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杏花鸡白细胞介素10(IL--10)基因的克隆及其表达分析
被引量:
2
1
作者
郭利金
陈小兰
+2 位作者
曹森
梁少东
聂庆华
《中国家禽》
北大核心
2019年第4期5-11,共7页
为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IE...
为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IEC、鸡巨噬细胞HD11和鸡成纤维细胞DF-1中IL-10基因的表达差异以及在不同肠道组织中IL-10的表达量差异。结果表明,完整地扩增了IL-10基因的完整CDS序列,发现了3个同义突变(162A>G、180T>C和303C>T)。构建的发育树表明杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与红色原鸡、鹌鹑、火鸡和珍珠鸡的同源性最高。IL-10在鸡肠上皮细胞的表达量最高,在盲肠扁桃体中表达量最高。球虫子孢子的入侵导致DF-1细胞和HD11细胞中的IL-10表达量升高。研究结果为IL-10基因在肠道免疫和抵抗球虫病的研究提供理论基础。
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关键词
鸡
IL-10
CDS全长
同源性
细胞表达差异
组织表达差异
下载PDF
职称材料
转录组测序揭示不同生长速度番鸭胸肌组织的基因表达差异
2
作者
张思雨
朱炜健
+4 位作者
季从亮
郭利金
郑茗
徐海平
聂庆华
《广东农业科学》
CAS
2020年第10期132-139,共8页
【目的】利用转录组测序技术分析不同生长速度番鸭的基因表达差异,挖掘影响番鸭生长性能的基因与信号通路,为阐明生长性能差异的遗传机制提供理论基础。【方法】选取不同生长速度两尾样番鸭的胸肌组织进行转录组测序,采用无参考基因组...
【目的】利用转录组测序技术分析不同生长速度番鸭的基因表达差异,挖掘影响番鸭生长性能的基因与信号通路,为阐明生长性能差异的遗传机制提供理论基础。【方法】选取不同生长速度两尾样番鸭的胸肌组织进行转录组测序,采用无参考基因组的分析手段对测序结果进行分析,获得差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。利用Blast2 GO软件对DEGs进行功能富集分析,利用KAAS网站进行DEGs的通路富集分析。【结果】转录组测序分析结果显示,快速生长型番鸭与缓慢生长型番鸭相比共有186个显著DEGs,其中49个表达量上调,137个表达量下调。这些DEGs主要富集在磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路和腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路。【结论】PI3K-AKT、MAPK、AMPK这3条信号通路是控制番鸭机体生长发育的重要调节信号通路。
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关键词
番鸭
转录组
生长性状
磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)
丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)
腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)
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职称材料
题名
杏花鸡白细胞介素10(IL--10)基因的克隆及其表达分析
被引量:
2
1
作者
郭利金
陈小兰
曹森
梁少东
聂庆华
机构
华南农业大学动物科学学院
农业部鸡遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《中国家禽》
北大核心
2019年第4期5-11,共7页
基金
国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目(31761143014)
文摘
为研究杏花鸡白细胞介素10(IL-10)基因在抵抗鸡球虫病中的作用,应用PCR、基因克隆和测序等技术获得杏花鸡完整的IL-10基因CDS序列,进行杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与其他物种间的同源性分析,比较在QM-7成肌细胞、鸡肠上皮细胞IEC、鸡巨噬细胞HD11和鸡成纤维细胞DF-1中IL-10基因的表达差异以及在不同肠道组织中IL-10的表达量差异。结果表明,完整地扩增了IL-10基因的完整CDS序列,发现了3个同义突变(162A>G、180T>C和303C>T)。构建的发育树表明杏花鸡IL-10基因CDS序列和核苷酸序列与红色原鸡、鹌鹑、火鸡和珍珠鸡的同源性最高。IL-10在鸡肠上皮细胞的表达量最高,在盲肠扁桃体中表达量最高。球虫子孢子的入侵导致DF-1细胞和HD11细胞中的IL-10表达量升高。研究结果为IL-10基因在肠道免疫和抵抗球虫病的研究提供理论基础。
关键词
鸡
IL-10
CDS全长
同源性
细胞表达差异
组织表达差异
Keywords
chicken
IL-10
complete CDS sequence
homology
cell expression difference
tissue expression difference
分类号
S831.2 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
转录组测序揭示不同生长速度番鸭胸肌组织的基因表达差异
2
作者
张思雨
朱炜健
季从亮
郭利金
郑茗
徐海平
聂庆华
机构
华南农业大学动物科学学院/农业农村部鸡遗传育种与繁殖重点实验室
温氏食品集团股份有限公司
出处
《广东农业科学》
CAS
2020年第10期132-139,共8页
基金
“广东特支计划”本土创新创业团队项目-畜禽种业自主创新团队(2019BT02N630)。
文摘
【目的】利用转录组测序技术分析不同生长速度番鸭的基因表达差异,挖掘影响番鸭生长性能的基因与信号通路,为阐明生长性能差异的遗传机制提供理论基础。【方法】选取不同生长速度两尾样番鸭的胸肌组织进行转录组测序,采用无参考基因组的分析手段对测序结果进行分析,获得差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)。利用Blast2 GO软件对DEGs进行功能富集分析,利用KAAS网站进行DEGs的通路富集分析。【结果】转录组测序分析结果显示,快速生长型番鸭与缓慢生长型番鸭相比共有186个显著DEGs,其中49个表达量上调,137个表达量下调。这些DEGs主要富集在磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路和腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)信号通路。【结论】PI3K-AKT、MAPK、AMPK这3条信号通路是控制番鸭机体生长发育的重要调节信号通路。
关键词
番鸭
转录组
生长性状
磷脂酰肌醇三激酶-丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-AKT)
丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)
腺苷酸激活蛋白激酶(AMPK)
Keywords
Muscovy duck
transcriptome
growth trait
phosphatidylinositol 3-kinase-serine/threonine kinase(PI3KAKT)
mitogen-activated protein kinase(MAPK)
adenylate-activated protein kinase(AMPK)
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
杏花鸡白细胞介素10(IL--10)基因的克隆及其表达分析
郭利金
陈小兰
曹森
梁少东
聂庆华
《中国家禽》
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
2
转录组测序揭示不同生长速度番鸭胸肌组织的基因表达差异
张思雨
朱炜健
季从亮
郭利金
郑茗
徐海平
聂庆华
《广东农业科学》
CAS
2020
0
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职称材料
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