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固本解毒方调控肺腺癌免疫微环境的分子机制研究及实验验证
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作者 郭宵飞 张平 +7 位作者 白建琦 杨晨 李静静 欧阳琴 邓晓曦 郭家敏 朱冬菊 王源 《世界中医药》 CAS 2023年第20期2865-2871,2877,共8页
目的:通过网络药理学探究固本解毒方干预肺腺癌免疫微环境的作用机制,并通过动物实验验证。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库筛选出固本解毒方的候选化学成分及其相关靶点,利用疾病靶点数据库获取肺腺癌及肿瘤... 目的:通过网络药理学探究固本解毒方干预肺腺癌免疫微环境的作用机制,并通过动物实验验证。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)等数据库筛选出固本解毒方的候选化学成分及其相关靶点,利用疾病靶点数据库获取肺腺癌及肿瘤免疫微环境的相关靶点,取交集后获得潜在作用靶点;运用蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析数据库(STRING)建立PPI网络,以Cytoscape软件构建“中药-活性成分-靶点”网络图。最后,通过分子对接及动物实验进行结果验证。结果:共获得固本解毒方的候选活性成分251种,潜在作用靶点217个;中药的核心有效成分包括槲皮素(Quercetin)、β-谷甾醇(Beta-sitosterol)等,关键潜在作用靶点为促分裂原活化的蛋白激酶1(MAPK1)、促分裂原活化的蛋白激酶3(MAPK3)、信号转导及转录激活因子3(STAT3)、促分裂原活化的蛋白激酶14(MAPK14);所涉及的主要信号通路主要包括磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-AKT)、促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)等信号通路;分子对接结果显示Beta-sitosterol与各核心潜在作用靶点均有良好结合活性;动物实验证明,固本解毒方能有效抑制STAT3、MAPK1、MAPK3蛋白的表达,激活MAPK14蛋白的表达。结论:固本解毒方可能是通过激活或抑制MAPK14、STAT3、MAPK1、MAPK3等核心潜在作用靶点的表达,调控PI3K-AKT、MAPK等多条信号通路,从而干预肺腺癌免疫微环境。 展开更多
关键词 固本解毒方 肺腺癌 免疫微环境 网络药理学 分子对接 实验验证 靶点 拓扑分析
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基于数据挖掘分析朴炳奎教授调理胃癌术后康复的用药规律
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作者 李静静 郭宵飞 +4 位作者 张静茹 杨晨 白建琦 张平 朴炳奎 《中国中医基础医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1705-1709,共5页
目的探讨朴炳奎教授调理胃癌术后康复的用药规律。方法收集2018年10月至2021年10月朴炳奎名老中医传承工作室调理胃癌术后康复患者的处方240首。基于古今医案云平台、SPSS Modlder 18.0与SPSS Statistics 25.0,对朴炳奎教授调理胃癌术... 目的探讨朴炳奎教授调理胃癌术后康复的用药规律。方法收集2018年10月至2021年10月朴炳奎名老中医传承工作室调理胃癌术后康复患者的处方240首。基于古今医案云平台、SPSS Modlder 18.0与SPSS Statistics 25.0,对朴炳奎教授调理胃癌术后康复方药的药物种类、用药频次、性味归经、功效及核心处方进行分析。结果共纳入240首处方,涉及药物125种,用药总频次4980次,其中使用频次超过120次的药物有17种。药性以温、平为主,药味多属甘、辛、苦,主归脾、肺、胃经,药效以理气宽中、清热解毒为主。复杂网络分析后得到核心处方,包括麸炒白术、枳壳、黄芪、益智仁、山药、太子参、陈皮、焦山楂、焦六神曲、焦麦芽、土茯苓、生薏苡仁、半枝莲、炙甘草等14味药物。聚类分析后得到5个中药聚类组。结论全国名老中医朴炳奎教授调理胃癌术后康复的用药规律为审证求因,从脾肺论;从脾肺治,固本解毒;温清消补,以平为期;谨守病证,据证用药。 展开更多
关键词 数据挖掘 古今医案云平台 胃癌 用药规律 朴炳奎
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小细胞肺癌潜在相关基因的生物信息学分析及功能预测
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作者 杨梦霞 郭宵飞 +2 位作者 朱世杰 芦殿荣 王宁军 《河北医药》 CAS 2023年第2期165-169,共5页
目的 对小细胞肺癌发生发展的关键基因和分子机制进行生物信息学分析,为诊疗提供潜在靶点和生物标志物。方法 从GEO数据库筛选小细胞肺癌基因表达数据集,并运用GEO_(2)R分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库对DEG进行富集分析,并构... 目的 对小细胞肺癌发生发展的关键基因和分子机制进行生物信息学分析,为诊疗提供潜在靶点和生物标志物。方法 从GEO数据库筛选小细胞肺癌基因表达数据集,并运用GEO_(2)R分析差异表达基因(DEG);再利用DAVID数据库对DEG进行富集分析,并构建蛋白互作网络图,进一步筛选出小细胞肺癌关键基因并进行预后分析。结果 筛选出614个DEG,其中上调基因328个、下调基因286个。富集结果显示,DEG的功能主要与微管运动、DNA修复、驱动蛋白复合物及微管结合等有关。根据蛋白互作网络中的节点连接度(Degree≥40),筛选出CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因。预后生存分析发现,关键基因高表达水平与不良预后有关(P均<0.01)。结论 CDK1、BUB1和CCNB2等13个关键基因可能是小细胞肺癌诊疗的潜在靶点和预后标志物。 展开更多
关键词 小细胞肺癌 生物信息学 差异表达基因 关键基因 预后
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膝痹通方治疗膝骨关节炎作用机制的网络药理学研究
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作者 李彦 王向红 +4 位作者 何名江 刘兴兴 赵传伟 郭宵飞 张洪美 《医学综述》 CAS 2023年第4期802-810,共9页
目的探讨膝痹通方中“牛膝-独活-木瓜”治疗膝骨关节炎(KOA)的网络药理学作用机制。方法检索中药系统药理学数据库及分析平台中牛膝、独活、木瓜的主要化学成分,检索时限为2021年1月1日至3月26日。通过Gene Cards、TTD、DRUGBANK和OMIM... 目的探讨膝痹通方中“牛膝-独活-木瓜”治疗膝骨关节炎(KOA)的网络药理学作用机制。方法检索中药系统药理学数据库及分析平台中牛膝、独活、木瓜的主要化学成分,检索时限为2021年1月1日至3月26日。通过Gene Cards、TTD、DRUGBANK和OMIM数据库收集KOA疾病基因。然后将药物与疾病靶点进行映射,获得交集靶点即为“牛膝-独活-木瓜”作用于KOA的预测靶点。通过Cytoscape 3.6.0软件构建药物活性成分-靶点网络模型,选出关键有效成分。利用STRING数据库构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用网络,选出关键蛋白。借助Web Gestalt、Metascape等在线工具对靶标基因进行基因本体和京都基因与基因组百科全书通路富集分析,筛选差异有统计学意义的通路。结果膝痹通方中“牛膝-独活-木瓜”治疗KOA的主要活性成分为檞皮素、汉黄芩素、表儿茶素、β-谷甾醇、山柰酚、二氢欧山芹醇醋酸酯、白桦脂酸等,核心靶点有JUN、肿瘤坏死因子、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤蛋白p53、v-rel网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A、重组人促分裂原活化的蛋白激酶(MAPK)1、白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、Myc原癌基因蛋白、MAPK14等。膝痹通方治疗KOA的生物学通路主要与癌症、代谢、炎症、病毒等通路相关,其中最显著的是癌症信号通路。结论膝痹通方“牛膝-独活-木瓜”能通过多成分、多靶点、多通路起到治疗KOA的作用,为膝痹通方组方治疗KOA提供了有力的证据。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 膝痹通方 牛膝 独活 木瓜 网络药理学
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基于网络药理学与数据挖掘探讨中药调节坏死性凋亡的用药规律
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作者 郭家敏 郭宵飞 +3 位作者 孙诗艺 李静静 邓晓曦 张平 《海南医学院学报》 CAS 2023年第8期594-602,共9页
目的:探究调节坏死性凋亡的中药用药规律。方法:借助GeneCards、DrugBank及TTD等数据库收集与坏死性凋亡发生机理相关的靶点,通过TCMSP数据库筛选与靶点相关的化合物和中药并构建靶点-化合物-中药网络。收集中药性味归经信息,分析用药... 目的:探究调节坏死性凋亡的中药用药规律。方法:借助GeneCards、DrugBank及TTD等数据库收集与坏死性凋亡发生机理相关的靶点,通过TCMSP数据库筛选与靶点相关的化合物和中药并构建靶点-化合物-中药网络。收集中药性味归经信息,分析用药规律。分子对接技术判断网络中核心靶点与化合物作用关系的可信度,并用PyMOL软件展示对接结果较好的组合。结果:与坏死性凋亡发生机理相关的靶点12个,与靶点相关的候选化合物191个,中药366味。其中槲皮素、汉黄芩素、雷公藤甲素、甘草查尔酮、玫瑰树碱等化合物较为重要,可能是调节坏死性凋亡的主要小分子物质基础;较为重要的中药有甘草、连翘、丹参、银杏叶、杜仲等,中药药性以苦、辛为主,药味以寒、温居多,主要归肝、肺二经;BCL2-beta-sitosterol、MAPK14-luteolin、MAPK14-formononetin、TP53-formononetin分子对接结果较佳,对接活性强。结论:本文通过探讨影响坏死性凋亡发生的小分子化合物,归纳中药调节坏死性凋亡的用药规律,为临床研发干预坏死性凋亡制剂提供思路。 展开更多
关键词 坏死性凋亡 网络药理学 用药规律 新药研发
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双孢蘑菇菌种生产规范与技术要点 被引量:6
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作者 周林 郭尚 +4 位作者 萧晋川 赵照林 吴风明 郭宵飞 刘晓钢 《中国林副特产》 2016年第5期40-42,46,共4页
食用菌产业大发展,菌种是非常重要的关键,起着巨大的作用。介绍了双孢蘑菇菌种生产基本流程和操作技术,分析了菌种生产过程中的重点技术特点,推荐了双孢蘑菇菌种生产技术规程,供我国特别是山西的广大双孢蘑菇生产者和菌种生产者以及关... 食用菌产业大发展,菌种是非常重要的关键,起着巨大的作用。介绍了双孢蘑菇菌种生产基本流程和操作技术,分析了菌种生产过程中的重点技术特点,推荐了双孢蘑菇菌种生产技术规程,供我国特别是山西的广大双孢蘑菇生产者和菌种生产者以及关联业务人员参考应用。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 菌种 菌种生产 生产技术规范
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中药调节DNA高甲基化用药规律的网络药理学及数据挖掘研究 被引量:1
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作者 郭宵飞 李智飘 +1 位作者 李静静 张平 《中国中医急症》 2022年第10期1693-1697,共5页
目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先,整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库,从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点,然后利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出类药性≥0.18的靶点,并收集其... 目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先,整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库,从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点,然后利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出类药性≥0.18的靶点,并收集其相关化合物及中药,构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,分析靶点、化合物、中药之间的相关性。另外,匹配中药的性味归经等信息,分析用药规律。最后,将网络中核心靶点与化合物进行分子对接,以验证预测结果及进一步挖掘潜在的化合物靶点组合。结果 共得到189个可作用于DNA高甲基化的靶点,其中有35个靶点可匹配到候选化合物且类药性≥0.18,匹配到1 188个候选化合物,共408味中药。频数统计结果显示,干预DNA高甲基化的中药药味以苦、辛、甘为主,药性以温居多,主要归肝、肺二经。结论 本研究通过系统探讨中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律,可为中药去甲基化的理论研究及临床应用提供新思路。 展开更多
关键词 DNA 高甲基化 中药 网络药理学 用药规律 新药研发
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双孢蘑菇菌种质量检验规程
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作者 周林 郭尚 +7 位作者 萧晋川 赵照林 郭宵飞 刘晓钢 南晓洁 李艳婷 江山 张秋虎 《中国林副特产》 2016年第6期37-41,共5页
食用菌菌种是食用菌生产的基础,起着非常重要的巨大的作用。双孢蘑菇菌种作为食用菌生产资料进入商业活动中,具有商品的属性。介绍了双孢蘑菇菌种商品质量的检验内容和要求,分析了菌种质量检验中的重点操作规范,提出了双孢蘑菇菌种商品... 食用菌菌种是食用菌生产的基础,起着非常重要的巨大的作用。双孢蘑菇菌种作为食用菌生产资料进入商业活动中,具有商品的属性。介绍了双孢蘑菇菌种商品质量的检验内容和要求,分析了菌种质量检验中的重点操作规范,提出了双孢蘑菇菌种商品质量检验规程,作为山西省地方标准推荐,供山西的广大双孢蘑菇生产者和菌种生产者以及关联业务人员参考应用。 展开更多
关键词 双孢蘑菇 菌种商品 质量检验
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张洪美应用补肾除湿方治疗早期膝骨关节炎经验 被引量:5
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作者 李彦 荆琳 +6 位作者 何名江 闫奇 王立锁 刘兴兴 赵传伟 郭宵飞 张洪美 《中医药导报》 2022年第2期188-192,共5页
总结张洪美应用补肾除湿方加减治疗早期膝骨关节炎的临床经验。张洪美认为早期膝骨关节炎以肾虚湿阻为主要病机,肾虚不主骨则致骨痿,骨痿则筋无以立,肉随之削,随之湿邪外侵、中留、内生均可阻滞人体,气血运行不畅,痹阻经脉,久则内伤于... 总结张洪美应用补肾除湿方加减治疗早期膝骨关节炎的临床经验。张洪美认为早期膝骨关节炎以肾虚湿阻为主要病机,肾虚不主骨则致骨痿,骨痿则筋无以立,肉随之削,随之湿邪外侵、中留、内生均可阻滞人体,气血运行不畅,痹阻经脉,久则内伤于骨形成骨痹,长期可影响心神,故以补肾除湿为治法。张洪美重视“形气神一体同调”,采用补肾除湿方加减治疗早期膝骨关节炎,疗效可靠。 展开更多
关键词 膝骨关节炎 早期 补肾除湿方 肾虚湿阻 形气神 张洪美 名医经验
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阿尔茨海默病嗅觉障碍中药用药规律的网络药理学研究 被引量:1
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作者 李智飘 郭宵飞 +1 位作者 徐国杰 刘缨 《华西药学杂志》 CAS CSCD 2023年第6期628-632,共5页
目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TC... 目的利用网络药理学及数据挖掘方法初步探索中药调节阿尔茨海默病(AD)嗅觉障碍的物质基础及用药规律。方法通过OMIM、GeneCards、CTD等数据库分别获得AD和嗅觉障碍的相关靶点,取两者的交集靶点后,以在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中类药性≥0.18且可匹配到相应的化合物为条件,进一步筛选获得AD嗅觉障碍的潜在作用靶点。应用TCMSP数据库收集潜在作用靶点的相关化合物、中药,在Cytoscape软件中构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络,根据度值大小获得核心潜在作用靶点、核心候选化合物及核心候选中药。将获得的核心候选化合物及核心潜在作用靶点进行分子对接,初步验证预测结果。建立中药数据库,通过数据分析获得AD嗅觉障碍的中药用药规律。结果共获得AD及嗅觉障碍的疾病相关靶点2919、2358个,两者的交集靶点共946个;其中,符合类药性≥0.18且能匹配到相关化合物的靶点共245个,候选化合物1172个,候选中药406味。候选中药的药味以苦、辛、甘为主,药性主要为温,归经以肝、肺二经为要主。结论以网络药理学及数据挖掘的方法,较为系统的探索了中药调节AD嗅觉障碍的物质基础,获得了中药治疗AD嗅觉障碍的用药规律,为该病的治疗提供了理论依据及用药指导。 展开更多
关键词 阿尔茨海默病 嗅觉障碍 网络药理学 数据挖掘 分子对接 用药规律 中药系统药理学数据库分析平台 中药
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