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福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶的晶体生长和初步晶体学研究(英文)
1
作者
刘永
鲁芳
+4 位作者
郭刚兴
冯舵
张蓓
高伟
毕汝昌
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期253-258,共6页
过氧化物酶是一类广泛存在于生物体内的抗氧化剂,清除有氧代谢过程中产生的活性氧,对于保护机体内的生物大分子有重要的生物学功能.福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶(SF2523)作为过氧化物酶家族的一员,通过清除福氏志贺菌体内的活性氧,在维...
过氧化物酶是一类广泛存在于生物体内的抗氧化剂,清除有氧代谢过程中产生的活性氧,对于保护机体内的生物大分子有重要的生物学功能.福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶(SF2523)作为过氧化物酶家族的一员,通过清除福氏志贺菌体内的活性氧,在维持其活性和致病性上起重要作用.目前,SF2523的三维结构还没有得到解析,其具体的功能机制也尚不清楚.为了得到SF2523蛋白的三维结构,进而了解具体的功能机制,实验获得了均一稳定的可溶蛋白,验证具有体外活性,培养出可用于X射线衍射的蛋白质晶体.在中国科学院高能物理研究所同步辐射装置收到晶体的衍射数据供结构解析使用.SF2523晶体属于空间群P2_12_12_1,晶胞参数为a=35.80,b=50.63,c=88.52,α=β=γ=90.00°,每个晶体学不对称单位含有1个蛋白质分子,马修斯系数为2.03~3/u,溶剂含量为39.56%.
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关键词
硫氧还蛋白过氧化物酶
活性氧
晶体
下载PDF
职称材料
叶绿体分裂蛋白PDV2表达和纯化
2
作者
郭刚兴
韩翠晓
+3 位作者
刘永
鲁芳
高宏波
高伟
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期1028-1034,共7页
叶绿体是植物光合作用的重要场所。PLASTID DIVISION2(PDV2)是叶绿体外膜上调控叶绿体分裂的关键蛋白之一。PDV2的N末端较大伸向细胞质,C末端较小伸向膜间隙,探索叶绿体分裂蛋白PDV2-213(N末端213氨基酸残基)胞质侧结构域可溶性表达获...
叶绿体是植物光合作用的重要场所。PLASTID DIVISION2(PDV2)是叶绿体外膜上调控叶绿体分裂的关键蛋白之一。PDV2的N末端较大伸向细胞质,C末端较小伸向膜间隙,探索叶绿体分裂蛋白PDV2-213(N末端213氨基酸残基)胞质侧结构域可溶性表达获得高纯度的蛋白质,为叶绿体分裂过程中其结构与功能的研究提供依据。通过pET表达载体的构建,优化原核表达条件,实现PDV2-213蛋白的可溶性表达;运用镍柱亲和层析和分子排阻层析的方法,对目的蛋白进行分离纯化。本研究可溶性表达了PDV2-213胞质侧结构域蛋白质,通过表达条件和镍柱亲和层析的优化,降低杂蛋白对PDV2-213蛋白质纯化过程的影响,获得高纯度的蛋白质。PDV2-213胞质侧结构域的高效可溶性表达和纯化,为叶绿体分裂过程中其结构与功能的研究提供依据。
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关键词
叶绿体分裂
PDV2胞质侧结构域
可溶性表达
蛋白纯化
原文传递
双功能域β-折叠桶碱性植酸酶蛋白序列分析与酶学特性
被引量:
2
3
作者
鲁芳
张蓓
+6 位作者
刘永
宋迎
郭刚兴
杨培龙
姚斌
郭素娟
高伟
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期1582-1592,共11页
【目的】表达、纯化来源于Bacillus sp.HJB17的双功能域β-折叠桶碱性植酸酶(phy HT),并对该酶进行蛋白序列以及酶学特征分析,为该酶的广泛应用奠定基础。【方法】应用生物信息学技术,对phy HT蛋白序列进行了生物信息学分析。表达、变...
【目的】表达、纯化来源于Bacillus sp.HJB17的双功能域β-折叠桶碱性植酸酶(phy HT),并对该酶进行蛋白序列以及酶学特征分析,为该酶的广泛应用奠定基础。【方法】应用生物信息学技术,对phy HT蛋白序列进行了生物信息学分析。表达、变复性、分离纯化得到具有酶活性的可溶性phy HT蛋白溶液,通过硫酸亚铁-钼蓝法对phy HT的酶学特性进行了研究。【结果】序列分析结果显示,phy HT由633个氨基酸组成,含有2个植酸酶结构域,属于典型的BPP植酸酶,相对分子量(MW)为69321.68 Da,理论等电点为5.37,为亲水性蛋白。二级结构中,phy HT中α-螺旋(helix)、β-片层(sheet)占主要的比例,高级结构以β片层形成的桶状结构为主。酶学性质研究表明,该酶的最适反应温度为35°C,在45°C以下比较稳定。最适的p H为8.0,在p H为6.0–12.0条件之间比较稳定。低浓度的Ca^(2+)以及Mg^(2+)对酶活性有促进作用,Fe^(2+)、Mn^(2+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、Ni^(2+)等金属离子对酶活性有抑制作用。【结论】本研究成功对phy HT进行了蛋白序列分析以及酶学性质研究,phy HT属于碱性植酸酶,酶活性高、稳定性好,在理论研究和工业生产方面均有很大应用价值。
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关键词
β-折叠桶碱性植酸酶
生物信息学分析
酶学特性
原文传递
题名
福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶的晶体生长和初步晶体学研究(英文)
1
作者
刘永
鲁芳
郭刚兴
冯舵
张蓓
高伟
毕汝昌
机构
北京林业大学理学院
北京林业大学林学院
中国科学院生物物理研究所
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期253-258,共6页
基金
supported by grants from The Fundamental Research Funds for the Central Universities(2015ZCQ-LY-02)
The National Natural Science Foundation of China(31070651)~~
文摘
过氧化物酶是一类广泛存在于生物体内的抗氧化剂,清除有氧代谢过程中产生的活性氧,对于保护机体内的生物大分子有重要的生物学功能.福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶(SF2523)作为过氧化物酶家族的一员,通过清除福氏志贺菌体内的活性氧,在维持其活性和致病性上起重要作用.目前,SF2523的三维结构还没有得到解析,其具体的功能机制也尚不清楚.为了得到SF2523蛋白的三维结构,进而了解具体的功能机制,实验获得了均一稳定的可溶蛋白,验证具有体外活性,培养出可用于X射线衍射的蛋白质晶体.在中国科学院高能物理研究所同步辐射装置收到晶体的衍射数据供结构解析使用.SF2523晶体属于空间群P2_12_12_1,晶胞参数为a=35.80,b=50.63,c=88.52,α=β=γ=90.00°,每个晶体学不对称单位含有1个蛋白质分子,马修斯系数为2.03~3/u,溶剂含量为39.56%.
关键词
硫氧还蛋白过氧化物酶
活性氧
晶体
Keywords
thioredoxin peroxidase, active oxygen, crystal
分类号
Q6 [生物学—生物物理学]
Q7 [生物学—分子生物学]
下载PDF
职称材料
题名
叶绿体分裂蛋白PDV2表达和纯化
2
作者
郭刚兴
韩翠晓
刘永
鲁芳
高宏波
高伟
机构
北京林业大学理学院
北京林业大学生物学院
出处
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第3期1028-1034,共7页
基金
中央高校基本科研基金(2015ZCQ-LY-02)
国家自然科学基金(31070651)共同资助
文摘
叶绿体是植物光合作用的重要场所。PLASTID DIVISION2(PDV2)是叶绿体外膜上调控叶绿体分裂的关键蛋白之一。PDV2的N末端较大伸向细胞质,C末端较小伸向膜间隙,探索叶绿体分裂蛋白PDV2-213(N末端213氨基酸残基)胞质侧结构域可溶性表达获得高纯度的蛋白质,为叶绿体分裂过程中其结构与功能的研究提供依据。通过pET表达载体的构建,优化原核表达条件,实现PDV2-213蛋白的可溶性表达;运用镍柱亲和层析和分子排阻层析的方法,对目的蛋白进行分离纯化。本研究可溶性表达了PDV2-213胞质侧结构域蛋白质,通过表达条件和镍柱亲和层析的优化,降低杂蛋白对PDV2-213蛋白质纯化过程的影响,获得高纯度的蛋白质。PDV2-213胞质侧结构域的高效可溶性表达和纯化,为叶绿体分裂过程中其结构与功能的研究提供依据。
关键词
叶绿体分裂
PDV2胞质侧结构域
可溶性表达
蛋白纯化
Keywords
Chloroplast division, Cytosolic region of PDV2, Soluble expression, Purification
分类号
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
双功能域β-折叠桶碱性植酸酶蛋白序列分析与酶学特性
被引量:
2
3
作者
鲁芳
张蓓
刘永
宋迎
郭刚兴
杨培龙
姚斌
郭素娟
高伟
机构
北京林业大学省部共建森林培育与保护教育部重点实验室
北京林业大学理学院
中国农业科学院饲料研究所
出处
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018年第9期1582-1592,共11页
基金
中央高校基本科研业务费专项资金(2018ZY18,2015ZCQ-LY-02)
国家自然科学基金(31070651)
文摘
【目的】表达、纯化来源于Bacillus sp.HJB17的双功能域β-折叠桶碱性植酸酶(phy HT),并对该酶进行蛋白序列以及酶学特征分析,为该酶的广泛应用奠定基础。【方法】应用生物信息学技术,对phy HT蛋白序列进行了生物信息学分析。表达、变复性、分离纯化得到具有酶活性的可溶性phy HT蛋白溶液,通过硫酸亚铁-钼蓝法对phy HT的酶学特性进行了研究。【结果】序列分析结果显示,phy HT由633个氨基酸组成,含有2个植酸酶结构域,属于典型的BPP植酸酶,相对分子量(MW)为69321.68 Da,理论等电点为5.37,为亲水性蛋白。二级结构中,phy HT中α-螺旋(helix)、β-片层(sheet)占主要的比例,高级结构以β片层形成的桶状结构为主。酶学性质研究表明,该酶的最适反应温度为35°C,在45°C以下比较稳定。最适的p H为8.0,在p H为6.0–12.0条件之间比较稳定。低浓度的Ca^(2+)以及Mg^(2+)对酶活性有促进作用,Fe^(2+)、Mn^(2+)、Zn^(2+)、Cu^(2+)、Ni^(2+)等金属离子对酶活性有抑制作用。【结论】本研究成功对phy HT进行了蛋白序列分析以及酶学性质研究,phy HT属于碱性植酸酶,酶活性高、稳定性好,在理论研究和工业生产方面均有很大应用价值。
关键词
β-折叠桶碱性植酸酶
生物信息学分析
酶学特性
Keywords
β-propeller alkaline phytases
bioinformatics analysis
enzyme properties
分类号
Q55 [生物学—生物化学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
福氏志贺菌硫氧还过氧化物酶的晶体生长和初步晶体学研究(英文)
刘永
鲁芳
郭刚兴
冯舵
张蓓
高伟
毕汝昌
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
下载PDF
职称材料
2
叶绿体分裂蛋白PDV2表达和纯化
郭刚兴
韩翠晓
刘永
鲁芳
高宏波
高伟
《基因组学与应用生物学》
CAS
CSCD
北大核心
2017
0
原文传递
3
双功能域β-折叠桶碱性植酸酶蛋白序列分析与酶学特性
鲁芳
张蓓
刘永
宋迎
郭刚兴
杨培龙
姚斌
郭素娟
高伟
《微生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2018
2
原文传递
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