Tamura模型下DNA序列点突变熵性质的研究

【目的】研究在较复杂的核苷酸替换模型,即Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸频率随世代变化的规律,以得到序列熵的性质,为了解生物进化机理奠定基础。【方法】在Shannon信息熵理论基础上,利用La-grange乘数法进行理论证明,并用Mathematica软件模拟了Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸组成的变化规律和序列熵的变化过程。【结果】DNA序列在Tamura模型下发生突变,各核苷酸频率随世代变化逐渐趋于平衡,且序列熵趋于最大值。【结论】核苷酸突变具有保熵性,验证了前人生物是朝着多样性增大的方向发展进化的结论。

基于系统药理学研究香附治疗原发性痛经的作用机制

目的:探讨香附治疗原发性痛经的作用机制。方法:通过系统药理学研究平台(TCMSP)挖掘香附治疗原发性痛经的潜在活性分子及相应的靶点,并利用Uniprot、DAVID等数据库筛选与原发性痛经相关的治疗靶点,将其映射到KEGG数据库,分析其潜在的作用机制。结果:应用系统药理学方法从香附中筛选出14种候选活性分子及83种与原发性痛经发生、发展密切相关的靶点蛋白。利用Cytoscape软件构建香附的活性分子—靶点网络,其中节点数97个,药物分子与靶点的相互作用关系187条;从KEGG数据库中获得的与原发性痛经相关的通路有24条,其中大部分靶点蛋白集中分布在VEGF信号通路、HIF-1信号通路、Toll样受体信号通路。结论:香附以多分子、多靶点、多通路的方式治疗原发性痛经,靶点蛋白映射的多条通路主要涉及调节原发性痛经患者体内炎症因子、前列腺素合成、新生血管的形成等过程。

应用系统药理学探讨穿龙汤治疗风湿性关节炎的多层次作用机制

目的研究极具地域特色的秦岭七药之穿山龙为主组成的穿龙汤复方对风湿性关节炎的疗效及其作用机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)筛选穿龙汤各味草药中候选活性成分。利用系统打靶(SysDT)和加权系综相似度算法(WES)鉴定各味中药的靶点,并构建分子-靶标网络。进一步,整合网络分析和功能富集分析工具揭示这些潜在药理学靶点所涉及的生物过程和通路。选取穿龙汤中的主要活性成分β-谷甾醇进行小鼠体内实验验证,采用完全弗氏佐剂(0.02 m L/只)进行慢性炎症模型构建。随机将Balb/c小鼠分为正常组、模型组、β-谷甾醇组(35 mg/kg)、地塞米松组(15 mg/kg),每组6只,连续灌胃给药7 d。利用HE染色观察各组滑膜炎性程度变化;RT-PCR方法检测小鼠踝关节肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6) m RNA的表达。结果筛选出穿龙汤中候选活性成分27个和药理学靶点148个。整合网络分析和富集分析结果显示,穿龙汤中的主要活性成分薯蓣皂苷类、β-谷甾醇、川牛膝甾酮类、忍冬苷、金粉蕨素等可通过调节PI3K-AKT通路、TNF通路、Toll样受体通路等达到调节骨细胞增殖与凋亡、抗炎和免疫抑制等作用,从而达到治疗风湿性关节炎的效果。验证结果显示,模型组滑膜层增厚,炎性浸润增加,予以β-谷甾醇及地塞米松治疗后,小鼠滑膜炎性程度有明显改善,且TNF-α、IL-6的水平较模型组降低(P <0.05)。这与系统药理学预测结果基本一致,表明系统药理学预测结果具有较高的准确度。结论穿龙汤复方中不同草药在风湿性关节炎治疗的作用机制上各有侧重,尤其是与TNF-α和Toll样受体信号通路有关。