翅果油树叶绿体基因组密码子偏好性分析

为明确翅果油树叶绿体基因组密码子使用偏好性,从Gen Bank数据库下载翅果油树叶绿体基因组序列,筛选出合适长度的序列并进行密码子使用偏好及其影响因素分析;使用Codon W软件分析序列得出A_(3)、T_(3)、C_(3)、G_(3)、GC_(3)、有效密码子数(ENC)、相对同义密码子使用度(RSCU)等重要参数,并进行相关指数分析、中性绘图分析、ENC-plot绘图分析、PR2-plot分析及最优密码子的确定。结果表明,翅果油树叶绿体基因组密码子不同位点上GC含量分布差异较大,其大小表现为GC_(1)(41.08%)>GC_(2)(38.17%)>GC_(3)(36.55%);ENC平均值为50.95,表明密码子使用偏好性较弱;密码子偏好使用A或U结尾,最终选出的20个最优密码子也均以A或U结尾。中性绘图和ENC-plot绘图分析发现,翅果油树叶绿体基因组密码子内部碱基组成之间不具有显著相关性,选择压力远胜于突变压力;PR2-plot绘图分析表明,在突变压力之外翅果油树叶绿体基因组密码子使用还受到了强烈外界压力的影响,自然选择是影响翅果油树叶绿体基因组密码子使用模式的最主要因素。

15种植物δ8-FAD2基因密码子使用模式比较

为明确草本油料、木本油料与非油料作物内δ8-FAD2基因密码子的使用偏好性及其影响因素的差异,为进一步通过基因调控改良油料作物品质提供研究基础,从GenBank数据库选取15种不同类型植物的δ8-FAD2完整基因序列,对其密码子使用偏好性进行分析;并使用CodonW软件分析序列,得出A3、T3、C3、G3、GC3、有效密码子数(ENC)、相对同义密码子使用度(RSCU)等重要参数;通过相关指数分析、多种参照体系的最优密码子确定、ENC-plot绘图分析、PR2-plot分析及系统关系分析对比15种植物的基因序列。结果表明,15种植物δ8-FAD2基因密码子使用偏好性均较弱且偏好使用A或T结尾;δ8-FAD2基因共有17个优势密码子,最优密码子多达21个;不同植物δ8-FAD2基因的最优密码子有所差异。通过ENC-plot和PR2-plot分析得出,油料作物的δ8-FAD2基因密码子使用偏好性要强于非油料作物,木本植物间其密码子偏好性的受压力情况基本类似,而草本植物间各不相同。分别基于RSCU值和完整基因序列进行聚类分析,发现物种间的亲缘关系并不是密码子使用偏好性的决定性因素。

折叶形自吸式气体分散器在中心龙卷流型搅拌反应器中的性能研究

介绍了一种新型、节能的用于自吸式中心龙卷流型搅拌反应器的折叶形气体分散器。借助CFD仿真模拟技术,对叶片竖直段高度分别为10、15、20mm的折叶形气体分散器和普通气体分散器进行液相单相流模拟。分析得出,安装有竖直边高度为10mm折叶形气体分散器的中心龙卷流型组合反应器有较好的气体分散性能和搅拌混合性能;15mm折叶形气体分散器可以避免搅拌死角的出现。