),where a,b>0,1<p<5 are constants,andε>0 is a parameter.Applying the Lyapunov-Schmidt reduction method and a local Pohozaev type identity,we establish the existence and local uniqueness results of multi-peak solutions,which concentrate at{a_(i)}1≤i≤k,where{a_(i)}1≤i≤k are non-degenerate critical points of V(x)asε→0.
