青鱼生长QTL紧密连锁分子标记与生长性状的关联分析

研究对前期建立的青鱼(Mylopharyngodon piceus)家系高密度遗传连锁图谱及体长QTL的定位结果进行深入分析,在10号连锁群上识别到与体长相关的QTL区域,存在2个与体长强烈相关的紧密连锁SNP位点。研究利用特异性标记判定青鱼遗传性别,对SNP位点侧翼序列PCR扩增子进行sanger测序。得到准确的SNP位点基因型信息后,研究对紧密连锁SNP位点不同基因型与邗江青鱼群体生长性状进行了细致的关联分析。结果表明,在563尾邗江青鱼群体中,雌鱼290尾,雄鱼273尾,雌雄比约为1.06:1。遗传分析显示,SNP_(7957)G>C和SNP_(9802)T>A有效等位基因数(N_(e))分别为1.754和1.399,观测杂合度(H_(o))分别为0.384和0.266,期望杂合度(H_(e))分别为0.430和0.285,多态信息含量分别(PIC)为0.508和0.378。相比雄鱼,雌鱼生长速度更快,但是变异系数更高,说明雌鱼生长性状离散程度更大。SNP_(7957)G>C和SNP_(9802)T>A不同基因型在群体体长性状中存在显著差异。SNP_(7957)G>C位点的GG基因型在雄鱼体长性状中具有显著优势(P<0.05),SNP_(7957)G>C和SNP_(9802)T>A单标记其他基因型与生长性状之间存在差异,但未达到统计学差异。在SNP位点不同基因型构建的二倍型中,雌雄个体表现出一定的生长差异,D8(GGTA)在生长方面具有显著优势(P<0.05),具有一定育种价值。研究结果可为选育快速生长青鱼新品种提供分子标记,为未来青鱼遗传改良和分子标记辅助育种策略提供科学依据。

青鱼不同地理群体生长差异比较分析

为了评估青鱼(Mylopharyngodon piceus)不同群体的生长性能,对湖南湘江(XJ)、湖北石首(SS)、江苏邗江(HJ)的青鱼采用PIT标记和网箱同池混养法,比较三个不同地理群体生长差异性。通过单因素方差分析、相关性分析、多重比较分析不同青鱼群体间生长差异性和性状间的相关性。结果显示:三个群体中,HJ群体在增重率、增长率、生长指数等表现良好。XJ群体体重增重率以及生长指数都较低,表明XJ群体生长较为缓慢。SS群体在体重增重率上与HJ群体不具有显著性差异,但在体宽和体高上SS群体生长离散程度最大。性状相关性分析中,体长、体宽、体高与体重的相关系数也均达到极显著水平。综合以上研究,HJ群体的生长性能最好,可以作为良种选育的主要对象。

长江水系青鱼不同地理群体肉质差异比较

为了解长江水系青鱼不同地理群体肌肉营养品质的差异,用国标生化法测定了湖南湘江群体(XJ)、湖北石首群体(SS)、江苏邗江群体(HJ)青鱼肌肉的常规营养成分、氨基酸和脂肪酸的含量,并按FAO/WHO建议的标准进行了营养品质评价。结果显示:3个群体青鱼肌肉的水分质量分数为81.08%~82.20%,粗蛋白质质量分数为16.86%~17.94%,粗脂肪质量分数为0.46%~0.52%,粗灰分质量分数为1.26%~1.34%,3个群体间常规营养成分无显著性差异(P>0.05);在3个群体青鱼的肌肉中均检测出16种氨基酸,其中人体必需氨基酸7种,半必需氨基酸2种,非必需氨基酸7种,必需氨基酸占总氨基酸的39.24%~40.22%,鲜味氨基酸占总氨基酸的38.54%~39.37%;在脂肪酸组成和含量上,石首群体、邗江群体中均检测到18种脂肪酸,其中饱和脂肪酸9种,单不饱和脂肪酸3种,多不饱和脂肪酸6种,以上两个群体的脂肪酸组成种类均多于湘江群体,邗江群体在饱和脂肪酸总量和多不饱和脂肪酸总量上均显著高于石首群体和湘江群体(P<0.05),而在单不饱和脂肪酸总量上,3个群体间差异不显著(P>0.05),3个群体都含有高水平的DHA+EPA。结果表明,青鱼3个群体的蛋白质含量均较高,氨基酸组成合理,富含多种不饱和脂肪酸,均具有较高的营养价值,其中邗江群体营养价值最高,可作为青鱼良种选育的主要对象。

青鱼生长相关SNP标记在不同地理群体中的验证

单核苷酸多态性分子标记(single nucleotide polymorphism,SNP)是目前常用的分子标记辅助育种的工具之一。本研究在前期构建的青鱼(Mylopharyngodon piceus)高密度连锁图谱和QTL定位结果的基础上,利用体质量QTL区间中的2个SNP标记在3个青鱼群体中进行验证,目的是为了检测通过QTL定位得到的SNP是否存在并能应用于其他地理群体,利用对分子标记的侧翼序列进行基因型组成分析、遗传多样性分析及中性检验等方法,对3个群体的2个SNP侧翼序列进行分析。遗传多样性结果显示,snp8107的扩展片段的单倍型多样性(H)在邗江群体、湘江群体和石首群体中分别为0.782、0.515和0.497;各位点的观测杂合度(H)为0.067~0.533,平均为0.239;期望杂合度(H)为0.127~0.506,平均为0.306;多态信息含量(PIC)为0.117~0.374,平均为0.246。中性检验显示3个群体在历史上可能发生过瓶颈效应导致稀有等位基因丢失的现象,结合遗传多样性结果推测,邗江群体在经历瓶颈效应后保留下来的稀有等位基因更多,最终得出结论邗江群体是适合进行遗传改良的最优群体。